目的獲得粉塵螨長鏈脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(long-chain fatty acid transport protein,FATP)編碼基因及其分子特征。方法根據(jù)粉塵螨轉(zhuǎn)錄組基因測序結(jié)果,獲得FATP編碼序列片段,據(jù)此設(shè)計引物,用反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)從粉塵螨總RNA中擴(kuò)增全長基因片段,構(gòu)建原核表達(dá)質(zhì)粒pET28a(+)-FATP。成功獲取FATP序列后,利用Expasy、SingaIP 5.0、GOR4和TMpred等軟件進(jìn)行氨基酸序列結(jié)構(gòu)和功能分析,最后利用Clustal Omega及MEGA-X軟件進(jìn)行同源性分析。結(jié)果基因編碼序列全長1 071 bp,編碼的蛋白質(zhì)由356個氨基酸組成,其親水性指數(shù)為-0.39,此蛋白為可溶性蛋白,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,二級結(jié)構(gòu)包括α-螺旋(25.56%)、延伸主鏈(23.04%)和無規(guī)則卷曲(51.40%)。該蛋白存在兩處較明顯的跨膜區(qū)段,由外向內(nèi)的跨膜區(qū)位于1～20位氨基酸,由內(nèi)向外的跨膜區(qū)在100～116位氨基酸。同源氨基酸序列構(gòu)建的分子進(jìn)化樹中發(fā)現(xiàn)與家蠶聚成一簇。結(jié)論獲得了粉塵螨FATP編碼基因全長及其分子特征,為探討粉塵螨生理現(xiàn)象、開發(fā)粉塵螨控制措施奠定基礎(chǔ)...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 粉塵螨總RNA提取
        1.2.2 反轉(zhuǎn)錄
        1.2.3 PCR擴(kuò)增全長目的基因
        1.2.4 克隆質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定測序
    1.3 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 核酸序列克隆測序
    2.2 氨基酸序列推導(dǎo)及功能分析
    2.3 同源性分析及進(jìn)化樹構(gòu)建
3 討論



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