GC夾對三種食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE圖譜的影響
發(fā)布時間:2017-05-31 16:16
本文關鍵詞:GC夾對三種食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE圖譜的影響,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:旨在探討不同的GC夾以及GC夾連接引物的不同位置對3種食源性致病菌的DGGE圖譜結(jié)果的影響,合成6對RNA聚合酶β亞基編碼基因rpo B引物(rpo B 1-6),含3種不同GC夾(GC-1,GC-2,GC-3),且每種GC夾分別連接于正反引物5'端。應用rpo B-PCR-DGGE對副溶血性弧菌(5株),單增李斯特菌(5株)和沙門氏菌(3株)進行分析,并與V3-PCR-DGGE和ERIC-PCR的圖譜及聚類分析結(jié)果進行比較。結(jié)果顯示,GC-3夾連接于反引物上的rpo B-PCR-DGGE分辨效果最好,分辨力指數(shù)達0.9,與ERIC-PCR相同,高于V3-PCR-DGGE。GC夾序列和連接引物位置均對rpo B-PCR-DGGE圖譜結(jié)果產(chǎn)生影響。選擇或設計無連續(xù)鳥嘌呤(G)排列的GC夾序列且將其連接于反引物5'端,均能有效提高rpo B-PCR-DGGE對食源性致病菌檢測與分型的效果。
【作者單位】: 上海海洋大學食品學院;農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品貯藏保鮮質(zhì)量安全風險評估實驗室(上海);上海水產(chǎn)品加工及貯藏工程技術(shù)研究中心;
【關鍵詞】: 副溶血性弧菌 單增李斯特菌 沙門氏菌 GC夾 rpo B-PCR-DGGE
【基金】:國家自然科學基金面上項目(31271870) 上海市科委科技創(chuàng)新行動計劃項目(14DZ1205100,14320502100) 上海市科技興農(nóng)重點攻關項目(滬農(nóng)科攻字2014第3-5號,2005第4-8號) 上海市水產(chǎn)品加工及貯藏工程技術(shù)研究中心(11DZ2280300)
【分類號】:R378
【正文快照】: 3.上海水產(chǎn)品加工及貯藏工程技術(shù)研究中心,上海201306)近年來隨著分子生物學技術(shù)的迅速發(fā)展,出現(xiàn)了一系列的食源性致病菌流行病學調(diào)查方法,如脈沖電場凝膠電泳(PFGE)[1]、擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)[2]、隨機擴增多態(tài)性(RAPD)[3]、重復元素多態(tài)性(REP-PCR)[4],以及多位點序列分
【相似文獻】
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本文編號:410007
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