【摘要】：目的利用基于RNA-seq的二代測序技術(shù)分析日本血吸蟲侵襲前后的湖北釘螺轉(zhuǎn)錄組的表達(dá),為進(jìn)一步完善湖北釘螺基因結(jié)構(gòu)信息及挖掘血吸蟲感染釘螺相關(guān)分子標(biāo)記提供實驗數(shù)據(jù)。方法分別提取日本血吸蟲毛蚴感染后第7天、第30天湖北釘螺組織和正常釘螺組織的總RNA,經(jīng)RNA質(zhì)量檢測合格后建立e DNA文庫,利用Illumina NextSeq500測序儀進(jìn)行測序得到原始序列數(shù)據(jù);測序數(shù)據(jù)經(jīng)過濾和de novo拼接后,進(jìn)一步開展轉(zhuǎn)錄本注釋和聚類分析。結(jié)果共得到63 686條廣泛通用的基因數(shù)據(jù)(Unique gene,Unigene),基因功能注釋及功能群組聚類分析結(jié)果顯示,一般性功能蛋白質(zhì)編碼Unigene占比最多(15.36%),其次是信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(11.75%)、轉(zhuǎn)錄后修飾(8.89%)等,此外還有較高比例的未知功能蛋白質(zhì)編碼Unigene(12.20%)。結(jié)論日本血吸蟲侵襲后的湖北釘螺轉(zhuǎn)錄組表達(dá)信息顯示有數(shù)個基因呈顯著性上調(diào)或下調(diào)表達(dá),本研究為從分子水平研究湖北釘螺與血吸蟲感染相互作用奠定了基礎(chǔ)。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前4條

1 操治國;趙亞娥;汪天平;;湖北釘螺分類鑒定技術(shù)研究進(jìn)展[J];中國血吸蟲病防治雜志;2015年01期

2 崔斌;霍志萍;楊坤;張麗;楊頻;尤平;李石柱;;長江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J];中國血吸蟲病防治雜志;2013年06期

3 劉琴;李石柱;張儀;周曉農(nóng);;日本血吸蟲毛蚴侵襲前后湖北釘螺差異表達(dá)cDNA文庫的構(gòu)建與分析[J];中國血吸蟲病防治雜志;2010年06期

4 李石柱;王藝秀;劉琴;呂山;王強;吳纓;張儀;周曉農(nóng);;湖北釘螺線粒體基因組全序列測定研究[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2009年04期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 許樹俊;王康;張敏紅;陳文捷;管國宇;劉曼曼;徐蕾;孫恩濤;;3種方法提取湖北釘螺RNA的比較[J];中國血吸蟲病防治雜志;2017年03期

2 王康;許樹俊;王逸梟;陳文捷;王憶楠;于芬芳;王少圣;孫恩濤;周書林;;釘螺線粒體基因組DNA提取方法的優(yōu)化及比較[J];中國血吸蟲病防治雜志;2017年02期

3 秦志強;莫筱瑾;官威;李石柱;;日本血吸蟲侵襲前后的湖北釘螺轉(zhuǎn)錄組研究I RNA-Seq數(shù)據(jù)的de novo拼接[J];中國血吸蟲病防治雜志;2017年03期

4 何健;繆峰;楊坤;趙長磊;劉新;;基于微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的山東微山湖區(qū)放養(yǎng)釘螺遺傳結(jié)構(gòu)分析[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2016年03期

5 操治國;趙亞娥;汪天平;;湖北釘螺分類鑒定技術(shù)研究進(jìn)展[J];中國血吸蟲病防治雜志;2015年01期

6 崔斌;霍志萍;楊坤;張麗;楊頻;尤平;李石柱;;長江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J];中國血吸蟲病防治雜志;2013年06期

7 馬琳;李石柱;楊頻;尤平;周曉農(nóng);;湖北釘螺基因組5種抽提方法的比較[J];中國病原生物學(xué)雜志;2011年02期

8 馬琳;趙玲;李石柱;尤平;周曉農(nóng);;景觀遺傳學(xué)及其在湖北釘螺研究中的應(yīng)用[J];中國血吸蟲病防治雜志;2010年06期

9 周曉農(nóng);李石柱;劉琴;張儀;;釘螺遺傳學(xué)及其生物學(xué)特性的研究進(jìn)展[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2009年05期

