目的對2014-2018年云南省文山州從手足口病病例中分離的柯薩奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CV-A10)完整VP1區(qū)基因(894 bp)進(jìn)行基因特征分析。方法用486/488和487/489引物擴(kuò)增CV-A10 VP1區(qū)5′端和3′端基因,用Sequencher 4.0軟件對序列進(jìn)行拼接和編輯,得到CV-A10 VP1區(qū)全序,并將測得的序列與NCBI數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行比對,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,進(jìn)行基因特征及分子流行病學(xué)分析。結(jié)果 2014-2018年云南省文山州手足口病實驗室監(jiān)測系統(tǒng)從2 774份標(biāo)本中分離到197株腸道病毒陽性標(biāo)本,病毒分離率為7.10%(197/2 774),其中檢出8株CV-A10�；赩P1分型,8株毒株序列均為基因型C,其中4株為分支1;2株為分支2;2株為分支3。8株毒株VP1序列的核苷酸一致性為93.07%～94.10%,氨基酸一致性為97.74%～98.41%,與原型株Kowalik(基因庫編號:AF081300)的核苷酸一致性為76.01%～76.65%,氨基酸一致性為91.78%～92.26%。結(jié)論 2014-2018年云南省...

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 標(biāo)本來源
    1.2 病毒分離
    1.3 病毒RNA提取
    1.4 RT-PCR和病毒型別鑒定
    1.5 CV-A10病毒VP1區(qū)基因參考序列的選擇
    1.6 病毒遺傳系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
2 結(jié) 果
    2.1 病毒總體分離情況
    2.2 CV-A10分離情況
    2.3 CV-A10文山分離株的基因特征
    2.4 CV-A10各基因型之間的基因差異
    2.5 文山CV-A10 3個分支之間的基因差異及與原型株Kowalik的比較
3 討 論



本文編號：3871043