發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒核衣殼蛋白優(yōu)勢(shì)線性B細(xì)胞抗原決定簇的預(yù)測與確定
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【摘要】:為了確定發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)核衣殼蛋白(N蛋白)的優(yōu)勢(shì)線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn),本文根據(jù)線性B細(xì)胞抗原表位擁有較強(qiáng)的抗原性、親水性以及表面性等特點(diǎn),運(yùn)用生物信息學(xué)軟件分析SFTSV N蛋白的氨基酸序列,預(yù)測潛在的線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn)。根據(jù)已解析的SFTSV N蛋白晶體結(jié)構(gòu),使用PyMOL軟件分析預(yù)測出的線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn)的柔性及其在整個(gè)SFTSV N蛋白中的分布情況。人工合成相應(yīng)多肽片段并以其為抗原,與SFTSV臨床感染者的血清反應(yīng),采用多肽-酶聯(lián)免疫吸附檢測法檢驗(yàn)多肽片段的免疫原性。結(jié)果共預(yù)測出六個(gè)可能的線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn),即A(40-KKLKETGGDDWVKDTK-55)、B(71-ASGKMSNSGSKRL-83)、C(94-ERAETRL-100)、D(135-LKVENYPP-142)、E(157-GVSEATT-163)和F(184-KMRGASKTEVYNSFRDP-200),均位于N蛋白表面且含有柔性較大的loop區(qū)。相應(yīng)的六段人工合成多肽都與SFTSV臨床病例血清呈陽性反應(yīng),確定它們均為優(yōu)勢(shì)線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn),其各自檢測結(jié)果與商品化N蛋白抗體檢測試劑盒相應(yīng)檢測結(jié)果進(jìn)行線性回歸分析表明呈正相關(guān)。綜合運(yùn)用上述多種方法,本研究成功地預(yù)測并確定了SFTSV N蛋白的線性B細(xì)胞抗原決定簇位點(diǎn),為該病毒抗原特異性的分子基礎(chǔ)研究以及相關(guān)疾病的診斷和治療奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 浙江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院病毒病研究所;寧波市疾病預(yù)防控制中心病毒研究所;
【關(guān)鍵詞】: 發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒(SFTSV) 核衣殼蛋白(N蛋白) 線性B細(xì)胞抗原決定簇 多肽-酶聯(lián)免疫吸附檢測
【基金】:浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生平臺(tái)重點(diǎn)資助計(jì)劃項(xiàng)目(項(xiàng)目號(hào):2013ZDA006) 浙江省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科技計(jì)劃項(xiàng)目(項(xiàng)目號(hào):2008F3022)
【分類號(hào)】:R373
【正文快照】: 發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒(SFTSV)是布尼亞病毒科白蛉病毒屬的一種新病毒,主要由蜱蟲叮咬傳播。近年來,在遼寧、湖北、山東、河南、江蘇、安徽、浙江等地均出現(xiàn)感染發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒的病例,患者臨床上表現(xiàn)為起熱急、乏力、惡心、嘔吐等癥狀,伴有血小板減少
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):780927
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