10 崔斌;張麗;楊坤;尤平;李石柱;;分子系統(tǒng)地理學(xué)及其在湖北釘螺中的研究進(jìn)展[J];國際醫(yī)學(xué)寄生蟲病雜志;2013年02期

【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 蘇正明;劉建兵;蔡順祥;周曉蓉;陳莉;單曉偉;張娟;;2013年湖北省國家監(jiān)測點血吸蟲病疫情監(jiān)測分析[J];熱帶病與寄生蟲學(xué);2014年03期

2 王喜軍;堵芳;馬君;王挺;盛曉楓;劉毅;劉偉;;長沙市野生態(tài)動物園斑馬蜱pcox1基因擴增及序列分析[J];中國動物傳染病學(xué)報;2014年04期

3 張誠;孫成松;梁嶺;何家昶;汪奇志;汪峰峰;尹曉梅;張世清;汪天平;;1992~2012年安徽省長江流域螺情變化趨勢分析[J];熱帶病與寄生蟲學(xué);2014年02期

4 花婧;鄭斯竹;安榆林;楊曉軍;;基于線粒體COⅠ基因的大小蠹屬昆蟲DNA條形碼研究[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年03期

5 李勝明;任光輝;賀宏斌;李援;劉宗權(quán);丁良;夏蒙;董如蘭;李岳生;;洞庭湖生態(tài)經(jīng)濟區(qū)建設(shè)對血吸蟲病流行的影響及對策[J];熱帶病與寄生蟲學(xué);2014年01期

6 操治國;汪天平;張世清;沙建軍;黃浩;朱磊;;安徽省血吸蟲病潛在流行區(qū)疫情輸入的風(fēng)險評估[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2014年01期

7 崔斌;霍志萍;楊坤;張麗;楊頻;尤平;李石柱;;長江下游3省湖北釘螺不同地理種群的群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J];中國血吸蟲病防治雜志;2013年06期

8 操治國;高鵬;汪天平;張世清;沙建軍;黃浩;朱磊;楊衛(wèi)平;;安徽巢湖地區(qū)血吸蟲病傳播的風(fēng)險評估[J];熱帶病與寄生蟲學(xué);2013年04期

9 張代臻;丁鴿;周婷婷;楊文娟;李佳;彭旭;唐伯平;;黃海海域口蝦蛄種群的遺傳多樣性[J];動物學(xué)雜志;2013年02期

10 許靜;李石柱;黃軼昕;操志國;涂祖武;吳成果;繆峰;黨輝;張利娟;陳朝;王立英;郭家鋼;周曉農(nóng);;中國血吸蟲病潛在流行區(qū)的風(fēng)險評估[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2012年06期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王文達(dá);實驗室飼養(yǎng)片山湖北釘螺的新法[J];國外醫(yī)學(xué)(寄生蟲病分冊);1981年04期

2 張儀,GeorgeM.Davis,劉和香,馮婷;應(yīng)用同工酶技術(shù)研究我國湖北釘螺(腹足綱:麂眼螺超科:圓口螺科)不穩(wěn)定螺群內(nèi)的遺傳變異(續(xù))(英文)[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2000年02期

3 胡纓,黎學(xué)銘;湖北釘螺分類學(xué)研究進(jìn)展[J];廣西預(yù)防醫(yī)學(xué);2005年01期

4 周書林;;湖北釘螺體內(nèi)酚氧化酶及其組織學(xué)定位[J];中國血吸蟲病防治雜志;2006年04期

5 李石柱;王強;錢穎駿;張儀;周曉農(nóng);;中國大陸湖北釘螺種下分化研究進(jìn)展[J];中國血吸蟲病防治雜志;2009年02期

6 李石柱;王藝秀;劉琴;呂山;王強;吳纓;張儀;周曉農(nóng);;湖北釘螺線粒體基因組全序列測定研究[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2009年04期

7 李石柱;王藝秀;馬雅軍;王強;劉琴;吳纓;呂山;張儀;周曉農(nóng);;湖北釘螺多態(tài)微衛(wèi)星DNA位點篩選和特征初步分析[J];中國血吸蟲病防治雜志;2010年02期

8 馬琳;趙玲;李石柱;尤平;周曉農(nóng);;景觀遺傳學(xué)及其在湖北釘螺研究中的應(yīng)用[J];中國血吸蟲病防治雜志;2010年06期

9 馬琳;李石柱;楊頻;尤平;周曉農(nóng);;湖北釘螺基因組5種抽提方法的比較[J];中國病原生物學(xué)雜志;2011年02期

10 夏英定;汪世平;劉雪琴;高冬梅;李慶華;吳平;陳秀春;馮其梅;周云飛;張樹菊;;湖北釘螺人工感染、室內(nèi)傳代與模擬野外飼養(yǎng)的研究(英文)[J];中南大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2011年01期

