本文關(guān)鍵詞：副溶血弧菌分子分型數(shù)據(jù)庫(kù)建立與分析

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【摘要】：目的對(duì)我國(guó)8個(gè)省(直轄市)分離的副溶血弧菌使用脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)開(kāi)展分子分型工作進(jìn)行回顧性分析;建立副溶血弧菌PFGE分型數(shù)據(jù)庫(kù),分析其特征。方法對(duì)2005 2014年期間分離自8個(gè)省(直轄市)的617株副溶血弧菌使用SfiⅠ酶切后進(jìn)行PFGE實(shí)驗(yàn),使用Bio Numerics 5.01軟件分析菌株的PFGE圖譜并建立副溶血弧菌分子分型數(shù)據(jù)庫(kù)。結(jié)果本研究所建立的副溶血弧菌分子分型數(shù)據(jù)庫(kù)共包含617條副溶血弧菌的分子分型信息。這些副溶血弧菌的PFGE圖譜可以分為360個(gè)PFGE型別,按照Pulse Net China的規(guī)則對(duì)這些PFGE型別進(jìn)行編碼。不同PFGE型別的相似系數(shù)介于35.8%~99.6%。237株外環(huán)境和食品分離菌株有221個(gè)PFGE型別,345株患者分離株有127個(gè)PFGE型別。相同血清型的副溶血弧菌具有相同或者非常相似的PFGE型別,而不同血清型之間的副溶血弧菌的PFGE型別差異則較大。大流行血清型(如O3∶K6和O4∶K8)具有多個(gè)優(yōu)勢(shì)PFGE型別,對(duì)于某些血清型,地理位置相近省份分離菌株的PFGE圖譜相似性更高。結(jié)論分離自患者菌株的PFGE圖譜克隆化程度高,而分離自食品和外環(huán)境的菌株,PFGE圖譜多態(tài)性較大。PFGE在發(fā)現(xiàn)病例成簇中能夠發(fā)揮作用;對(duì)于患者相關(guān)PFGE圖譜成簇的菌株應(yīng)加強(qiáng)流行病學(xué)調(diào)查和溯源工作。
【作者單位】： 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】： 副溶血弧菌 脈沖場(chǎng)凝膠電泳 分子分型數(shù)據(jù)庫(kù) 多樣性 暴發(fā)調(diào)查
【基金】：國(guó)家科技重大專項(xiàng)(No.2012ZX10004215)~~
【分類號(hào)】：R378.3
【正文快照】： 作者單位:中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所,北京102206Corresponding author:PANG Bo,Email:pangbo@icdc.cn新技術(shù)的發(fā)展使得病原體研究實(shí)驗(yàn)室能夠有更多的手段對(duì)病原體進(jìn)行不同層次的分析,以揭示不同病原體之間的關(guān)系,從而為傳染病暴發(fā)的鑒定和追蹤提供可靠的可供參考

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本文編號(hào)：944725