【摘要】：采用RNA-seq技術(shù)對志賀菌耐藥性與非編碼RNA之間的關(guān)系進行研究。首先采用梯度劑量的環(huán)丙沙星誘導(dǎo)福氏志賀菌2a標準菌株產(chǎn)生耐藥性而獲得耐藥菌株,然后提取標準菌株與耐藥菌株的總RNA進行RNA-seq分析。結(jié)果顯示,在福氏志賀菌的2個樣品中共發(fā)現(xiàn)100個候選sRNA,并與sRNA的數(shù)據(jù)庫比對得到注釋信息,每個候選sRNA都對應(yīng)著很多個靶標基因,而且靶標基因的表達也有明顯差異。預(yù)測這些sRNA可能會通過調(diào)控耐藥基因和一些與細胞增殖或凋亡相關(guān)的基因發(fā)揮作用,因此還需要挑選合適的候選sRNA并對其用熒光定量PCR實驗進行驗證。

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