大鼠良性前列腺增生完全去神經(jīng)支配后基因表達譜動態(tài)變化研究
發(fā)布時間:2023-03-04 06:43
目的:探索大鼠BPH組織完全去神經(jīng)支配后進行性萎縮過程中全基因表達譜動態(tài)變化情況。方法:29周齡雄性自發(fā)性高血壓大鼠(SHR,已自發(fā)形成BPH)12只,9只手術(shù)切斷前列腺全部支配神經(jīng)。分別于手術(shù)當天取對照組(C)3只、術(shù)后3 d(D3)、7 d(D7)、11 d(D11)SHR各3只,取前列腺腹側(cè)葉進行組織病理學檢查和RNA提取,所有RNA樣本進行全基因表達譜芯片檢測、實時熒光PCR驗證和生物信息學分析。結(jié)果:完全去神經(jīng)支配后大鼠BPH組織進行性萎縮。各樣本全基因組表達譜芯片檢測均成功完成,隨機選擇的6個差異表達基因的實時熒光PCR結(jié)果證實芯片檢測可靠。分層聚類分析顯示:D3/C表達上調(diào)基因108個,下調(diào)基因175個;D7/C上調(diào)基因462個,下調(diào)基因189個;D11/C上調(diào)基因548個,下調(diào)基因256個。GO功能富集分析顯示各比較組差異表達的基因涉及數(shù)百上千數(shù)量不等的分子功能、生物學進程和細胞組分。Pathway通路富集分析顯示各比較組差異表達的基因涉及數(shù)百條信號通路,其中多條信號通路在各比較組均能富集到且排名靠前,其涉及的基因大部分都表達上調(diào),且大多數(shù)與補體系統(tǒng)激活相關(guān)。結(jié)論:完全...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 手術(shù)操作
1.3 分組、標本收集和處理
1.4 蘇木素-伊紅(HE)染色
1.5 RNA提取
1.6 全基因表達譜芯片檢測及數(shù)據(jù)分析
1.7 生物信息學和統(tǒng)計學分析
1.7.1 分層聚類分析(hierarchical clustering analysis)
1.7.2 基因本體(gene ontology, GO)功能富集分析
1.7.3 pathway通路富集分析
1.8 實時熒光PCR驗證分析
2 結(jié)果
2.1 組織病理學變化
2.2 微陣列檢測結(jié)果及基因組差異表達情況
2.3 GO功能富集分析
2.4 pathway通路富集分析
2.5 實時熒光PCR驗證情況
3 討論
本文編號:3753905
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 手術(shù)操作
1.3 分組、標本收集和處理
1.4 蘇木素-伊紅(HE)染色
1.5 RNA提取
1.6 全基因表達譜芯片檢測及數(shù)據(jù)分析
1.7 生物信息學和統(tǒng)計學分析
1.7.1 分層聚類分析(hierarchical clustering analysis)
1.7.2 基因本體(gene ontology, GO)功能富集分析
1.7.3 pathway通路富集分析
1.8 實時熒光PCR驗證分析
2 結(jié)果
2.1 組織病理學變化
2.2 微陣列檢測結(jié)果及基因組差異表達情況
2.3 GO功能富集分析
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2.5 實時熒光PCR驗證情況
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