相關(guān)會議論文 前10條

1 歐陽頤;黎學(xué)銘;林睿;胡纓;張鴻滿;;廣西地理株湖北釘螺基因變異及種群變遷[A];全國寄生蟲學(xué)與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2008年

2 胡相;;安徽省宣城地區(qū)湖北釘螺調(diào)查分析[A];中國動物學(xué)會、中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第三次代表大會暨第四次學(xué)術(shù)討論會論文集[C];1988年

3 李石柱;王強;錢穎駿;周曉農(nóng);;湖北釘螺指名亞種不同地理群體遺傳多樣性研究[A];中國動物學(xué)會·中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第九次會員代表大會暨第十五次學(xué)術(shù)討論會會議摘要集[C];2011年

4 彭德華;;湖北釘螺生殖細(xì)胞的透射電鏡觀察[A];中國動物學(xué)會、中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第三次代表大會暨第四次學(xué)術(shù)討論會論文集[C];1988年

5 張儀;劉和香;馮婷;馮正;;中國湖北釘螺(湖北亞種)實驗株釘螺COI、Cyb基因分析[A];貝類學(xué)會第七次會員代表大會暨第十一次學(xué)術(shù)討論會摘要[C];2003年

6 彭延;蔣明森;鐘沁萍;桂建芳;董惠芬;;湖北釘螺細(xì)胞原代培養(yǎng)的初步研究[A];中國動物學(xué)會全國第九次寄生蟲學(xué)學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2003年

7 朱丹;周曉農(nóng);吳曉華;王強;;META&MBO復(fù)方劑殺滅湖北釘螺作用的研究[A];貝類學(xué)會第七次會員代表大會暨第十一次學(xué)術(shù)討論會摘要[C];2003年

8 劉松泉;;湖北釘螺自然消長及血吸蟲感染性的時間分布規(guī)律[A];中國動物學(xué)會、中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第三次代表大會暨第四次學(xué)術(shù)討論會論文集[C];1988年

9 朱丹;張儀;劉和香;周曉農(nóng);張功華;張世清;操治國;吳維鐸;李文新;;HL殺滅湖北釘螺效果觀察[A];中國動物學(xué)會、中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第八次會員代表大會暨第十三次全國貝類學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2007年

10 馬憲亮;張儀;;湖北釘螺硫氧還蛋白過氧化物酶基因全長cDNA克隆、表達(dá)與純化[A];中國動物學(xué)會·中國海洋湖沼學(xué)會貝類學(xué)分會第九次會員代表大會暨第十五次學(xué)術(shù)討論會會議摘要集[C];2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 李石柱;應(yīng)用現(xiàn)代生物信息技術(shù)對湖北釘螺遺傳多樣性的研究[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2009年

2 汪浩;湖北釘螺慢性感染階段免疫防御相關(guān)基因的篩選和鑒定[D];武漢大學(xué);2012年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前8條

1 高倩;湖北釘螺髓樣分化因子88的鑒定及其在抗血吸蟲感染中的地位[D];武漢大學(xué);2017年

2 馬憲亮;湖北釘螺硫氧還蛋白過氧化物酶基因分子克隆、表達(dá)與蛋白活性分析[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2012年

3 馬琳;中國大陸湖北釘螺不同地理景觀群體遺傳變異分析[D];陜西師范大學(xué);2011年

4 崔斌;長江中下游地區(qū)湖北釘螺小尺度景觀群體的種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D];陜西師范大學(xué);2014年

5 黃春蘭;湖北釘螺糖原濃度節(jié)律性變化和溶菌酶活力的研究[D];皖南醫(yī)學(xué)院;2014年

6 蔡新;食物與溫度對湖北釘螺生長發(fā)育及繁殖率的影響研究[D];湖北大學(xué);2012年

7 白潔;云南省血吸蟲病流行區(qū)湖北釘螺COI基因序列分析[D];昆明醫(yī)學(xué)院;2008年

8 郭俊濤;湖北釘螺微衛(wèi)星遺傳變異的小尺度空間自相關(guān)分析[D];復(fù)旦大學(xué);2009年

，

本文編號：2580454