基于單個T淋巴細(xì)胞的手工顯微分離及TCR基因的克隆
發(fā)布時間:2020-07-20 11:06
【摘要】:目的:通過建立單個T細(xì)胞的分離和基因擴增技術(shù),來獲取識別特定抗原表位肽的單個T細(xì)胞的TCR基因,為特異性TCR的獲取提供了一種新方法,為以后獲取腫瘤特異性TCR基因并利用特異性TCR基因修飾T細(xì)胞進(jìn)行過繼性免疫治療打下基礎(chǔ)。方法:一、單個淋巴細(xì)胞的手工顯微分離及單細(xì)胞水平的RT-PCR擴增利用自制的毛細(xì)玻璃管、橡膠管和濾嘴組裝成一套完整的單細(xì)胞分離工具,通過該分離工具分離出單個T淋巴細(xì)胞,然后使用不同的試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和GAPDH基因擴增,通過對比確定出擴增效率高的反轉(zhuǎn)錄試劑盒,并通過擴增BCL2、STAT1和CD8a基因進(jìn)一步驗證其擴增效率,優(yōu)化其相應(yīng)擴增條件,為擴增單個T淋巴細(xì)胞的TCR基因奠定實驗基礎(chǔ)。二、單個T細(xì)胞TCRA基因擴增方法的建立通過自制的手工分離單細(xì)胞工具分離出單個經(jīng)特定富集的CD8~+T細(xì)胞后,分別采用5’RACE法和多重PCR法擴增單個T細(xì)胞的TCRA基因。通過采用不同的擴增條件、不同的特異性引物和不同的PCR擴增酶進(jìn)行5’RACE法擴增TCRA基因條件的摸索;通過常規(guī)PCR和分步PCR法進(jìn)行多重PCR法擴增TCRA基因的條件摸索。三、TCR(α和β鏈)重組表達(dá)載體的構(gòu)建將第二部分單細(xì)胞擴增獲得的TCR基因核心序列(CDR3)分別與對應(yīng)的上游V區(qū)和下游C區(qū)片段通過融合PCR的方法拼接出全長序列。然后根據(jù)插入的目的基因和載體序列設(shè)計合理的同源重組引物和含酶切位點引物進(jìn)行TCRα和TCRβ基因的擴增,后與pIRES2-Oligo載體連接,構(gòu)建出TCR的重組表達(dá)載體。結(jié)果:一、成功組裝單細(xì)胞分離工具并建立了手工顯微分離單個T淋巴細(xì)胞的方法;通過對單個T細(xì)胞豐度較高的GAPDH基因擴增,摸索出了穩(wěn)定的單細(xì)胞反轉(zhuǎn)錄和擴增方法,并通過擴增單個T細(xì)胞的BCL2、STAT1和CD8a基因得到了進(jìn)一步的驗證,為擴增單個T細(xì)胞的TCR基因奠定了實驗基礎(chǔ)。二、5’RACE法擴增單個T細(xì)胞的TCRA基因效果不理想。后對多重PCR擴增單個T細(xì)胞TCRA基因的方法進(jìn)行優(yōu)化,成功擴增出2個CD8~+T細(xì)胞各自的TCRA基因:1號細(xì)胞的TCRVα16和TCRVα2/3、4號單細(xì)胞的TCRVα26和TCRVα1/5。三、通過融合PCR法成功擴增出TCRβ5、TCRα1/5和TCRα26的全長序列。利用同源重組和酶切的方法成功構(gòu)建出pIRES2-TCRβ5-TCRα1/5和pIRES2-TCRβ5-TCRα26重組表達(dá)載體。結(jié)論:本實驗成功建立了單個T淋巴細(xì)胞的手工顯微分離和基因擴增方法,在此基礎(chǔ)上通過對單細(xì)胞TCR基因的方法摸索,成功建立了分步多重PCR擴增單個T細(xì)胞TCR基因的方法。該技術(shù)的建立為快速獲取TCR-T細(xì)胞免疫治療所需的特異性TCR基因提供了新的方法與思路,為促進(jìn)TCR-T過繼性細(xì)胞免疫療法的應(yīng)用研究奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R392
【圖文】:
也會有不同數(shù)量的核苷酸隨機插入 V 區(qū)與 J 區(qū)、V 區(qū)與 D 區(qū),D 區(qū)與 J 區(qū),形成VN(DN)J 的重排,從而又增加了 TCR 的多樣性。最后不同的 和 β 鏈自由組合更增加了 TCR 的多樣性,據(jù)理論估算可達(dá)到 1016以上,這也很好的解釋了 T 細(xì)胞能夠識別多種抗原的原因。TCR的 V區(qū)基因編碼了CDR1、CDR2和部分CDR3區(qū),VN(DN)J 連接區(qū)稱之為 CDR3 區(qū),它是識別抗原肽的關(guān)鍵區(qū)域[9]。通常我們只需得到特異性 T 細(xì)胞的 CDR3 區(qū),根據(jù) CDR3 區(qū)的部分 V 區(qū)和 C 區(qū)片段分析可得到 和 β 鏈的全長序列。每個 T 細(xì)胞的 和 β 鏈分別對應(yīng)一個 CDR3 區(qū),由 和 β 的 CDR3 區(qū)共同決定了識別抗原的特異性,通過 CDR3 序列可以判斷 T細(xì)胞是否來自同一克隆或不同克隆。經(jīng)過抗原刺激 TCR 譜系會出現(xiàn)優(yōu)勢選擇,即識別該抗原的 T 細(xì)胞進(jìn)行克隆性增殖[10]。通常多數(shù)研究只通過分析 TCRVβ 譜系來了解 TCR 選用和偏移情況,他們認(rèn)為 Vβ 在抗原刺激后所引起的限制性更為明顯,但也有學(xué)者認(rèn)為 TCRV 的限制性出現(xiàn)更早,但有研究發(fā)現(xiàn)存在許多優(yōu)勢利用和優(yōu)勢配對情況,如 HLA-A2/Melan-A 特異的 CD8+T 細(xì)胞的 V 2.1NJ 35和 Vβ14.1 的選用和配對頻率最高[11],這也提示了在對抗原特異的 TCR 譜系研究中,可能需要同時分析 TCR 和 TCRβ 譜系,才能獲得更為全面和客觀的結(jié)果。
