本文關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄組學(xué)和藥物基因組學(xué)在人類復(fù)雜疾病研究中的應(yīng)用，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：近30年來(lái),隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,人民的生活水平和醫(yī)療條件有了很大的改善。從總體上來(lái)看,人民的健康和生活水平明顯提高,人均壽命也在逐年延長(zhǎng)。但研究顯示,我國(guó)人群復(fù)雜疾病的發(fā)病率和死亡率卻逐年上升,發(fā)病年齡也提前。目前針對(duì)人類復(fù)雜疾病缺乏較為系統(tǒng)的研究,對(duì)其發(fā)病機(jī)制、作用機(jī)制和生理過(guò)程也知之甚少。因此,針對(duì)人類復(fù)雜疾病的研究必須引入新的方法和思路,從多種角度進(jìn)行全面而系統(tǒng)的生物學(xué)研究。以此來(lái)了解疾病的發(fā)病機(jī)理、作用機(jī)制和體內(nèi)的多種生理生化反應(yīng)。從而達(dá)到對(duì)疾病的有效預(yù)防、精確診斷,并對(duì)靶向性藥物研發(fā)有一定指導(dǎo)意義。本課題通過(guò)綜合利用生物信息學(xué)的轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù)以及藥物基因組學(xué)的分析方法,從表達(dá)譜、通路、轉(zhuǎn)錄因子和基因多態(tài)性等方面探討了患病人群與正常人群的差異。轉(zhuǎn)錄組學(xué)被廣泛應(yīng)用在癌癥、心血管疾病等多種疾病的研究中。本研究從美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)篩選了乳腺癌和前列腺癌的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集。利用生物信息學(xué)方法從基因表達(dá)水平、生物過(guò)程富集通路、蛋白-蛋白相互作用、轉(zhuǎn)錄因子等方面系統(tǒng)分析了疾病與正常之間和不同疾病之間的差異性。本研究揭示了乳腺癌和前列腺癌基質(zhì)基因組異質(zhì)性以及轉(zhuǎn)錄因子的差異性,。本研究基于基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)的方法針對(duì)乳腺癌和前列腺癌基質(zhì)相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較基因組學(xué)研究。在乳腺癌間質(zhì)中發(fā)現(xiàn)8條上調(diào)通路和73條下調(diào)通路,而在前列腺癌間質(zhì)中發(fā)現(xiàn)32條上調(diào)通路和18條下調(diào)通路。且在乳腺癌和前列腺癌基質(zhì)中分別發(fā)現(xiàn)了3337和2145個(gè)顯著性調(diào)控基因,也分別發(fā)現(xiàn)了360和342顯著性調(diào)控的TFs。本研究分別比較了乳腺癌和前列腺癌基質(zhì)中上調(diào)通路和下調(diào)通路,結(jié)果發(fā)現(xiàn)9條相同的通路,1條上調(diào)通路和8條下調(diào)通路。我們也發(fā)現(xiàn)了組織特異性通路,味覺(jué)傳導(dǎo)和ABC轉(zhuǎn)運(yùn)途徑被發(fā)現(xiàn)在乳腺癌基質(zhì)中是上調(diào)的,而在前列腺癌基質(zhì)中是下調(diào)的。這些研究對(duì)今后的疾病治療和藥物研發(fā)提供了有價(jià)值的信息,以及對(duì)人群的個(gè)體化治療具有指導(dǎo)性意義。此外,基因多態(tài)性與心血管疾病也有著密切的關(guān)系。葉酸、高血脂、高血壓和高同型半胱氨酸是心血管疾病的主要風(fēng)險(xiǎn)因素。本課題利用臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析了同型半胱氨酸代謝通路中關(guān)鍵酶的基因多態(tài)性(亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR) C677T和A1298C,田硫氨酸合成酶(MTR) A2756G和甲硫氨酸合成還原酶(MTRR) A66G)與血漿同型半胱氨酸、血壓和血脂水平在中國(guó)輕中度高血壓人群中相關(guān)性。發(fā)現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)基因的累積效應(yīng)和葉酸缺乏顯著增加血漿同型半胱氨酸水平,同時(shí)也增加血脂異常的患病率。此外,亞甲基四氫葉酸還原酶基因多態(tài)性和同型半胱氨酸的交互作用顯著增加人群的基線血壓。該研究揭示了這些基因多態(tài)性與心血管疾病的風(fēng)險(xiǎn)因子有著顯著相關(guān)性,對(duì)今后的個(gè)體化醫(yī)療、疾病預(yù)測(cè)和藥物研發(fā)有重要意義。綜合運(yùn)用生物信息學(xué)和藥物基因組學(xué)研究人類疾病可以對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、分子靶向治療提供有價(jià)值的信息,并能極大促進(jìn)生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展,對(duì)人類來(lái)說(shuō)是最大的受益。
【關(guān)鍵詞】：乳腺癌 前列腺癌 血脂 葉酸 同型半胱氨酸 基因多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：安徽大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R3416
【目錄】：

• 中文摘要3-5
• ABSTRACT5-9
• 英文縮略詞表9-10
• 前言10-12
• 第一部分 比較轉(zhuǎn)錄組分析揭示乳腺癌和前列腺癌的基質(zhì)基因組異質(zhì)性12-21
• 1.1 引言12-14
• 1.2 材料與方法14-15
• 1.2.1 微陣列數(shù)據(jù)的收集和整理14
• 1.2.2 基因集富集分析14-15
• 1.2.3 共調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄因子及轉(zhuǎn)錄元件分析15
• 1.3 結(jié)果15-19
• 1.3.1 在多重通路水平來(lái)研究基質(zhì)基因組的異質(zhì)性15-18
• 1.3.2 在靶基因和轉(zhuǎn)錄因子水平來(lái)研究基質(zhì)基因組的異質(zhì)性18-19
• 1.4 討論19-21
• 第二部分 基因多態(tài)性與心血管疾病風(fēng)險(xiǎn)因子的關(guān)聯(lián)性研究21-47
• 2.1 引言21-24
• 2.2 同型半胱氨酸代謝酶基因多態(tài)性和葉酸與血脂異常的關(guān)聯(lián)性研究24-35
• 2.2.1 材料與方法24-25
• 2.2.2 結(jié)果25-33
• 2.2.3 討論33-35
• 2.3 葉酸缺乏癥和風(fēng)險(xiǎn)基因交互作用顯著增加高同型半胱氨酸血癥風(fēng)險(xiǎn)35-43
• 2.3.1 材料與方法35
• 2.3.2 結(jié)果35-42
• 2.3.3 討論42-43
• 2.4 亞甲基四氫葉酸還原酶基因突變和同型半胱氨酸與基線血壓的相關(guān)性43-47
• 2.4.1 材料與方法43
• 2.4.2 結(jié)果43-46
• 2.4.3 討論46-47
• 全文總結(jié)47-49
• 參考文獻(xiàn)49-58
• 致謝58-60
• 發(fā)表文章60

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條

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  本文關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)錄組學(xué)和藥物基因組學(xué)在人類復(fù)雜疾病研究中的應(yīng)用，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：415436