人ndrg家族成員cDNA的克
發(fā)布時(shí)間:2020-06-18 02:05
【摘要】: 人ndrg2基因(N-myc downstream-regulated gene 2)是本課題組于2000年從正常成人全腦cDNA文庫中發(fā)現(xiàn)和獲得的新序列。其全長為2,024bp,經(jīng)BLAST相似性分析證明所得序列為一新基因(GenBank檢索號:AF159092)。ndrg2基因含有16個(gè)外顯子和15個(gè)內(nèi)含子,定位于染色體14q11.2,編碼一個(gè)含有357個(gè)氨基酸殘基、分子量約為40kDa的蛋白質(zhì)。初步研究顯示,該基因可表達(dá)于多種組織中,并且是正常腦組織和膠質(zhì)瘤的差異表達(dá)基 第四軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文 因。目前己報(bào)道該家族共有四個(gè)成員:ndrgl、ndrgZ、ndrg3禾 ndrg4,其 中nd侶4又分為三個(gè)亞型:叫*個(gè)B、n巾葉莊“『和叩r**H,m家族各成員廠 的氨基酸殘基序列同源性很高,但在各組織間的表達(dá)水平有明顯差異。 己知有多種因素可以影響 ndrg的表達(dá)水平,在施加同型半臍氨酸、致 DNA損傷性物質(zhì)、地衣霉素hunicamycin\應(yīng)激刺激(缺氧、Niy等\抑 癌基因p53等因素的條件下,ndrgl 的表達(dá)上調(diào);而雄激素、N-myc、C-myc 等因素可下調(diào) ndrg 的表達(dá)。己有文獻(xiàn)報(bào)道,在細(xì)胞的增箔分化、細(xì)胞氧化 還原電勢平衡的維持、阻抑腫瘤細(xì)胞擴(kuò)散等過程中,ndrg和 ndrgZ發(fā)揮著重 要作用 [’””]。由于目前對于 ndrg家族的結(jié)構(gòu)和功能性認(rèn)識尚不全面,因此, 克隆和表達(dá)n山g家族各成員并制備相應(yīng)的特異性抗體則成為迫切而重要的 基礎(chǔ)性工作,有利于從總體上研究該家族各成員的生理功能。 根據(jù)上述事實(shí),本實(shí)驗(yàn)按如下方案展廠: 1.ndrg家族成員的cDNA克隆。提取人胎腦組織的總RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄 制備cDNA。依據(jù)GenBanLk登錄的ndrg家族各成員序列分別合成了針對 ndfgl、ndrg3和 ndfg4B的引物,然后進(jìn)行 PCR反應(yīng)以擴(kuò)增 DNA,回收和純 化PCR產(chǎn)物并將其插入到pMD 181載體中進(jìn)行克隆后測序分析,用 BLAST 程序驗(yàn)證測序結(jié)果。 2.ndfg家族成員的原核表達(dá)。將測序下確的片段插入到pRSETA。 pGEX*T、pPpoEX衛(wèi)Tb等表達(dá)載體中,分別用 IPTG誘導(dǎo)表達(dá),發(fā)現(xiàn) pPROEX-HTbndygl所編碼的NDRGI蛋白有高效可溶性表達(dá)。 3.NDRGI 蛋白的二級結(jié)構(gòu)分析。融合表達(dá)的6HIS.NDRGI 蛋白經(jīng) NiNTA偶聯(lián)的瓊脂糖珠純化后,進(jìn)行圓h色性分析。發(fā)現(xiàn)在該分于中,幾 種蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)所占比列如下:。螺旋:23石9入p片層:18石%,轉(zhuǎn)角: 25.7%,無規(guī)則卷曲:32刀%,這與計(jì)算機(jī)程序預(yù)測的結(jié)果相近。 4.抗人 NDRG家族的多克隆抗體制備。用可溶性的 6HIS-NDRG蛋白 4 第四軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文 免疫家兔獲得了高效價(jià)的兔抗人 NDRG多克隆抗血清,利用固定于硝酸纖 維素膜上的NDRGI抗原進(jìn)行親和吸附,以純化抗血清,提高了NDRGI多 克隆抗體的特異性,并用此純化的抗體進(jìn)行了免疫組化和 Western撿測。出 于***G家族各成員間氨基酸組成有很高的同源性,此抗體在識別*D*GI。 NDRGZ、NDRG3和 NDRG4時(shí)存在交叉,表明己獲得抗人NDRG家族的多 蕪隆抗體。 5.抗人NDRG家族寡肽的多克隆抗體制備。山于抗人NDRG家族的多 是隆抗體不能很好地區(qū)分NDRG1、NDRGZ、NDRG3和NDRG4,按各亞型 分于氦基酸殘基序列中特異的肽段合成的寡肽作為半抗原,與KLH偶聯(lián)后 兔疫家兔,以制備特異性的抗寡肽抗體。B前免疫家兔的抗體滴度約為1:3 200,繼續(xù)加強(qiáng)免疫,可望獲得具有高度特異性的抗體,以特異地識別NDRGI。 NDRGZ、NDRG3和 NDRG4各亞型分子。
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍第四軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2003
【分類號】:Q78
【圖文】:
(1)6His.NDRG3和6His.NDR以一B融合蛋白的表達(dá)形式分析6His一DRG3的理論相對分子量約為43.0kDa,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期基本相符(左箭頭所指)。圖5一a中1、2、3三個(gè)泳道分別代表6His入DRG3融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,可見6His一DRG3融合蛋白主要分布在沉淀中,以包涵體的形式存在。6His一NDRG4一B的理論相對分子量約為41.0kDa,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期基本相符(右箭頭所指)。圖5一a中第4、5、6三個(gè)泳道分別代表6His一NDRG4一B融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,可見6His一DR以一B融合蛋白主要分布在沉淀中,以包涵體的形式存在。123CM456一咖一黔黔涵盆鵝翻嘛蕩嘛一少毛、翎畔凈續(xù)一廿獄鮑二妙閱一-笠葉食夔_矍暨圖5一a6His一NDRc3、6nis一NDRe李B的表達(dá)形式分析Fig.5一aSDSPAGEanalysisofexPr
