本文選題：單增李斯特菌 + 比較基因組學(xué)��； 參考：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年02期

【摘要】：單增李斯特菌是一種重要的人畜共患病原菌,對(duì)食品安全和人類健康造成了嚴(yán)重威脅,但現(xiàn)階段對(duì)其進(jìn)化規(guī)律的研究仍相對(duì)較少。本研究運(yùn)用Illumina測(cè)序技術(shù)對(duì)一株中國(guó)單增李斯特菌WaX12的基因組進(jìn)行了測(cè)定,并通過(guò)比較基因組學(xué)分析了該菌的微進(jìn)化規(guī)律。結(jié)果表明:WaX12的基因組與Finland 1998相似度最高,但兩者基因組間存在135個(gè)基因的差異,主要集中在WaX12的原噬菌體上。進(jìn)一步分析可知,WaX12的基因組攜帶5個(gè)原噬菌體,除原噬菌體1外,其余4個(gè)原噬菌體均未存在于Finland 1998中。原噬菌體3和原噬菌體5來(lái)源于其他單增李斯特菌的基因組,而原噬菌體2和原噬菌體4則分別來(lái)自于大腸桿菌和糞球菌。由此可見(jiàn),原噬菌體是該單增李斯特菌微進(jìn)化的主要原因,而這種微進(jìn)化的發(fā)生不僅限于同一種屬的細(xì)菌之間,還可能源于不同種屬細(xì)菌間的基因轉(zhuǎn)移。
[Abstract]:Listeria monocytogenes (Listeria monocytogenes) is an important zoonotic pathogen which poses a serious threat to food safety and human health.In this study, the genome of a Chinese Listeria monocytogenes WaX12 was determined by Illumina sequencing, and its microevolution was analyzed by comparative genomics.The results showed that the genome of 1: WaX12 had the highest similarity to that of Finland 1998, but the difference of 135 genes between the two genomes was mainly concentrated on the prophage of WaX12.Further analysis showed that the genome of WaX12 carried 5 prophages, except for prophage 1, none of the other 4 prophages existed in Finland 1998.Prophage 3 and prophage 5 were derived from the genomes of other Listeria monocytogenes, while prophage 2 and phage 4 were derived from Escherichia coli and faecal coccus, respectively.Therefore, the bacteriophage is the main reason for the microevolution of Listeria monocytogenes, and this microevolution is not only limited to the same species of bacteria, but also may be due to gene transfer between different species of bacteria.
【作者單位】： 上海海洋大學(xué)食品學(xué)院;農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品貯藏保鮮質(zhì)量安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估實(shí)驗(yàn)室;浙江工業(yè)大學(xué)生物與環(huán)境工程學(xué)院;上海交通大學(xué)微生物代謝重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室與生命科學(xué)和生物技術(shù)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然基金(31271870) 上海市科委項(xiàng)目(14DZ1205100,14320502100) 上海農(nóng)業(yè)科技發(fā)展重點(diǎn)項(xiàng)目(2014,3-5;2015,4-8) 上海海洋大學(xué)優(yōu)秀研究生培育計(jì)劃共同資助
【分類號(hào)】：R378;Q78

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本文編號(hào)：1743971