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重編程過程中使用抗氧化劑降低人iPSCs基因組變異

發(fā)布時(shí)間:2017-04-09 13:05

  本文關(guān)鍵詞:重編程過程中使用抗氧化劑降低人iPSCs基因組變異,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:背景: 人類胚胎干(ES)細(xì)胞具有在體外無限增殖和分化為多種細(xì)胞的潛能,可為再生醫(yī)學(xué)的替代療法提供充足的細(xì)胞來源。然而由于入ES細(xì)胞的分離涉及到倫理問題,從而限制了ES細(xì)胞的研究以及在再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的潛在應(yīng)用。2006年,日本京都大學(xué)山中伸彌(Shinya Yamanaka)團(tuán)隊(duì)通過向小鼠皮膚成纖維細(xì)胞導(dǎo)入以逆病毒為載體的4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子Oct3/4、SOX2、c-Myc、Klf4,將成纖維細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(Induced Pluripotent Stem Cells, iPSCs)。iPSCs和ES細(xì)胞功能類似,可以在體外無限增殖并具有多向分化能力。重編程技術(shù)繞開了ES細(xì)胞研究一直面臨的倫理障礙,在生物學(xué)基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用方面具有重大的潛在價(jià)值,因而成為了當(dāng)前生物醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)。但是,多個(gè)小組的研究表明iPSCs的基因組存在變異,基因變異可能使移植的細(xì)胞在體內(nèi)產(chǎn)生腫瘤,從而限制了iPSCs的應(yīng)用。然而目前關(guān)于人iPSCs基因組變異的原因大部分未知。我們的課題證明了人體細(xì)胞重編程過程中存在氧化應(yīng)激,在誘導(dǎo)iPSCs產(chǎn)生過程中的培養(yǎng)基中添加抗氧化劑可以降低人iPSCs基因組的變異。我們的研究結(jié)果表明,可通過在誘導(dǎo)產(chǎn)生和維持iPSCs的培養(yǎng)基中添加抗氧化劑來提高人類iPSCs的質(zhì)量和安全性,從而為獲得更安全的iPSCs應(yīng)用于再生醫(yī)學(xué)提供一定的參考價(jià)值。本研究分為兩個(gè)部分:1)人體細(xì)胞重編程誘導(dǎo)成iPSCs系統(tǒng)的建立;2)人體細(xì)胞重編程過程中加入抗氧化劑降低iPSCs基因組變異的研究。 第一部分人體細(xì)胞重編程系統(tǒng)的建立 目的:建立人類成纖維細(xì)胞或者尿液細(xì)胞重編程為iPSCs的體系,為研究作用機(jī)制提供基礎(chǔ)。 方法:重編程四因子OCT4, SOX2, KLF4, c-MYC以PMX逆轉(zhuǎn)錄病毒為載體導(dǎo)入到目的細(xì)胞中進(jìn)行誘導(dǎo)成iPSCs,挑選克隆后繼續(xù)培養(yǎng),傳代和擴(kuò)增,并對其進(jìn)行鑒定如ES細(xì)胞特異標(biāo)記分子的表達(dá)和體外細(xì)胞分化實(shí)驗(yàn)明確獲得成熟的iPSCs。 結(jié)果:在人尿液來源的細(xì)胞和人的皮膚成纖維細(xì)胞成功導(dǎo)入重編程四因子后均可觀察到明顯的細(xì)胞形變,經(jīng)檢測為ALP陽性。 結(jié)論:通過以逆轉(zhuǎn)錄病毒為載體導(dǎo)入特定轉(zhuǎn)錄因子的經(jīng)典方法可以使人尿液來源的細(xì)胞和人的皮膚成纖維細(xì)胞重編程為iPSCs. 第二部分體細(xì)胞重編程過程中使用抗氧化劑降低基因組變異 目的:人iPSCs的基因組存在變異阻礙iPSCs在生物及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的潛在應(yīng)用。因此明確導(dǎo)致人iPSCs基因組變異的原因并發(fā)明方法以減少其變異,對于獲得安全的iPSCs用于再生醫(yī)學(xué)非常重要。本研究旨在探究人體細(xì)胞重編程過程中氧化自由基應(yīng)激是否是導(dǎo)致人iPSCs基因組變異的重要原因,加入抗氧化劑是否可以減少iPSCs基因組變異。 方法:在重編程過程中檢測ROS以及DNA損傷水平,并對比加入抗氧化劑后對ROS, DNA損傷和人iPSCs基因組變異的作用。 結(jié)果:相對于對照組,添加抗氧化劑可以顯著降低ROS和DNA損傷水平,加入抗氧化劑后獲得的iPSCs具有較少的基因組拷貝數(shù)變異。 結(jié)論:添加抗氧化劑可降低人iPSCs基因組的變異。
【關(guān)鍵詞】:抗氧化劑 體細(xì)胞重編程 基因組變異 誘導(dǎo)多能干細(xì)胞
