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APR3蛋白的亞細(xì)胞學(xué)定位及其在細(xì)胞凋亡和自噬中的作用

發(fā)布時(shí)間:2020-03-22 06:35
【摘要】:目的:明確凋亡相關(guān)蛋白3(apoptosis related protein 3,APR3)的亞細(xì)胞學(xué)定位,并探討其在細(xì)胞凋亡和自噬中的作用。方法:采用生物信息學(xué)方法對(duì)APR3蛋白的信號(hào)肽、跨膜區(qū)、糖基化情況進(jìn)行預(yù)測,并采用Real-time PCR和Western blot檢測APR3在小鼠各器官組織及多種細(xì)胞株中的表達(dá)。利用Percoll法蔗糖密度梯度離心技術(shù)獲得小鼠肝臟組織溶酶體組份,并進(jìn)行Western blot分析,檢測APR3蛋白與溶酶體膜標(biāo)記蛋白LAMP1在各亞細(xì)胞組份及溶酶體中的豐度;采用免疫熒光共聚焦方法探討APR3與LAMP1或溶酶體示蹤劑Lyso-Tracker Red共同定位情況,以及構(gòu)建的APR3蛋白真核表達(dá)載體(pFUGW-APR3)表達(dá)的外源性APR3蛋白的亞細(xì)胞定位特征。APR3表達(dá)載體(pFUGW-APR3)和沉默載體(pLL3.7-APR3)轉(zhuǎn)染NIH 3T3細(xì)胞,采用CCK-8和xCELLigence活細(xì)胞計(jì)數(shù)法、碘化丙啶染色細(xì)胞流式細(xì)胞術(shù)等,檢測APR3對(duì)細(xì)胞增殖活力、細(xì)胞周期、細(xì)胞溶酶體膜通透性、溶酶體腔pH、溶酶體腔多種酸性水解酶活性(如組織蛋白酶、酸性磷酸酶、酸性脂酶和β-半乳糖苷酶等)等的影響;采用流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞凋亡情況,采用透射電鏡技術(shù)檢測細(xì)胞形態(tài)的變化;采用Western blot法檢測APR3對(duì)凋亡相關(guān)蛋白BAX、BAD、BCL-2和cleaved caspase 3表達(dá)的影響,以及自噬相關(guān)標(biāo)記蛋白Beclin1和Map1LC3B表達(dá)的影響;利用小劑量Rapamycin刺激后,觀察APR3蛋白對(duì)phos-mTOR和p62蛋白表達(dá)的影響。結(jié)果:生物信息學(xué)預(yù)測結(jié)果顯示APR3是一個(gè)含有信號(hào)肽、單重跨膜的糖基化蛋白,Real-time PCR和Western blot檢測發(fā)現(xiàn)其在多種組織器官和細(xì)胞株中均有表達(dá),其中在小鼠脾臟、腎臟、肝臟、肺、脂肪組織和部分腫瘤細(xì)胞株中具有相對(duì)較高的表達(dá)。對(duì)亞細(xì)胞器組份的Western blot檢測發(fā)現(xiàn)APR3蛋白與LAMP1蛋白表達(dá)具有高度的重疊,免疫熒光雙染色結(jié)果也顯示APR3和LAMP1具有相同的細(xì)胞學(xué)定位特征,并且與溶酶體示蹤劑Lyso-Tracker Red具有相同的細(xì)胞器定位;NIH 3T3細(xì)胞轉(zhuǎn)染外源表達(dá)質(zhì)粒后免疫熒光染色顯示外源性APR3與Lyso-Tracker Red具有相同的細(xì)胞器定位,并且出現(xiàn)部分定位失真現(xiàn)象,即在細(xì)胞膜中亦出現(xiàn)表達(dá)。NIH 3T3細(xì)胞株中外源性APR3蛋白過表達(dá)降低細(xì)胞的增殖活力,細(xì)胞出現(xiàn)細(xì)胞周期阻滯,阻滯于G1/S期,同時(shí)伴細(xì)胞周期蛋白cyclin D1表達(dá)下降,細(xì)胞凋亡促進(jìn)因子BAX、BAD和cleaved caspase 3表達(dá)升高,凋亡抑制因子BCL-2表達(dá)下調(diào),自噬相關(guān)標(biāo)記蛋白Beclin-1和Map1LC3B表達(dá)增加;外源性APR3蛋白過表達(dá)還使細(xì)胞溶酶體膜通透性增加,溶酶體腔pH降低,溶酶體腔組織蛋白酶B、酸性磷酸酶、酸性脂酶和β-半乳糖苷酶活性增加;與此相反,APR3基因沉默則使溶酶體膜通透性顯著下降,溶酶體腔pH升高,但不影響溶酶體腔相關(guān)酶活性;小劑量Rapamycin使APR3過表達(dá)細(xì)胞凋亡和自噬相關(guān)標(biāo)記蛋白的表達(dá)發(fā)生進(jìn)一步變化(BAX升高、BCL-2下降、Beclin 1和Map1LC3B表達(dá)增加),伴隨著Phos-mTOR和p62蛋白表達(dá)的進(jìn)一步下降。結(jié)論:APR3蛋白是一個(gè)定位于溶酶體膜的全膜蛋白;APR3蛋白過表達(dá)導(dǎo)致細(xì)胞增殖活力下降,cyclin D1表達(dá)下降和細(xì)胞周期阻滯(G1/S期),細(xì)胞凋亡與自噬增多,并對(duì)Rapamycin的敏感性增加。
【圖文】:

蛋白信號(hào)


通大學(xué)博士學(xué)位論文 APR3 蛋白的亞細(xì)胞學(xué)定位及其在細(xì)胞凋亡和自噬中信號(hào)肽預(yù)測利用 expasy 信息分析工具獲得信號(hào)肽預(yù)測效果,如圖 1-1 所示。asure Position Value Cutoff signal peptide?x. C 26 0.628x. Y 26 0.700x. S 22 0.876an S 1-25 0.768D 1-25 0.737 0.450 YES=Sequence SP='YES' Cleavage site between pos. 25 and 26: ALA-LP D=0toff=0.450 Networks=SignalP-noTM、結(jié)果R3的生物信息學(xué)分析

氨基酸序列,蛋白,糖基化,氨基酸序列


圖 1-2. APR3 蛋白跨膜區(qū)分析Figure 1-2. Analysis transmembrane region of APR3 protein由圖 1-2 分析表明,,APR3 顯示有 2 個(gè)跨膜區(qū),定位于膜上。其跨膜序于“FSLLMFFGILGSTTLAISILLWG”氨基酸序列中。糖基化分析tput for ' NM_027855.3' NM_027855.3 Length: 223SGGSRAAALLLVLGVERALALPEICTLCPGGMHNLSRVAAYCEDTSKLMQARCCLNQKGTILGLDLQNCSLKDPG 8AYTAIIIDLQANPLKDDLANTFRGFTQLQTLILPQDVPCPGGSNAWDNVTSFKDKQICQGQRDLCNSTGSPEMCP 16ASDGPGLLQCVCADGFHGYKCMRQGSFSLLMFFGILGSTTLAISILLWGTQRRKAKAS.................................N.................................N....... 8...............................................N........................... 16.......................................................... 24shold=0.5)
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R329.2;Q811.4

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