RNA病毒感染組織標(biāo)本保存方法探討
發(fā)布時間:2020-04-29 18:16
【摘要】:目的:探討固定劑、固定時間及溫度對RNA病毒感染組織總RNA的完整性、得率及病毒RNA擴(kuò)增的影響。以及固定劑和固定時間對石蠟包埋組織中RNA降解和標(biāo)本病理形態(tài)學(xué)的影響。 方法:取漢坦病毒76—118株接種乳鼠的感染組織,以沉淀脫水類固定劑100%甲醇、75%乙醇、100%丙酮以及醛類固定劑4%的多聚甲醛磷酸緩沖液(4%PFA)、10%福爾馬林共五種固定劑,分別在4℃和室溫下固定病毒感染組織6h、12h、24h和48h后,對固定后標(biāo)本進(jìn)行如下檢測或處理:1、從固定6h~48h后的標(biāo)本中直接提取組織總RNA,用瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性;以分光光度計(jì)測吸光度計(jì)算組織總RNA得率;用巢式RT—PCR擴(kuò)增病毒RNA序列,電泳檢測PCR產(chǎn)物并行灰度掃描。對RNA得率及PCR產(chǎn)物電泳所測灰度值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。2、將固定后的病毒感染組織標(biāo)本進(jìn)行石蠟包埋長期保存。對石蠟包埋組織切片后HE染色,鏡下觀察各種固定劑對組織病理形態(tài)學(xué)的影響。從長期保存的各種方式固定后石蠟包埋組織中以RT—PCR擴(kuò)增出不同片段長度的病毒RNA及β-actin RNA序列,以獲得產(chǎn)物最大長度或?qū)﹂L片段擴(kuò)增的可重復(fù)性及假陰性的多少,來反映各種固定方式對病毒RNA和細(xì)胞總RNA降解的影響。 結(jié)果:1、病理切片結(jié)果顯示,經(jīng)10%福爾馬林和4%PFA固定的石蠟切片,組織結(jié)構(gòu)完整清晰。其他三種沉淀脫水類固定劑固定后組織有不同程度收縮,但不影響組織病理形態(tài)學(xué)檢測,其中甲醇固定的收縮程度最小。 2、固定標(biāo)本直接提取RNA結(jié)果,(1)RNA完整性:與立即冰凍或新鮮組織比較,100%甲醇固定24h,RNA完整性損傷不明顯;75%乙醇、100%丙酮固定12h后RNA開始出現(xiàn)損傷帶,24h出現(xiàn)明顯的損傷;而10%福爾馬林、4%PFA固定6h就開始出現(xiàn)明顯的損傷,固定24 h幾乎很難看清RNA條帶。(2)RNA得率析因分析結(jié)果顯示,不同固定劑、固定時間、固定溫度下固定的組織中所提RNA的得率有顯著性差異(P<0.01),沉淀類固定劑固定后組織RNA得率明顯高于醛類固定劑(P<0.01); 三種沉淀類固定劑之間差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義伊0.01);4%PFA高于10%福爾馬林 (P0 .01)。固定劑、固定時間和固定溫度之間有顯著性交互作用(P0 .01),4℃甲醇固 定6h的RNA得率最高,10%福爾馬林在室溫下固定48h得率最低。(3)固定后標(biāo) 本巢式RT一PCR,除10%的福爾馬林固定48h后擴(kuò)增結(jié)果不穩(wěn)定外,,其余各固定方式 均能擴(kuò)增出特異性帶。對電泳結(jié)果進(jìn)行灰度掃描時,甲醇、乙醇和丙酮固定的標(biāo)本中 擴(kuò)增的產(chǎn)物電泳條帶更亮,灰度值更高伊0 .01)。 3、從固定后石蠟包埋組織中提取RNA進(jìn)行RT一PCR擴(kuò)增時,擴(kuò)增的效果受固 定劑類型、固定時間及固定過程的溫度的影響,同時也受擴(kuò)增的基因片段長度的影響。 在可達(dá)到固定作用的前提下,同一固定劑固定時間越短,RT一PCR擴(kuò)增結(jié)果越穩(wěn)定。 采用相同的固定時間,從甲醇、乙醇及丙酮等沉淀類固定劑固定石蠟包埋的病毒組織 中擴(kuò)增出病毒RNA的陽性結(jié)果比醛類劑高,重復(fù)性好。尤其在在進(jìn)行長片段擴(kuò)增時, 假陰性現(xiàn)象比醛類固定劑固定的標(biāo)本少。各種沉淀固定劑之間無明顯區(qū)別。 結(jié)論:1、固定劑類型、固定溫度及固定持續(xù)時間的不同對病毒感染組織標(biāo)本的保 存產(chǎn)生明顯的影響。2、甲醇、75%乙醇及丙酮三種沉淀脫水類固定劑固定感染組織 后雖產(chǎn)生一定的收縮效應(yīng),但不影響鏡下形態(tài)學(xué)的觀察。對核酸完整性的保存明顯優(yōu) 于醛類固定劑。與醛類固定劑相比,沉淀類的三種固定劑可保存分子量相對高的RNA。 3、RT一PCR從甲醇、丙酮及70%乙醇固定后保存的石蠟包埋組織中擴(kuò)增效果明顯優(yōu)于 甲醛類固定標(biāo)本。4、在臨床或流行病現(xiàn)場采樣時,可選用沉淀類固定劑,尤其推薦 用甲醇,以替換醛類固定劑。對病毒感染組織固定時間不宜偏長,固定過程的溫度宜 選用4℃。5、在對存檔的石蠟包埋組織作回顧性研究,解釋其PCR陰性結(jié)果時, 必需考慮組織標(biāo)本固定對RNA分子的影響。
【學(xué)位授予單位】:武漢大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2004
【分類號】:R361
本文編號:2644863
【學(xué)位授予單位】:武漢大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2004
【分類號】:R361
【參考文獻(xiàn)】
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