LTQ-FT-MS技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)篩選與HBV Polymerase存在潛在相互作用的宿主蛋白
[Abstract]:Hepatitis B virus (Hepatitis B virus,HBV) is a major cause of chronic liver disease, which can lead to hepatitis, cirrhosis, and ultimately liver cancer. Hepatitis B virus polymerase (HBV Polymerase,Pol) plays a key role in the process of HBV replication and may be involved in the development of liver cancer. These physiological functions of Pol may be performed by interaction with proteins. In this paper, immunocoprecipitation (Co-immunoprecipitation) and liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) were used to screen and identify proteins with potential interaction with Pol. The recombinant plasmid of pcDNA3.1-POL-flag was used to transfect HeLa cells. LC-MS/MS technique was used to screen the proteins that could co-precipitate with the fusion flag tagged Pol. A total of 45 proteins were obtained. Eleven of these proteins were reported to interact with Pol. Ingenuity Pathway Analysis (IPAR0) software to further analyze the functions of 45 proteins and Pol and their corresponding cellular networks, and found that these proteins involve three large molecular networks. Four of these proteins may be involved in assisting Pol to perform its physiological functions in the cellular network, and further study of these four proteins will provide clues for the prevention of hepatitis B disease.
【作者單位】: 暨南大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家科技重大專項(xiàng)課題(2012ZX10002006-003)
【分類號(hào)】:R373.21
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):2383222
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