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CD81介導(dǎo)HCV入侵種屬特異性分子基礎(chǔ)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-25 22:12

  本文關(guān)鍵詞:CD81介導(dǎo)HCV入侵種屬特異性分子基礎(chǔ)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:丙型肝炎病毒(HCV)感染是慢性肝病的主要誘因,在全世界范圍內(nèi)感染人數(shù)已超過1.7億。由于HCV感染具有高度嚴(yán)格的宿主特異性,只有人和黑猩猩可支持HCV感染,HCV小動(dòng)物模型的研發(fā)成為了阻滯HCV相關(guān)研究,特別是疫苗研發(fā)的瓶頸之一。HCV宿主特異性的基礎(chǔ)來源于病毒入侵過程的復(fù)雜性。目前,已知HCV受體至少包括CD81, SR-B1, Claudin-1 和 Occludin等4種。其中CD81是HCV早期入侵所必須的。CD81直接與HCV-E2相結(jié)合,其介導(dǎo)HCV的入侵具有很強(qiáng)的種屬特異性,只有人和黑猩猩的CD81以很高的親和力結(jié)合HCV-E2并支持HCV入侵,但其分子機(jī)制至今尚不明確。為揭示CD81介導(dǎo)HCV入侵種屬特異性分子機(jī)制,本課題利用結(jié)構(gòu)生物學(xué),生物物理學(xué)和病毒學(xué)的方法對(duì)人,小鼠,和非洲綠猴的,CD81 (hCD81, mCD81 和 agmCD81)進(jìn)行了深入的研究。首先解析了hCD81-LEL, mCD81-LEL 和 agmCD81-LEL的高分辨率晶體結(jié)構(gòu),mCD81-LEL和agmCD81-LEL的全局結(jié)構(gòu)與hCD81-LEL類似,均由五個(gè)α-螺旋組成“磨菇型”結(jié)構(gòu),螺旋-A/E構(gòu)成了“磨菇莖”,螺旋-B/C/D構(gòu)成了“蘑菇頭”,其中D-helix是CD81直接與HCV-E2結(jié)合的區(qū)域。通過結(jié)構(gòu)對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),在mCD81-LEL和agmCD81-LEL中188-196氨基酸殘基之間形成了分子內(nèi)氫鍵/鹽鍵,而類似的分子內(nèi)相互作用在hCD81-LEL中是不存在的。之前有研究報(bào)道,CD81D-helix構(gòu)象的靈活性是與E2結(jié)合所必須的,而在mCD81-LEL 和 agmCD81-LEL結(jié)構(gòu)中,分子內(nèi)氫鍵或鹽鍵通過把D-helix錨定在穩(wěn)定的E-helix上,因此我們推測假分子內(nèi)氫鍵/鹽鍵對(duì)D-helix的構(gòu)象靈活性產(chǎn)生了束縛作用,從而干擾了CD81與E2的相互作用,削弱了CD81介導(dǎo)HCV入侵效率。以往的研究表明F186是CD81與HCV-E2的結(jié)合所必須的,因此,我們?cè)贔186存在的基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)突變實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證188-196間氫鍵或鹽鍵對(duì)E2結(jié)合以及HCV入侵效率的影響。結(jié)果表明,hCD81中,在F186存在的情況下,如果誘導(dǎo)188-196殘基之間形成氫鍵/鹽鍵,會(huì)削弱hCD81與HCV-E2之間的結(jié)合,同時(shí)會(huì)降低HCV的入侵效率。而對(duì)于mCD81 和 agmCD81,在具備L186F突變的前提下,破壞188-196殘基之間的氫鍵/鹽鍵,可以提升HCV的入侵效率。本課題結(jié)果證實(shí),CD81中188-196間分子內(nèi)氫鍵/鹽鍵是決定其與HCV-E2的結(jié)合親和力及其介導(dǎo)HCV入侵效率決定因素之一,此理論不但解釋了CD81介導(dǎo)的HCV入侵種屬特異性分子機(jī)制,同時(shí)為感染性動(dòng)物模型的建立提供了篩選的理論依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:HCV入侵 CD81 種屬特異性 小動(dòng)物模型
