本文選題：紅系分化 + TGIF�。� 參考：《發(fā)育醫(yī)學(xué)電子雜志》2016年04期

【摘要】：目的篩選潛在的促紅系分化因子,并驗(yàn)證其對(duì)紅系分化的促進(jìn)作用,探討促分化機(jī)制。方法首先通過(guò)對(duì)高通量組學(xué)測(cè)序數(shù)據(jù)的分析,找到潛在紅系調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子;之后在紅系分化的細(xì)胞模型TF-1細(xì)胞系中干擾該因子的表達(dá),觀察該因子的異常表達(dá)對(duì)紅系分化的影響;進(jìn)一步對(duì)目的基因敲低的細(xì)胞系進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,同時(shí)利用生物信息學(xué)的手段分析受影響的紅系相關(guān)因子以及通路。結(jié)果高通量組學(xué)測(cè)序分析得到潛在促紅系分化調(diào)控因子TGIF1。TGIF1敲低細(xì)胞中,ε-珠蛋白、γ-珠蛋白、紅系特異轉(zhuǎn)錄因子(GATA1、KLF1)、以及紅系細(xì)胞表面特異糖蛋白標(biāo)志分子CD235a的m RNA表達(dá)量及血紅蛋白濃度均低于對(duì)照組。TGIF1過(guò)表達(dá)細(xì)胞的γ-珠蛋白m RNA高于對(duì)照組;促紅細(xì)胞生成素誘導(dǎo)3天后,TGIF1過(guò)表達(dá)細(xì)胞表面CD235a的表達(dá)高于空白細(xì)胞組。進(jìn)一步對(duì)穩(wěn)定敲低TGIF1的TF-1細(xì)胞系進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,發(fā)現(xiàn)Smad復(fù)合物和相關(guān)靶基因表達(dá)上調(diào),而GATA1和ALAS2的表達(dá)量則降低。結(jié)論 TGIF1是一個(gè)促紅系分化的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,可能通過(guò)影響轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β(transforming growth factor-β,TGFβ)通路中Smad復(fù)合物和相關(guān)靶基因的表達(dá),或通過(guò)影響GATA1和ALAS2的表達(dá)來(lái)調(diào)控紅系分化過(guò)程。
[Abstract]:Objective to screen the potential Erythroid differentiation factors (Erythroid differentiation factors) and to test their promoting effect on erythroid differentiation and to explore the mechanism of Erythroid differentiation. Methods by analyzing the high-throughput sequencing data, we found the potential erythroid regulatory transcription factor, and then interfered with the expression of the factor in the erythroid differentiation cell model TF-1 cell line. To observe the effect of abnormal expression of this factor on erythroid differentiation, to further sequence the target gene knockout cell lines, and to analyze the affected erythroid related factors and pathways by bioinformatics. Results 蔚 -globin and 緯 -globin were detected in TGIF1.TGIF1 knockout cells of potential erythroid differentiation regulators by high-throughput sequencing. The expression of m RNA and hemoglobin concentration of erythroid specific transcription factor GATA1C KLF1and erythroid cell surface specific glycoprotein marker CD235a were lower than those of the control group. The expression of 緯 -globin m RNA in the over-expressed cells was higher than that in the control group. After 3 days of erythropoietin induction, the expression of CD235a on the surface of TGIF1 overexpression cells was higher than that of blank cells. The high throughput transcriptome sequencing analysis of TF-1 cell lines with stable knockout TGIF1 revealed that the expression of Smad complex and related target genes was up-regulated while the expression of GATA1 and ALAS2 was decreased. Conclusion TGIF1 is a transcriptional regulator of erythroid differentiation. It may affect the expression of Smad complex and related target genes in transforming growth factor 尾 -transforming growth factor- 尾 (TGF- 尾) pathway, or regulate the process of erythroid differentiation by affecting the expression of GATA1 and ALAS2.
【作者單位】： 中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所中國(guó)科學(xué)院基因組學(xué)與信息重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;中國(guó)科學(xué)院大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;中國(guó)科學(xué)院大學(xué)中丹學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31471115、31401160、81670109)
【分類號(hào)】：R331

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本文編號(hào)：1962484