本文關(guān)鍵詞：基于VP1區(qū)基因序列測(cè)定的腸道病毒分型方法在手足口病病原鑒定中的應(yīng)用

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【摘要】：目的應(yīng)用基于VP1區(qū)基因序列測(cè)定的分子分型方法鑒定手足口病相關(guān)腸道病毒病原型別。方法使用腸道病毒VP1區(qū)種屬特異性,采用逆轉(zhuǎn)錄—聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)方法擴(kuò)增VP1區(qū)基因序列,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列測(cè)定,運(yùn)用Chromas Pro1.7.6、MEGA 5.05等生物信息學(xué)軟件進(jìn)行序列核對(duì)及拼接,將序列提交腸道病毒分型網(wǎng)站(Enterovirus Genotyping Tool 0.5)鑒定型別。結(jié)果 40份其他腸道病毒(非EV-A71、非CVA16)核酸陽(yáng)性的手足口病病例臨床標(biāo)本,先行采用商品化實(shí)時(shí)熒光RT-PCR試劑盒鑒定出31份柯薩奇病毒A組6型(CVA6)、2份柯薩奇病毒A組10型(CVA10);對(duì)其余待鑒定的7份樣本,采用腸道病毒特異性引物進(jìn)行VP1基因序列擴(kuò)增和測(cè)序并分析,鑒定出柯薩奇病毒A組4型(CVA4)4株和A組9型(CVA9)、埃可病毒14(E-14)各1株,另1株為EV-A71。結(jié)論基于VP1區(qū)基因序列測(cè)定的腸道病毒分型方法具有較好的敏感性和簡(jiǎn)便、快速的特點(diǎn),可用于手足口病及其他腸道病毒感染的實(shí)驗(yàn)室診斷和相關(guān)的研究。
【作者單位】： 新疆維吾爾自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腸道病毒 VP基因序列 分型鑒定
【基金】：新疆維吾爾自治區(qū)自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2016D01A063)
【分類(lèi)號(hào)】：R512.5
【正文快照】： 腸道病毒(enterovirus,EV),屬于小核糖核酸(RNA)病毒科腸道病毒屬。腸道病毒感染引起的疾病或臨床表現(xiàn)多樣,包括手足口病、急性呼吸道疾病、無(wú)菌性腦膜炎、腦膜腦炎、心肌炎和急性遲緩性麻痹等[1]。手足口病納入法定報(bào)告?zhèn)魅静∫詠?lái),按照《手足口病預(yù)防控制指南》開(kāi)展的手足口

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本文編號(hào)：1042448