蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)一蛋白質(zhì)相互作用與細(xì)胞過(guò)程等多種生物學(xué)行為中起重要調(diào)節(jié)作用,此外,翻譯后修飾與許多疾病如癌癥、糖尿病等相關(guān),因此翻譯后修飾位點(diǎn)預(yù)測(cè)對(duì)于了解生命過(guò)程與疾病的預(yù)防治療等有重大意義。絲氨酸和蘇氨酸上的翻譯后修飾類型主要包括磷酸化、O-糖基化與乙酰化。實(shí)驗(yàn)技術(shù)的不斷發(fā)展,積累了大量的翻譯后修飾位點(diǎn)數(shù)據(jù)。由于實(shí)驗(yàn)方法成本高,且受環(huán)境條件限制,因此促進(jìn)了計(jì)算方法的不斷發(fā)展。目前已有的計(jì)算方法大部分通過(guò)蛋白質(zhì)的局部序列信息進(jìn)行模型訓(xùn)練,且只能對(duì)一種翻譯后修飾進(jìn)行預(yù)測(cè)�，F(xiàn)研究表明in situ PTM可以反映不同翻譯后修飾間潛在功能聯(lián)系,因此如將其應(yīng)用于翻譯后修飾預(yù)測(cè)研究,可有效提升翻譯后修飾位點(diǎn)預(yù)測(cè)能力。本文提出了表征in situ PTM信息的位點(diǎn)-修飾網(wǎng)絡(luò)（site-modification network, SMNet）,之后利用SMNet網(wǎng)絡(luò)特征進(jìn)行絲氨酸和蘇氨酸上翻譯后修飾位點(diǎn)預(yù)測(cè)。具體研究?jī)?nèi)容如下：首先,本文從多種翻譯后修飾數(shù)據(jù)庫(kù)中收集人類翻譯后修飾數(shù)據(jù),從中提取in situ PTM信息,并利用該信息構(gòu)建SMNet網(wǎng)絡(luò)。之后將SMNet網(wǎng)絡(luò)特征與蛋白質(zhì)序列特征整... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．２中可看出，ＳｙｓＰＴＭ在線網(wǎng)站包含搜索（Ｓｅａｒｃｈ）、瀏覽（Ｂｒｏｗｓｅ）、統(tǒng)??


本文編號(hào)：3583078