小鼠巨細(xì)胞病毒熒光定量PCR檢測方法的建立及應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-07-13 18:47
目的建立小鼠巨細(xì)胞病毒(Mouse Cytomegalovirus,MCMV)熒光定量PCR方法并對其進(jìn)行初步應(yīng)用。方法選取NCBI發(fā)表的MCMV Smith株DNA polymerase基因保守序列設(shè)計引物探針,建立MCMV的熒光定量PCR方法,對方法的特異性、敏感性、重復(fù)性及穩(wěn)定性進(jìn)行驗證,并應(yīng)用該方法檢測摻入MCMV的小鼠血液樣品及2018年度送檢的409份小鼠血液樣本。結(jié)果建立的MCMV熒光定量PCR方法標(biāo)準(zhǔn)曲線Slope為-3. 418,R2值為0. 999,擴(kuò)增效率為96. 137%,可定量檢測到的MCMV最低含量為47 copies/μL。以大鼠巨細(xì)胞病毒,猴巨細(xì)胞病毒,人單純皰疹病毒,偽狂犬病毒及貓皰疹病毒I型為模板均無擴(kuò)增曲線,特異性良好。方法組內(nèi)和組間變異系數(shù)分別為0. 39%~0. 68%和0. 48%~1. 01%,重復(fù)性和穩(wěn)定性好。可檢測到摻入小鼠血液樣品中MCMV病毒的最大稀釋度為1∶1000(100. 75 TCID50/0. 1 m L),409份小鼠血液樣品經(jīng)檢測均為陰性。結(jié)論建立的小鼠巨細(xì)胞病毒熒光定量PCR方法有很好的敏感性、特異性及穩(wěn)定性,可有效...
【文章來源】:實驗動物科學(xué). 2019,36(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
MCMV熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線
MCMV熒光定量PCR方法擴(kuò)增曲線
如圖3所示,4.7×109~4.7×101copies/μL各稀釋度的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品均出現(xiàn)S型擴(kuò)增曲線,而4.7×100copies/μL的3個平行實驗有1個未出現(xiàn)S型擴(kuò)增曲線,說明本方法最低可定量檢測到47copies/μL的樣品。用MCMV FQ-PCR方法和常規(guī)PCR方法檢測同樣的10-1至10-8系列稀釋的MCMV核酸樣品,由圖4可見,MCMV FQ-PCR方法最低可檢測到10-4稀釋度的MCMV核酸,常規(guī)PCR最低可檢測到10-2稀釋度,表明MCMV FQ-PCR方法敏感性比常規(guī)PCR方法高兩個數(shù)量級;用建立的MCMV FQ-PCR方法與文獻(xiàn)報道的FQ-PCR方法檢測相同的10-1至10-8系列稀釋的MCMV核酸樣品,每個稀釋度做3個平行,兩種方法檢測到的最大稀釋度均為10-4,但本方法每個稀釋度的Ct值均值均低于文獻(xiàn)方法(表3),說明本方法的敏感性高于文獻(xiàn)方法。圖4 MCMV熒光定量PCR方法(A)與常規(guī)PCR方法(B)敏感性比較
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]同時檢測小鼠微小病毒(MVM)和小鼠細(xì)小病毒(MPV)的熒光定量PCR的建立及應(yīng)用[J]. 王淑菁,林歡,付瑞,李曉波,王吉,岳秉飛,賀爭鳴. 實驗動物科學(xué). 2018(04)
[2]應(yīng)用實時熒光定量PCR方法檢測實驗用貓巴爾通體的感染[J]. 馮育芳,邢進(jìn),王吉,付瑞,岳秉飛. 實驗動物科學(xué). 2018(04)
[3]小鼠巨細(xì)胞病毒PCR診斷方法的建立及其應(yīng)用[J]. 杜凱,吳德國,趙德明. 實驗動物科學(xué). 2015(05)
[4]我國實驗小鼠群中巨細(xì)胞病毒自然感染情況的調(diào)查[J]. 湯家銘,袁云華,程鴻. 中國病毒學(xué). 1992(02)
本文編號:3282604
【文章來源】:實驗動物科學(xué). 2019,36(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
MCMV熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線
MCMV熒光定量PCR方法擴(kuò)增曲線
如圖3所示,4.7×109~4.7×101copies/μL各稀釋度的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品均出現(xiàn)S型擴(kuò)增曲線,而4.7×100copies/μL的3個平行實驗有1個未出現(xiàn)S型擴(kuò)增曲線,說明本方法最低可定量檢測到47copies/μL的樣品。用MCMV FQ-PCR方法和常規(guī)PCR方法檢測同樣的10-1至10-8系列稀釋的MCMV核酸樣品,由圖4可見,MCMV FQ-PCR方法最低可檢測到10-4稀釋度的MCMV核酸,常規(guī)PCR最低可檢測到10-2稀釋度,表明MCMV FQ-PCR方法敏感性比常規(guī)PCR方法高兩個數(shù)量級;用建立的MCMV FQ-PCR方法與文獻(xiàn)報道的FQ-PCR方法檢測相同的10-1至10-8系列稀釋的MCMV核酸樣品,每個稀釋度做3個平行,兩種方法檢測到的最大稀釋度均為10-4,但本方法每個稀釋度的Ct值均值均低于文獻(xiàn)方法(表3),說明本方法的敏感性高于文獻(xiàn)方法。圖4 MCMV熒光定量PCR方法(A)與常規(guī)PCR方法(B)敏感性比較
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]同時檢測小鼠微小病毒(MVM)和小鼠細(xì)小病毒(MPV)的熒光定量PCR的建立及應(yīng)用[J]. 王淑菁,林歡,付瑞,李曉波,王吉,岳秉飛,賀爭鳴. 實驗動物科學(xué). 2018(04)
[2]應(yīng)用實時熒光定量PCR方法檢測實驗用貓巴爾通體的感染[J]. 馮育芳,邢進(jìn),王吉,付瑞,岳秉飛. 實驗動物科學(xué). 2018(04)
[3]小鼠巨細(xì)胞病毒PCR診斷方法的建立及其應(yīng)用[J]. 杜凱,吳德國,趙德明. 實驗動物科學(xué). 2015(05)
[4]我國實驗小鼠群中巨細(xì)胞病毒自然感染情況的調(diào)查[J]. 湯家銘,袁云華,程鴻. 中國病毒學(xué). 1992(02)
本文編號:3282604
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