本文關(guān)鍵詞：H3N2亞型流感病毒分離株全基因組序列特征分析及其臨床意義　出處：《上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)》2015年11期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的分析H3N2亞型流感病毒流行株的全基因組序列及其與臨床特征的相關(guān)性。方法檢測2014年12月—2015年3月收集的呼吸道感染患者鼻拭子樣本,對其中H3N2亞型流感病毒株P(guān)CR擴(kuò)增后直接進(jìn)行全基因組測序,分析其核酸序列特征及氨基酸變異情況。結(jié)果與WHO推薦2014—2015流感疫苗株參考病毒株相比,來自不同患者的14個病毒株HA1蛋白抗原決定簇均發(fā)生不同程度突變,抗原決定簇結(jié)構(gòu)改變較明顯的病毒株其宿主具有更高的體溫和更嚴(yán)重的臨床表現(xiàn)。全部14個病毒株發(fā)生HA1蛋白E190D氨基酸突變。6個病毒株NA蛋白出現(xiàn)1個新增糖基化位點(diǎn)。1個病毒株存在導(dǎo)致金剛烷胺耐藥的M2蛋白V27A突變。全部14個病毒株P(guān)B1-F2蛋白發(fā)生I18T突變。結(jié)論 M2蛋白耐藥突變的出現(xiàn)和PB1-F2蛋白氨基酸突變提示分離獲得的H3N2流感病毒株在進(jìn)化過程中曾經(jīng)結(jié)合H1N1亞型流感病毒基因片段。HA1蛋白抗原決定簇突變的增加可能引發(fā)患者更強(qiáng)的免疫反應(yīng)。
[Abstract]:Objective to analyze the whole genome sequence of influenza virus strain H3N2 and its correlation with clinical features. Methods the nasal swabs were detected from December 2014 to March 2015 in patients with respiratory tract infection. Ben. The H3N2 subtype influenza virus strain was amplified by PCR and sequenced directly. The nucleic acid sequence and amino acid variation were analyzed. The results were compared with the reference strain recommended by WHO for influenza vaccine strain 2014-2015. The HA1 protein determinants of 14 virus strains from different patients were mutated to different degrees. The host had higher body temperature and more severe clinical manifestation. All 14 strains had HA1 protein E190D amino acid mutation and 6 virus strains had na eggs. There was a new glycosylation site in white. One virus strain had a M2 protein V27A mutation that led to amantadine resistance. All 14 virus strains had I18T mutation in PB1-F2 protein. The emergence of M2 protein resistance mutation and amino acid mutation of PB1-F2 protein suggest that the isolated H3N2 influenza virus strain has been linked to the H1N1 subtype influenza virus gene fragment. HA1 egg during the evolution of H3N2 influenza virus strain. An increase in mutations in the determinant of white antigen may trigger a stronger immune response in patients.
【作者單位】： 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院感染病與呼吸病研究所臨床病毒研究室;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院呼吸科;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院北院;
【基金】：上海申康前沿技術(shù)聯(lián)合攻關(guān)項目~~
【分類號】：R511.7
【正文快照】： com bined w ith gene fragm ents of influenza virus H1N1 during the course of evolution.T he increase of variationsof the epitope of H A1 protein m ay cause stronger im m une response of patients.流感病毒(influenza virus)自1902年首次分離之后一直是引起人類

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本文編號：1431787