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大腸桿菌的抗藥性動(dòng)力學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-06-12 14:12

  本文關(guān)鍵詞:大腸桿菌的抗藥性動(dòng)力學(xué)研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:抗生素濫用造成抗藥性水平居高不下,細(xì)菌抗藥性成為全球問(wèn)題。隨著抗性基因的轉(zhuǎn)移,超級(jí)細(xì)菌橫掃全球,造成巨大的損失和恐慌,環(huán)境抗藥性的問(wèn)題受到越來(lái)越多的關(guān)注,對(duì)細(xì)菌抗藥性來(lái)源、動(dòng)力學(xué)過(guò)程和生態(tài)學(xué)規(guī)律的系統(tǒng)研究頗為重要。故本文分別建立了SPF雞體內(nèi)和體外藥物遞增的連續(xù)培養(yǎng)模型,分析主要抗生素抗藥性動(dòng)力學(xué)、抗生素副作用,并根據(jù)當(dāng)前孵化場(chǎng)環(huán)境狀況結(jié)合糞菌移植試驗(yàn),提出降低抗藥性養(yǎng)殖方案。一、體外藥物遞增的連續(xù)培養(yǎng)使MIC正態(tài)再分布。采用96點(diǎn)陣藥敏試驗(yàn)方法,測(cè)定SPF雞和商品雞腸道大腸桿菌對(duì)常用抗生素的MIC,發(fā)現(xiàn)同一雞舍不同雞之間和同一只雞不同菌株間存在明顯離散性,呈現(xiàn)近似正態(tài)分布;選用氨芐西林和丁胺卡那,在體外藥物遞增連續(xù)誘導(dǎo)后,MIC頻率分布的峰值和峰寬都發(fā)生偏移,呈現(xiàn)正態(tài)再分布。二、體內(nèi)藥物遞增的連續(xù)誘導(dǎo)改變SPF雞腸道菌群,MIC峰值右移。選用氨芐西林和硫酸新霉素兩種常用抗生素,以SPF雞為研究對(duì)象,通過(guò)糞樣涂片、Illumina測(cè)序和96點(diǎn)陣藥敏試驗(yàn),觀察經(jīng)抗生素誘導(dǎo)后,腸道菌群的變化。硫酸新霉素對(duì)腸道菌群影響更大,氨芐西林更易誘導(dǎo)高抗菌株。三、抗生素對(duì)SPF雞血液生化和免疫指標(biāo)的影響。以SPF雞為試驗(yàn)對(duì)象,從免疫器官重量和指數(shù)、免疫因子和常規(guī)生化檢測(cè)三個(gè)方面進(jìn)行分析,研究氨芐西林鈉和硫酸新霉素的毒副作用。用藥21天,對(duì)雞的生理和糞便形態(tài)有顯著影響,停藥15天后即使雞的重量以及精神狀態(tài)達(dá)到正常,腎功能和免疫因子指標(biāo)仍然無(wú)法恢復(fù),表現(xiàn)出明顯腎毒性。四、糞菌移植降低抗藥性。通過(guò)采集孵化場(chǎng)內(nèi)雞胚和環(huán)境樣品,分離鑒定可能存在的各種細(xì)菌,進(jìn)行微生物學(xué)背景調(diào)查,發(fā)現(xiàn)大腸桿菌主要的潛在病原菌,而且分離率從高到低依次是,已啄殼弱胚未啄殼弱胚死胚健康胚。說(shuō)明環(huán)境是主要污染源,應(yīng)該在出雛廳隔離消毒,減少其他弱胚死胚對(duì)健康胚的污染。糞菌移植試驗(yàn)表明,用SPF雞糞菌移植來(lái)凈化雛雞病原微生物,可以降低抗藥性,最終提高雞苗競(jìng)爭(zhēng)力。細(xì)菌抗藥性動(dòng)力學(xué)本質(zhì)上是抗藥性基因和抗藥性細(xì)菌富集擴(kuò)散的生態(tài)學(xué)問(wèn)題,各種抗藥性機(jī)制和基因的綜合作用形成抗藥性表型的群體正態(tài)分布,在抗生素脅迫下,呈現(xiàn)不斷的正態(tài)再分布,不同的抗生素的動(dòng)力學(xué)特征存在顯著差異?顾幮曰蜻存在細(xì)菌和菌群及宿主免疫層面的生態(tài)競(jìng)爭(zhēng),糞菌移植是降低抗藥性病原菌豐度的宏觀策略。
【關(guān)鍵詞】:大腸桿菌抗藥性 MIC 正態(tài)分布 腸道菌群 糞菌移植
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R378.21
【目錄】:
  • 摘要7-9
  • Abstract9-11
  • 縮略詞表11-12
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述12-25
  • 1.1 細(xì)菌抗藥性12-19
  • 1.1.1 遺傳學(xué)機(jī)制12
  • 1.1.2 生物化學(xué)機(jī)制12-19
  • 1.2 環(huán)境抗藥性19-21
  • 1.3 抗藥性動(dòng)力學(xué)21-22
  • 1.4 糞菌移植與微生態(tài)體22-23
  • 1.5 肉雞養(yǎng)殖業(yè)現(xiàn)狀及克服抗藥性的措施23-24
  • 1.6 本章研究思路與內(nèi)容24-25
  • 第二章 大腸桿菌群體對(duì)抗生素MIC正態(tài)再分布研究25-36
  • 2.1 試驗(yàn)材料25-26