圖 2 TCR β 基因的重排Fig.2 The rearrangement of TCR β genesCR 研究是利用 和 β 各亞家族相應(yīng)單克隆抗體進(jìn)行流各亞家族的分布與缺失進(jìn)行研究。然而流式細(xì)胞術(shù)雖和 β 鏈各亞家族的表達(dá)并對其準(zhǔn)確定量,卻無法明確布,所以PCR-DNA印跡法[12]、PCR-變性聚丙烯酰胺凝性[14]、熒光定量 PCR 溶解曲線法[15]等方法應(yīng)運而出CR 和 β 鏈 CDR3 多態(tài)性和長度分布。此后,有學(xué)者 TCRV 和 Vβ 基因家族同源性的特點研發(fā)了免疫掃疫指紋分析技術(shù) ),其基本策略為依據(jù) Vβ24 和 V 32 設(shè)計各家族相應(yīng)的特異性上游引物,并在 TCR 和 β 和 TCRAC 下游引物,由于不同 T 細(xì)胞克隆其 TCR C,利用 PCR 技術(shù)可擴增出所有 TCRV 和 TCRVβ 家族
AG-3蔙:5
本文編號:2763362
【學(xué)位授予單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R392
【圖文】:
也會有不同數(shù)量的核苷酸隨機插入 V 區(qū)與 J 區(qū)、V 區(qū)與 D 區(qū),D 區(qū)與 J 區(qū),形成VN(DN)J 的重排,從而又增加了 TCR 的多樣性。最后不同的 和 β 鏈自由組合更增加了 TCR 的多樣性,據(jù)理論估算可達(dá)到 1016以上,這也很好的解釋了 T 細(xì)胞能夠識別多種抗原的原因。TCR的 V區(qū)基因編碼了CDR1、CDR2和部分CDR3區(qū),VN(DN)J 連接區(qū)稱之為 CDR3 區(qū),它是識別抗原肽的關(guān)鍵區(qū)域[9]。通常我們只需得到特異性 T 細(xì)胞的 CDR3 區(qū),根據(jù) CDR3 區(qū)的部分 V 區(qū)和 C 區(qū)片段分析可得到 和 β 鏈的全長序列。每個 T 細(xì)胞的 和 β 鏈分別對應(yīng)一個 CDR3 區(qū),由 和 β 的 CDR3 區(qū)共同決定了識別抗原的特異性,通過 CDR3 序列可以判斷 T細(xì)胞是否來自同一克隆或不同克隆。經(jīng)過抗原刺激 TCR 譜系會出現(xiàn)優(yōu)勢選擇,即識別該抗原的 T 細(xì)胞進(jìn)行克隆性增殖[10]。通常多數(shù)研究只通過分析 TCRVβ 譜系來了解 TCR 選用和偏移情況,他們認(rèn)為 Vβ 在抗原刺激后所引起的限制性更為明顯,但也有學(xué)者認(rèn)為 TCRV 的限制性出現(xiàn)更早,但有研究發(fā)現(xiàn)存在許多優(yōu)勢利用和優(yōu)勢配對情況,如 HLA-A2/Melan-A 特異的 CD8+T 細(xì)胞的 V 2.1NJ 35和 Vβ14.1 的選用和配對頻率最高[11],這也提示了在對抗原特異的 TCR 譜系研究中,可能需要同時分析 TCR 和 TCRβ 譜系,才能獲得更為全面和客觀的結(jié)果。
圖 2 TCR β 基因的重排Fig.2 The rearrangement of TCR β genesCR 研究是利用 和 β 各亞家族相應(yīng)單克隆抗體進(jìn)行流各亞家族的分布與缺失進(jìn)行研究。然而流式細(xì)胞術(shù)雖和 β 鏈各亞家族的表達(dá)并對其準(zhǔn)確定量,卻無法明確布,所以PCR-DNA印跡法[12]、PCR-變性聚丙烯酰胺凝性[14]、熒光定量 PCR 溶解曲線法[15]等方法應(yīng)運而出CR 和 β 鏈 CDR3 多態(tài)性和長度分布。此后,有學(xué)者 TCRV 和 Vβ 基因家族同源性的特點研發(fā)了免疫掃疫指紋分析技術(shù) ),其基本策略為依據(jù) Vβ24 和 V 32 設(shè)計各家族相應(yīng)的特異性上游引物,并在 TCR 和 β 和 TCRAC 下游引物,由于不同 T 細(xì)胞克隆其 TCR C,利用 PCR 技術(shù)可擴增出所有 TCRV 和 TCRVβ 家族
AG-3蔙:5
本文編號:2763362
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