(2)6His.NDRGI融合蛋白的表達(dá)形式分析及純化6His.NDRGI融合蛋白的理論相對分子量為43.0叨a,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期相符(箭頭所指)。圖5一b中第1、2、3三個(gè)泳道分別代表6His.NDRGI融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,見6His.NDRGI融合蛋白在上清和沉淀中均有分布,上清中表達(dá)的可溶性蛋白約占菌體總蛋白的28%?扇苄缘6His-NDRGI融合蛋白可以用來做進(jìn)一步的純化。kDaMC12397.166.243.0纂纂鬢撮黔瞥緲壑肇一31.0黔鸚;粵考撇瞬·、嵌片兮州矽一悶曰門..口...悶.‘....腳...一.,........圖5一b6His一NDRGI的可溶性表達(dá)Fig.5-bSDS一PAGEanalysisofexPressionandsolubilityof6His一NDRGIfusionprotein.M:Proteinmarker:C:PPROEX一HTbinDHSQindueedbyIPTGinLBmedia:l:PRoEX一HTb一nd飛1inDHSQindueedbyIPTG:2:suPernatantofbacteriallysatecontaining6His一DRGIfusionProtein):3:PreeiPitateofbacteriallysate(eontainingH15一DRG1fusionProtein);表達(dá)的6His.NDRGI融合蛋白質(zhì)經(jīng)Ni一TA偶聯(lián)的瓊脂糖珠親和純化;在咪哇濃度為200nuno比和250~。比的洗脫液中得到較高純度蛋白質(zhì)。
本文編號:2718521
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍第四軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2003
【分類號】:Q78
【圖文】:
(1)6His.NDRG3和6His.NDR以一B融合蛋白的表達(dá)形式分析6His一DRG3的理論相對分子量約為43.0kDa,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期基本相符(左箭頭所指)。圖5一a中1、2、3三個(gè)泳道分別代表6His入DRG3融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,可見6His一DRG3融合蛋白主要分布在沉淀中,以包涵體的形式存在。6His一NDRG4一B的理論相對分子量約為41.0kDa,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期基本相符(右箭頭所指)。圖5一a中第4、5、6三個(gè)泳道分別代表6His一NDRG4一B融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,可見6His一DR以一B融合蛋白主要分布在沉淀中,以包涵體的形式存在。123CM456一咖一黔黔涵盆鵝翻嘛蕩嘛一少毛、翎畔凈續(xù)一廿獄鮑二妙閱一-笠葉食夔_矍暨圖5一a6His一NDRc3、6nis一NDRe李B的表達(dá)形式分析Fig.5一aSDSPAGEanalysisofexPr
(2)6His.NDRGI融合蛋白的表達(dá)形式分析及純化6His.NDRGI融合蛋白的理論相對分子量為43.0叨a,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá),獲得的表達(dá)蛋白大小與預(yù)期相符(箭頭所指)。圖5一b中第1、2、3三個(gè)泳道分別代表6His.NDRGI融合蛋白在總蛋白、上清和沉淀中的分布,見6His.NDRGI融合蛋白在上清和沉淀中均有分布,上清中表達(dá)的可溶性蛋白約占菌體總蛋白的28%?扇苄缘6His-NDRGI融合蛋白可以用來做進(jìn)一步的純化。kDaMC12397.166.243.0纂纂鬢撮黔瞥緲壑肇一31.0黔鸚;粵考撇瞬·、嵌片兮州矽一悶曰門..口...悶.‘....腳...一.,........圖5一b6His一NDRGI的可溶性表達(dá)Fig.5-bSDS一PAGEanalysisofexPressionandsolubilityof6His一NDRGIfusionprotein.M:Proteinmarker:C:PPROEX一HTbinDHSQindueedbyIPTGinLBmedia:l:PRoEX一HTb一nd飛1inDHSQindueedbyIPTG:2:suPernatantofbacteriallysatecontaining6His一DRGIfusionProtein):3:PreeiPitateofbacteriallysate(eontainingH15一DRG1fusionProtein);表達(dá)的6His.NDRGI融合蛋白質(zhì)經(jīng)Ni一TA偶聯(lián)的瓊脂糖珠親和純化;在咪哇濃度為200nuno比和250~。比的洗脫液中得到較高純度蛋白質(zhì)。
【參考文獻(xiàn)】
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2 鄧艷春,藥立波,劉新平,聶曉燕,王吉村,張曉光,蘇成芝;人腦內(nèi)一含有ACP樣結(jié)構(gòu)域新基因的發(fā)現(xiàn)[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2001年01期
3 李劍,劉新平,林樹新,鄧艷春,孟慶軍,張文紅,李樹鈞,聶曉燕,藥立波;一種新的抑癌候選基因——NDR2在人類正常組織及相應(yīng)腫瘤中的表達(dá)[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2002年02期
4 高麗華,胡顯文,吳清法,肖成祖,胥照平,張正光;免疫親和層析法純化單鏈尿激酶型纖溶酶原激活劑[J];生物工程學(xué)報(bào);2002年03期
5 何畏,梁志清,吳玉章,史常旭,賈正才,周偉,李玉清;一種精子蛋白嵌合肽的實(shí)驗(yàn)研究[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2002年07期
本文編號:2718521
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