本文關(guān)鍵詞：甘肅省鼠疫菌株差異區(qū)段基因分型及其流行病學特征　出處：《中國地方病防治雜志》2016年08期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的研究甘肅省鼠疫菌差異區(qū)段基因分型及其流行特征。方法根據(jù)鼠疫菌基因組的23個差異區(qū)段(DFR)對202株鼠疫菌進行基因分型,并進行聚類分析。結(jié)果 202株鼠疫菌分為8個基因型,即1b型、5型、7型、8型、13型、26型及新發(fā)現(xiàn)的GS1型和GS2型。9株黃鼠型菌株被分為13型和26型。18株阿爾金型菌株被分為3個型,其中1株為GS2型,6株為8型,11株為1b型。48株祁連型被分為3個型,其中5株為8型,39株為GS1型,4株為GS2型。127株青藏型菌株被分為6個型,其中1株為5型,6株為7型,56株為8型,39株為1b型,20株為GS1型,5株為GS2型。黃鼠型鼠疫菌的主基因型為26型,阿爾金型鼠疫菌的主基因型為1b型,祁連型鼠疫菌的主基因型為GS1型,青藏型鼠疫菌的主基因型為8型。結(jié)論 GS1和GS2為新發(fā)現(xiàn)的2個新基因型。黃鼠型鼠疫菌株同阿爾金型、祁連型和青藏型菌株基因型相似度較小,阿爾金型、祁連型和青藏型基因型相似度較大。
【作者單位】： 甘肅省疾病預防控制中心;
【基金】：國家衛(wèi)生行業(yè)科研專項(201202012) 甘肅省衛(wèi)生行業(yè)計劃項目(gswst09-14) 甘肅省衛(wèi)生行業(yè)管理項目(GWGL2010-33)
【分類號】：R516.8;R181.3
【正文快照】： 差異區(qū)段(DFR)是指在某些菌株基因組中存在,而在另外一些菌株的基因組中缺失的基因簇,DFR的缺失和獲得反應了鼠疫菌在自然界適應性演化的遺傳基礎(chǔ)[1,2]。甘肅省有青藏高原喜馬拉雅旱獺鼠疫自然疫源地和甘寧黃土高原阿拉善黃鼠鼠疫自然疫源地,自20世紀60年代至今,從這些疫源地

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