基孔肯雅病毒nsP1蛋白棕櫚;难芯
發(fā)布時(shí)間:2021-09-01 10:06
棕櫚;堑鞍踪|(zhì)翻譯后脂類修飾的重要形式,通過(guò)調(diào)控蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)、穩(wěn)定性和定位來(lái)影響蛋白的功能,S棕櫚;且环N較常見(jiàn)的棕櫚酰化形式;卓涎挪《緦儆谂げ《究萍撞《緦,是一種單股正鏈RNA病毒。本論文中我們利用蛋白棕櫚;A(yù)測(cè)軟件對(duì)基孔肯雅病毒nsP1的S棕櫚;稽c(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)其S棕櫚;稽c(diǎn)位于C417-419。我們分別構(gòu)建了這一區(qū)域的單點(diǎn)突變和三點(diǎn)突變的質(zhì)粒,通過(guò)棕櫚;瘜(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)這三個(gè)位點(diǎn)是nsP1蛋白S棕櫚;年P(guān)鍵位點(diǎn)。已有研究表明,脂肪酸合成酶抑制劑能抑制基孔肯雅病毒復(fù)制,但其機(jī)制還不清楚。我們發(fā)現(xiàn)脂肪酸合成酶的重要產(chǎn)物——棕櫚酸能夠拯救脂肪酸合成酶抑制劑對(duì)病毒復(fù)制的抑制作用,該結(jié)果暗示,脂肪酸合成酶抑制劑對(duì)病毒的抑制可能是因?yàn)閚sP1蛋白的S棕櫚酰化受到影響。蛋白的S棕櫚;饕怯删哂袖\指D-H-H-C結(jié)構(gòu)域的棕櫚;D(zhuǎn)移酶(zinc-finger D-H-H-C domain containing-palmitoyltransferase,ZDHHC)所介導(dǎo)的,而基孔肯雅病毒的nsP1是由哪個(gè)棕櫚酰化轉(zhuǎn)移酶所催化還不清楚。在本研究中,我們?cè)噲D篩選影響基孔肯雅病毒ns...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.?nsPl蛋白分區(qū)??Figure?2.?Alphavirus?nsPl?protein?structure??
?碩士學(xué)位論文???三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果??3.1基孔肯雅病毒的制備??制備基孔肯雅病毒的質(zhì)粒pSinRep5-181/25ic是從addgene購(gòu)得,該基因是基孔??肯雅病毒疫苗株,因此,病毒可在P2實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行操作。首先,我們將該質(zhì)粒線性??化,所選酶切位點(diǎn)是Notl,然后進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄,得到病毒RNA,然后電擊到細(xì)胞??中,保險(xiǎn)起見(jiàn),我們電擊到兩種細(xì)胞中——HeLa和Huh7.5.1細(xì)胞,收集上清中的??病毒,測(cè)病毒滴度,用于接下來(lái)的病毒實(shí)驗(yàn)。圖3是用得到的病毒上清侵染HeLa??細(xì)胞后western?blot和免疫熒光檢測(cè)病毒侵染情況,我們通過(guò)檢測(cè)nsPl判斷是否產(chǎn)??生病毒。??
將細(xì)胞裂解,進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳,western?blot分析,檢測(cè)脂肪酸??合成酶和nsPl蛋白的表達(dá),actin作為內(nèi)參蛋白。從圖中可以看出,在基孔肯雅病??毒侵染后,脂肪酸合成酶蛋白的表達(dá)量有所提高(圖7B)。??■HOB??CHIKV?-?+??FASN?一??nsP1?^??Act?in??著??圖7.基孔肯雅病毒侵染后脂肪酸合成酶表達(dá)上調(diào)??Figure?7.?CHIKV?infection?induces?FASN?up-regulation??A.將HeLa細(xì)胞鋪到小玻片上,基孔肯雅病毒侵染或不侵染,8小時(shí)后使用4%PFA固定細(xì)胞,??封閉液封閉后用anti-FASN、anti-dsRNA進(jìn)行染色,細(xì)胞核用DAPI染色,用激光共聚焦顯微鏡??檢測(cè)病毒侵染前后脂肪酸合成酶在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)情況。B.基孔肯雅病毒(MOI=l)侵染或不侵??染HeLa細(xì)胞,8小時(shí)后,去掉上清,PBS洗3次,每孔加入6〇4的裂解液,各。博枺戳呀庖??進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳,通過(guò)western?blot方法使用anti-nsPl抗體和anti-FASN抗體檢測(cè)病??毒蛋白以及脂肪酸合成合成酶的表達(dá)情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Interplay between hepatitis C virus and ARF4[J]. Na Zhang,Youyang Ke,Leiliang Zhang. Virologica Sinica. 2017(06)
本文編號(hào):3376786
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.?nsPl蛋白分區(qū)??Figure?2.?Alphavirus?nsPl?protein?structure??
?碩士學(xué)位論文???三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果??3.1基孔肯雅病毒的制備??制備基孔肯雅病毒的質(zhì)粒pSinRep5-181/25ic是從addgene購(gòu)得,該基因是基孔??肯雅病毒疫苗株,因此,病毒可在P2實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行操作。首先,我們將該質(zhì)粒線性??化,所選酶切位點(diǎn)是Notl,然后進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄,得到病毒RNA,然后電擊到細(xì)胞??中,保險(xiǎn)起見(jiàn),我們電擊到兩種細(xì)胞中——HeLa和Huh7.5.1細(xì)胞,收集上清中的??病毒,測(cè)病毒滴度,用于接下來(lái)的病毒實(shí)驗(yàn)。圖3是用得到的病毒上清侵染HeLa??細(xì)胞后western?blot和免疫熒光檢測(cè)病毒侵染情況,我們通過(guò)檢測(cè)nsPl判斷是否產(chǎn)??生病毒。??
將細(xì)胞裂解,進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳,western?blot分析,檢測(cè)脂肪酸??合成酶和nsPl蛋白的表達(dá),actin作為內(nèi)參蛋白。從圖中可以看出,在基孔肯雅病??毒侵染后,脂肪酸合成酶蛋白的表達(dá)量有所提高(圖7B)。??■HOB??CHIKV?-?+??FASN?一??nsP1?^??Act?in??著??圖7.基孔肯雅病毒侵染后脂肪酸合成酶表達(dá)上調(diào)??Figure?7.?CHIKV?infection?induces?FASN?up-regulation??A.將HeLa細(xì)胞鋪到小玻片上,基孔肯雅病毒侵染或不侵染,8小時(shí)后使用4%PFA固定細(xì)胞,??封閉液封閉后用anti-FASN、anti-dsRNA進(jìn)行染色,細(xì)胞核用DAPI染色,用激光共聚焦顯微鏡??檢測(cè)病毒侵染前后脂肪酸合成酶在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)情況。B.基孔肯雅病毒(MOI=l)侵染或不侵??染HeLa細(xì)胞,8小時(shí)后,去掉上清,PBS洗3次,每孔加入6〇4的裂解液,各。博枺戳呀庖??進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳,通過(guò)western?blot方法使用anti-nsPl抗體和anti-FASN抗體檢測(cè)病??毒蛋白以及脂肪酸合成合成酶的表達(dá)情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Interplay between hepatitis C virus and ARF4[J]. Na Zhang,Youyang Ke,Leiliang Zhang. Virologica Sinica. 2017(06)
本文編號(hào):3376786
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