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R373
【目錄】:
  • 摘要6-7
  • Abstract7-9
  • 第1章 引言9-13
  • 第2章 實(shí)驗(yàn)材料與方法13-41
  • 1. 實(shí)驗(yàn)材料13-17
  • 1.1 菌株13
  • 1.2 質(zhì)粒13-15
  • 1.3 常用試劑和耗材15
  • 1.4 常用溶液15-16
  • 1.5 常用儀器和設(shè)備16-17
  • 2. 實(shí)驗(yàn)方法17-41
  • 2.1 基因的克隆與質(zhì)粒構(gòu)建17-22
  • 2.1.1 引物設(shè)計(jì)18
  • 2.1.2 目的基因的擴(kuò)增18-19
  • 2.1.3 PCR產(chǎn)物檢測與回收19-20
  • 2.1.4 目的基因與載體的限制性酶切20-21
  • 2.1.5 目的基因與載體的連接21-22
  • 2.1.6 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化22
  • 2.1.7 克隆鑒定22
  • 2.2 定點(diǎn)突變構(gòu)建突變體22-27
  • 2.2.1 突變體及引物設(shè)計(jì)23-26
  • 2.2.2 PCR擴(kuò)增26-27
  • 2.2.3 消化27
  • 2.2.4 轉(zhuǎn)化27
  • 2.3 目的蛋白表達(dá)與純化27-30
  • 2.3.1 蛋白表達(dá)條件篩選27-28
  • 2.3.2 蛋白的大量表達(dá)純化28-30
  • 2.4 蛋白晶體篩選與優(yōu)化30-32
  • 2.4.1 蛋白晶體的初篩30-31
  • 2.4.2 蛋白晶體的優(yōu)化31-32
  • 2.5 晶體數(shù)據(jù)收集及結(jié)構(gòu)解析32-33
  • 2.6 圓二色譜試驗(yàn)33-35
  • 2.7 小角X射線散射試驗(yàn)35-37
  • 2.8 結(jié)合試驗(yàn)37
  • 2.9 病毒入侵試驗(yàn)37-41
  • 2.9.1 構(gòu)建CD81缺陷型Huh7.5.1細(xì)胞系38-39
  • 2.9.2 擴(kuò)增HCVpp和HCVcc病毒顆粒39
  • 2.9.3 HCVpp感染試驗(yàn)39-40
  • 2.9.4 HCVcc感染試驗(yàn)40-41
  • 第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果41-60
  • 3.1 目的蛋白原核表達(dá)與純化41-43
  • 3.2 晶體初篩和優(yōu)化43-45
  • 3.2.1 結(jié)晶條件初篩結(jié)果43-44
  • 3.2.2 結(jié)晶條件優(yōu)化結(jié)果44-45
  • 3.3 晶體解析及結(jié)構(gòu)解析45-47
  • 3.4 結(jié)構(gòu)分析47-51
  • 3.5 圓二色譜試驗(yàn)51-53
  • 3.6 小角散射試驗(yàn)53-55
  • 3.7 結(jié)合試驗(yàn)55-57
  • 3.8 病毒入侵試驗(yàn)57-60
  • 3.8.1 HCVpp入侵試驗(yàn)57-58
  • 3.8.2 HCVcc入侵試驗(yàn)58-60
  • 第4章 討論60-64
  • 參考文獻(xiàn)64-68
  • 致謝68-70
  • 個(gè)人簡歷及發(fā)表文章70

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 馮煒瑋;陳志偉;;蛋白質(zhì)結(jié)晶及其影響因素研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年18期


  本文關(guān)鍵詞:CD81介導(dǎo)HCV入侵種屬特異性分子基礎(chǔ)研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):327188

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