本文選題：DNA混合池 + EM算法　； 參考：《黑龍江大學(xué)》2012年碩士論文

【摘要】：隨著社會科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,醫(yī)療水平日新月異.層出不窮的診斷手法為疾病治療提供了更加準(zhǔn)確的信息,越來越多由基因引起的疾病被人們所發(fā)現(xiàn),這就使得人們對基因疾病的研究愈加重視.一般來說,單體型通常被認(rèn)為是不同SNPs位點(diǎn)連鎖信息的豐富攜帶者,因此估計(jì)單體型頻率的研究價(jià)值極大.目前人們的研究大多集中在對多個位點(diǎn)且每個位點(diǎn)有兩個等位基因的單體型上,但是現(xiàn)在通過臨床診斷,大量由多個等位基因控制的疾病被人們所發(fā)現(xiàn),因此人們對多等位基因單體型頻率的研究重視程度越來越高. 如何來研究多等位基因的單體型頻率是一個重要課題,本文從減少工作量,降低研究成本以及縮短研究周期的角度出發(fā),利用DNA池的思想方法,借助EM算法估計(jì)出多等位基因單體型的頻率.文中每個DNA池中放入兩個樣本,重點(diǎn)研究單體型有兩個位點(diǎn)且每個位點(diǎn)有三個等位基因的情況.通過對DNA混合池的觀測得出觀測數(shù)據(jù),進(jìn)而利用EM算法的思想對多等位基因單體型的頻率進(jìn)行估計(jì),最后利用統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行模擬研究.
[Abstract]:With the development of social science and technology, medical treatment level changes with each passing day. Endless diagnostic techniques provide more accurate information for the treatment of diseases. More and more diseases caused by genes have been discovered, which makes people pay more attention to the research of genetic diseases. Haplotypes are generally considered to be rich carriers of linkage information at different SNPs loci, so the study of haplotype frequency estimation is of great value. At present, most studies focus on haplotypes with multiple loci and two alleles per locus, but now, through clinical diagnosis, a large number of diseases controlled by multiple alleles have been discovered. Therefore, people pay more and more attention to the study of multi-allele haplotype frequency. How to study the haplotype frequency of multiple alleles is an important subject. In this paper, from the angle of reducing the workload, reducing the research cost and shortening the research period, we use the thought method of DNA pool. The frequency of multiallelic haplotype was estimated by EM algorithm. In this paper, we put two samples into each DNA pool, and focus on the situation that haplotype has two loci and each locus has three alleles. The observed data are obtained from the observation of DNA mixing cell, and then the frequency of multi-allelic haplotype is estimated by using EM algorithm. Finally, the simulation research is carried out by using statistical software.
【學(xué)位授予單位】：黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號】：R346

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：1981179