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嗜肺軍團菌效應蛋白SdeA修飾泛素的結構基礎

發(fā)布時間:2020-05-21 02:38
【摘要】:泛素化是蛋白質翻譯后修飾的一種方式,控制真核細胞中幾乎所有的生理過程。目前,嗜肺軍團菌中的一個效應蛋白SdeA經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)可以以一種特殊的方式催化泛素化過程,其可對泛素(Ub)的第42位精氨酸進行兩步修飾,使泛素轉變成為ADP核糖基泛素(ADPrUb),然后再轉變?yōu)榱姿岷颂腔核?PrUb)。這兩個過程依次由單ADP-核糖基轉移酶(mART)和磷酸二酯酶(PDE)兩個結構域催化。ADPrUb和PrUb也被證明是新穎和重要的泛素修飾,可以影響宿主泛素化和去泛素化系統(tǒng),然而SdeA催化的泛素化過程機理仍然未知。在本論文工作中,我們分別解析了 SdeA231-1190的無配體、Ub結合和Ub-NADH結合態(tài)的晶體結構,揭示了 SdeA的mART和PDE結構域形成了一個催化核心。當Ub結合后,SdeAmART中的ARTT和PNloop發(fā)生顯著的構象變化。在結構上,UbR72比UbR42更接近SdeAmART的活性位點。結合生物化學和分子動力學模擬分析,這些結果表明UbR72發(fā)揮類似“探針”的作用先與SdeAmART相互作用,然后在泛素ADP-核糖基化期間UbR72和UbR42的側鏈發(fā)生明顯的構象變化,使得UbR42靠近活性中心。總之,我們的研究揭示了 SdeA介導的泛素修飾的機制,并為設計針對SdeA家族的小分子藥物,作為潛在的抗生素以治療軍團菌肺炎,以及進一步研究ADPrUb和PrUb的功能提供了重要的結構基礎。
【圖文】:

示意圖,泛素,結構示意圖,泛素化


形成多種方式的泛素鏈,,但不同的方式具有不同的生理功能,其中最常見的是在K48逡逑和K63生成的泛素鏈,被稱為典型泛素化。隨著研[偟納釗,穳q湫頭核亓淳哂械納義俠砉δ芤蒼嚼叢獎謊繡橙嗽彼粗兀郟叮擼福蕁M跡保參核卣褰峁故疽饌。辶x霞玨義希畬翦義賢跡保卜核亟峁故疽饌煎義希疲椋紓澹保插澹櫻悖瑁澹恚幔簦椋沐澹洌椋幔紓潁幔礤澹錚駑澹酰猓椋瘢酰椋簦椋鑠義希保保撤核鼗擲噱義戲核鼗鶻詘詼嘀稚砉蹋煌納砉逃剎煌擲嗟姆核鼗骺,其辶x現(xiàn)兄饕嘈頭治海ǎ保┑シ核鼗。哉浕个目的蛋白质仓x砑擁ザ賴模眨,可译s跋煜噱義賢鞍灼淥蹋⑶業(yè)シ核鼗瞧淥嘈頭核鼗謀匾跫。(2)秶亢素化。几个埩x俠蛋彼嵊臚桓齜核胤從。(3)混簯蚝素恋AA吹難由焓怯剎煌牧唇惶媼櫻淳咤義希插義

本文編號:2673595

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