  • 2.1.1 試劑與培養(yǎng)基25-26
  • 2.1.2 儀器26
  • 2.2 試驗(yàn)方法26-28
  • 2.2.1 采集雞糞26-27
  • 2.2.2 分離、鑒定大腸桿菌27
  • 2.2.3 差異分析設(shè)計(jì)27-28
  • 2.2.4 藥物敏感性試驗(yàn)28
  • 2.3 結(jié)果與分析28-32
  • 2.3.1 SPF雞與商品肉雞大腸桿菌差異28
  • 2.3.2 雞個(gè)體間差異28-29
  • 2.3.3 同一只雞不同菌株差異29
  • 2.3.4 相同菌株的個(gè)體差異29-32
  • 2.3.5 抗生素誘導(dǎo)菌株的MIC分布差異32
  • 2.4 討論與結(jié)論32-36
  • 2.4.1 討論32-34
  • 2.4.2 結(jié)論34-36
  • 第三章 抗生素對(duì)SPF雞腸道菌群的抗藥性動(dòng)力學(xué)36-53
  • 3.1 試驗(yàn)材料36-37
  • 3.1.1 試劑與培養(yǎng)基36
  • 3.1.2 儀器36
  • 3.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物36-37
  • 3.2 試驗(yàn)方法37-39
  • 3.2.1 動(dòng)物分組與管理37
  • 3.2.2 SPF雞糞采集37
  • 3.2.3 SPF雞腸道大腸桿菌分離37
  • 3.2.4 接種物的獲得37
  • 3.2.5 糞便總DNA提取37-38
  • 3.2.6 腸道菌群總DNA質(zhì)量檢測(cè)38
  • 3.2.7 腸道菌群多樣性38
  • 3.2.8 糞樣涂片38-39
  • 3.3 結(jié)果與分析39-45
  • 3.3.1 雞糞形態(tài)記錄39-40
  • 3.3.2 糞樣涂片觀察40-41
  • 3.3.3 基因組DNA質(zhì)量41
  • 3.3.4 優(yōu)化序列41-42
  • 3.3.5 稀釋性曲線(Rarefaction curve)與Shannon-Wiener曲線42-43
  • 3.3.6 多樣性指數(shù)(Alpha-diversity)43
  • 3.3.7 基于UniFrac的Pcoa分析43-44
  • 3.3.8 樣本聚類樹(shù)與柱狀圖組合分析44-45
  • 3.3.9 大腸桿菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果45
  • 3.4 討論與結(jié)論45-53
  • 3.4.1 討論45-46
  • 3.4.2 結(jié)論46-53
  • 第四章 抗生素對(duì)SPF雞血液生化和免疫指標(biāo)的影響53-57
  • 4.1 試驗(yàn)材料53
  • 4.1.1 試劑與培養(yǎng)基53
  • 4.1.2 儀器53
  • 4.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物53
  • 4.2 試驗(yàn)方法53-54
  • 4.2.1 動(dòng)物分組與管理53
  • 4.2.2 免疫器官生產(chǎn)發(fā)育情況的測(cè)定53
  • 4.2.3 IL-2,IL-4,IL-12和INF-γ的檢測(cè)53-54
  • 4.2.4 全血生化檢測(cè)和腎功能檢測(cè)54
  • 4.3 結(jié)果與分析54-55
  • 4.3.1 免疫器官生產(chǎn)發(fā)育情況的測(cè)定54-55
  • 4.3.2 IL-2,IL-12和INF-γ的檢測(cè)55
  • 4.3.3 全血生化檢測(cè)和腎功能檢測(cè)55
  • 4.4 討論與結(jié)論55-57
  • 4.4.1 討論55-56
  • 4.4.2 結(jié)論56-57
  • 第五章 孵化場(chǎng)微生物學(xué)背景與糞菌移植57-68
  • 5.1 試驗(yàn)材料57-58
  • 5.1.1 試劑與培養(yǎng)基57-58
  • 5.1.2 儀器58
  • 5.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物58
  • 5.2 試驗(yàn)方法58-60
  • 5.2.1 細(xì)菌分離58
  • 5.2.2 16S rDNA鑒定菌株58-59
  • 5.2.3 SPF雞糞糞菌移植59
  • 5.2.4 SPF雞糞糞菌移植抗藥表型變化59-60
  • 5.3 結(jié)果與分析60-65
  • 5.3.1 細(xì)菌分離率60-64
  • 5.3.2 16S rDNA分析64
  • 5.3.3 糞菌移植后抗藥表型64-65
  • 5.4 討論與結(jié)論65-68
  • 5.4.1 討論65-66
  • 5.4.2 結(jié)論66-68
  • 全文總結(jié)68-70
  • 參考文獻(xiàn)70-75
  • 致謝75

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