分子分型技術(shù)在空腸彎曲菌鑒定中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2022-01-12 19:49
分子分型克服了傳統(tǒng)表型分型方法分辨力、重復(fù)度和重現(xiàn)性低且費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺陷。近年來,一系列空腸彎曲菌的分子分型方法應(yīng)運(yùn)而生。本文對應(yīng)用于空腸彎曲菌的PFGE、RFLP、RAPD、MLST、SNP、flaA-RFLP、PCR-DGGE、PCR-SSCP、核糖體分型等分子分型方法的原理、應(yīng)用及優(yōu)劣勢進(jìn)行了分析比較。
【文章來源】:預(yù)防醫(yī)學(xué)論壇. 2019,25(12)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 基于全基因組的分子分型方法
1.1 脈沖場凝膠電泳(PFGE)
1.2 擴(kuò)增性片段長度多態(tài)性(AFLP)
1.3 隨機(jī)擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(RAPD)
2 基于多基因座的分型方法
2.1 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
2.2 核心基因組多位點(diǎn)序列分型(core-genome MLST,cg-MLST)
2.3 全基因組多位點(diǎn)序列分型(whole-genome MLST,wg-MLST)
2.4 基于基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜((MALDI-TOF-MS)的分型方法
2.5 單核苷酸多態(tài)性(SNP)分型
2.6 基于毒力基因的脂低聚糖基因分型和二進(jìn)制PCR分型(PCR binary typing)
2.7 基于非編碼重復(fù)序列的分型技術(shù)
3 基于單基因座的分型方法
3.1 flaA限制性片段長度多態(tài)性(flaA-RFLP)
3.2 PCR變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)
3.3 基于PCR的單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)
3.4 核糖體分型(Riotyping)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]福氏志賀菌PFGE和MLVA分子分型方法的應(yīng)用與評(píng)價(jià)[J]. 楊勁松,陳愛平,陳建輝,羅朝晨,林杰,鄭恩惠. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]深圳市腹瀉患者、禽源和牛源空腸彎曲菌的脈沖場凝膠電泳分析[J]. 鞠長燕,馬艷萍,張茂俊,胡鵬威,金玉娟,劉楚云,段永翔. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2018(11)
[3]深圳市龍崗區(qū)空腸彎曲菌的流行狀況及分子分型[J]. 金玉娟,洪敏麗,吳潔,陳應(yīng)堅(jiān),楊慧,黃飛雁,劉渠,甘莉萍. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2017(06)
[4]采用FAFLP對屠宰場雞胴體分離的空腸彎曲菌的分子分型和溯源分析[J]. 胡冬梅,王明忠,曲萍,孫雨,董浩,趙柏林,王曉英,孫愛萍. 衛(wèi)生研究. 2017(01)
[5]禽肉流通環(huán)節(jié)空腸彎曲菌污染及嬰幼兒感染的研究[J]. 賴植發(fā),司徒潮滿,侯紅斌,石向輝,曾華書,張勇,陳潤莉. 中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2014(04)
博士論文
[1]上海市部分醫(yī)院致瀉性大腸桿菌和彎曲菌臨床分離株的耐藥性與分子分型[D]. 潘海建.上海交通大學(xué) 2016
碩士論文
[1]白假絲酵母菌的耐藥分析及其與抗氰呼吸的相關(guān)性研究[D]. 張曉梅.蘭州大學(xué) 2010
本文編號(hào):3585361
【文章來源】:預(yù)防醫(yī)學(xué)論壇. 2019,25(12)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 基于全基因組的分子分型方法
1.1 脈沖場凝膠電泳(PFGE)
1.2 擴(kuò)增性片段長度多態(tài)性(AFLP)
1.3 隨機(jī)擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(RAPD)
2 基于多基因座的分型方法
2.1 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
2.2 核心基因組多位點(diǎn)序列分型(core-genome MLST,cg-MLST)
2.3 全基因組多位點(diǎn)序列分型(whole-genome MLST,wg-MLST)
2.4 基于基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜((MALDI-TOF-MS)的分型方法
2.5 單核苷酸多態(tài)性(SNP)分型
2.6 基于毒力基因的脂低聚糖基因分型和二進(jìn)制PCR分型(PCR binary typing)
2.7 基于非編碼重復(fù)序列的分型技術(shù)
3 基于單基因座的分型方法
3.1 flaA限制性片段長度多態(tài)性(flaA-RFLP)
3.2 PCR變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)
3.3 基于PCR的單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)
3.4 核糖體分型(Riotyping)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]福氏志賀菌PFGE和MLVA分子分型方法的應(yīng)用與評(píng)價(jià)[J]. 楊勁松,陳愛平,陳建輝,羅朝晨,林杰,鄭恩惠. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]深圳市腹瀉患者、禽源和牛源空腸彎曲菌的脈沖場凝膠電泳分析[J]. 鞠長燕,馬艷萍,張茂俊,胡鵬威,金玉娟,劉楚云,段永翔. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2018(11)
[3]深圳市龍崗區(qū)空腸彎曲菌的流行狀況及分子分型[J]. 金玉娟,洪敏麗,吳潔,陳應(yīng)堅(jiān),楊慧,黃飛雁,劉渠,甘莉萍. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2017(06)
[4]采用FAFLP對屠宰場雞胴體分離的空腸彎曲菌的分子分型和溯源分析[J]. 胡冬梅,王明忠,曲萍,孫雨,董浩,趙柏林,王曉英,孫愛萍. 衛(wèi)生研究. 2017(01)
[5]禽肉流通環(huán)節(jié)空腸彎曲菌污染及嬰幼兒感染的研究[J]. 賴植發(fā),司徒潮滿,侯紅斌,石向輝,曾華書,張勇,陳潤莉. 中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2014(04)
博士論文
[1]上海市部分醫(yī)院致瀉性大腸桿菌和彎曲菌臨床分離株的耐藥性與分子分型[D]. 潘海建.上海交通大學(xué) 2016
碩士論文
[1]白假絲酵母菌的耐藥分析及其與抗氰呼吸的相關(guān)性研究[D]. 張曉梅.蘭州大學(xué) 2010
本文編號(hào):3585361
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