本文關(guān)鍵詞：致倦庫蚊幾丁質(zhì)酶家族基因的鑒定與分析

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【摘要】：利用生物信息學(xué)方法鑒定致倦庫蚊23條幾丁質(zhì)酶基因,并對它們進(jìn)行命名、分組,以及基因結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)域、蛋白理化特性和系統(tǒng)發(fā)育分析,隨后使用q PCR方法檢測Cq Cht10在致倦庫蚊生長各時期的相對表達(dá)量。結(jié)果表明,致倦庫蚊幾丁質(zhì)酶基因長度為1 360~19 218 bp,蛋白長度為353~2 681 aa,分子量為39.557~279.503 k D,等電點(diǎn)為4.76~8.69。它們屬于GH18家族,每條幾丁質(zhì)酶包含信號肽區(qū)域、催化結(jié)構(gòu)域、幾丁質(zhì)結(jié)合域和連接區(qū)域,但包含的數(shù)量不同。此外,每條幾丁質(zhì)酶的催化結(jié)構(gòu)域均包含保守序列FDGXDLDWEYP。本研究將致倦庫蚊幾丁質(zhì)酶劃分為12組,組Ⅰ~組Ⅶ沿用早期研究的分組標(biāo)準(zhǔn),此外將組Ⅷ更名為組Ⅸ,再新增4個分組。Cq Cht10的q PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該基因在Ⅱ齡~Ⅳ齡幼蟲期呈高表達(dá),在蛹期和成蟲期呈低表達(dá),而在卵期和Ⅰ齡幼蟲期呈微量表達(dá),此外在雌蚊和雄蚊中無顯著差異表達(dá),提示該基因與致倦庫蚊的蛻皮相關(guān),且與性別關(guān)聯(lián)不大。本研究的分析結(jié)果能夠?yàn)橹戮霂煳脦锥≠|(zhì)酶基因的功能研究提供有價值的信息。
【作者單位】： 貴州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物學(xué)教研室;國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局專利審查協(xié)作北京中心;
【關(guān)鍵詞】： 致倦庫蚊 幾丁質(zhì)酶 CH家族 生物信息學(xué)
【基金】：貴州省科技廳黔科合LH字[2015]7363號 貴州醫(yī)科大學(xué)院基金合同字2013-06基金共同資助
【分類號】：R384.1
【正文快照】： Identification and Analysis of Chitinase Family Genes in Culex quinqu-efasciatusZhao Wenjing1Zhang Jing1Zhang Chunlin1*Wang Jiping1Sun Qian21 Department of Biology,Guiyang Medical University,Guiyang,550004;2 Patent Examination Cooperation Center of the P

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