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中國株乙型肝炎病毒D基因型全序列分析;HBV基因型分型方法學(xué)建立及初步應(yīng)用

發(fā)布時間:2020-03-25 01:40
【摘要】: 為了解乙型肝炎病毒(HBV)D基因型在中國的存在狀況及全基因序列特征, 應(yīng)用在聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)擴增HBV前S基因基礎(chǔ)之上的限制性片段長度 多態(tài)性(RFLP)的方法調(diào)查了中國部分地區(qū)HBV基因型分布。認為D基因型毒株 在中國部分地區(qū)并非少見。全基因PCR和克隆后測定并分析了一例HBV D基因型 毒株的全基因,GeneBank Accession Number為AF280817。GeneBank中全部30株 野生型HBV D基因型毒株的種系進化樹提示:本文報告的唯一一株中國D型 AF280817株與瑞典的四株D型進化距離最近;亞洲呈非HBV D基因型分布的優(yōu) 勢地域;認為病毒傳入來源、遷移的不同及病毒在具有不同遺傳和免疫特質(zhì)的宿主 中的長期選擇可能是形成HBV同一基因型病毒株進化距離不同的原因。 本文應(yīng)用DNASIS和CLUSTALW分析軟件將已發(fā)表的223株HBV全序列進 行基因型分型、S基因核苷酸及氨基酸序列對齊比較,分析每一種基因型特有的核 苷酸或氨基酸序列后發(fā)現(xiàn)了每一種基因型特異性的限制性內(nèi)切酶,建立了S基因 PCR-RFLP的基因型分型方法學(xué),,可鑒別A-F基因型。部分不同基因型標本經(jīng)S基 因序列測定證實了此方法的準確性。該方法克服了既往方法學(xué)參考序列少,代表性 略差,圖譜復(fù)雜等缺點,更具簡明、靈敏和特異性,益于HBV基因型的流行病學(xué) 調(diào)查及基因型在HBV感染疾病進程中潛影響的研究。用此方法初步探討HBV基 因型與HBV疾病譜相關(guān)性,對廣東地區(qū)HBV感染者200例,其中無癥狀攜帶者 (AsC)組80例和肝硬化(LC)組120例血清標本分型。結(jié)果表明廣東地區(qū)未發(fā) 現(xiàn)A、E和F基因型,以B和C型為優(yōu)勢基因型,AsC組中以B型為主要基因型 (37/80),同一疾病譜中基因型分布均與e抗原狀態(tài)無顯著性差異(P>0.05);不同 疾病譜的兩組基因型分布有顯著性差異(P<0.01);C型在ASC→LC中呈現(xiàn)增多趨 勢,而B和D型在ASC→LC中呈現(xiàn)減少趨勢,ASC與LC組相比X~2=31.924 P=0.000, 可預(yù)示:可能感染HBV D基因型病情輕,感染HBV C基因型病情易加重。
【學(xué)位授予單位】:第一軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2001
【分類號】:R373.21

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本文編號:2599189

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