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R3416
【目錄】:
  • 致謝4-5
  • 中文摘要5-7
  • Abstract7-10
  • 縮略詞10-14
  • 引言14-16
  • 1 第一章 iPSCs系統(tǒng)建立16-37
  • 1.1 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器16-21
  • 1.1.1 材料和試劑16-17
  • 1.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及材料17-18
  • 1.1.3 相關(guān)試劑的配制18-21
  • 1.2 實(shí)驗(yàn)方法21-29
  • 1.2.1 支原體檢測21-22
  • 1.2.2 人包皮成纖維細(xì)胞(HFF)的分離和培養(yǎng)22
  • 1.2.3 人尿液細(xì)胞(UC)的分離和培養(yǎng)22-23
  • 1.2.4 iPSCs細(xì)胞的培養(yǎng)23
  • 1.2.5 MEF細(xì)胞的分離和培養(yǎng)23-24
  • 1.2.6 MEF飼養(yǎng)層處理24
  • 1.2.7 細(xì)胞凍存24
  • 1.2.8 細(xì)胞復(fù)蘇24-25
  • 1.2.9 重編程步驟方法25
  • 1.2.10 感受態(tài)細(xì)胞的制備25-26
  • 1.2.11 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化26
  • 1.2.12 質(zhì)粒大量抽提26-27
  • 1.2.13 病毒包裝27-28
  • 1.2.14 病毒感染28
  • 1.2.15 BCIP/NBT堿性磷酸酯酶染色28-29
  • 1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果29-36
  • 1.3.1 獲得人誘導(dǎo)多能性干細(xì)胞流程圖29
  • 1.3.2 支原體檢測結(jié)果29-30
  • 1.3.3 成功分離P0代人尿液細(xì)胞30-31
  • 1.3.4 293T成功轉(zhuǎn)染質(zhì)粒PMX-GFP31-32
  • 1.3.5 pMX-GFP成功感染尿液細(xì)胞32-33
  • 1.3.6 感染四因子后尿液細(xì)胞的形變變化33-34
  • 1.3.7 感染四因子后成纖維細(xì)胞的形變變化34-35
  • 1.3.8 感染四因子后外源因子的表達(dá)35
  • 1.3.9 ES樣細(xì)胞出現(xiàn)35-36
  • 1.4 討論36-37
  • 2 第二章 體細(xì)胞重編程過程中使用抗氧化劑降低基因組變異37-51
  • 2.1 材料和試劑37
  • 2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器及材料37
  • 2.1.2 相關(guān)試劑配制37
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法37-41
  • 2.2.1 提取RNA37-38
  • 2.2.2 逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA38
  • 2.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real time PCR)38-39
  • 2.2.4 γH2AX免疫熒光染色39-40
  • 2.2.5 流式細(xì)胞術(shù)測細(xì)胞凋亡40
  • 2.2.6 MTT assay40-41
  • 2.2.7 Southern Blot測定逆轉(zhuǎn)錄病毒整合41
  • 2.2.8 其余方法同第一章41
  • 2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果41-50
  • 2.3.1 添加NAC實(shí)驗(yàn)流程圖41-42
  • 2.3.2 添加抗氧化劑對ROS水平、基因損傷和細(xì)胞存活的影響42-47
  • 2.3.3 添加抗氧化劑對重編程效率的影響47-48
  • 2.3.4 添加抗氧化劑對基因組變異的影響48-50
  • 2.4 討論50-51
  • 總結(jié)51-53
  • 參考文獻(xiàn)53-56
  • 綜述56-67
  • 參考文獻(xiàn)63-67
  • 作者簡歷及在讀期間所取得的科研成果67

【共引文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞:重編程過程中使用抗氧化劑降低人iPSCs基因組變異,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號:295294

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