miRNA-140-5p在人骨髓間充質(zhì)干細胞成脂分化中的表達及其靶基因的預測
本文關鍵詞: 人骨髓間充質(zhì)干細胞 成脂分化 mi RNA--p 白血病抑制因子受體 出處:《南方醫(yī)科大學學報》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的篩選出人骨髓間充質(zhì)干細胞(h MSCs)成脂分化中具有潛在價值的mi RNA及其靶基因,為人類成骨細胞與脂肪細胞分化平衡調(diào)控機制的深入研究提供有力實驗依據(jù)。方法收集h MSCs成脂分化過程中的0、7、14、21 d的細胞樣品,應用mi RNA芯片和轉錄組測序(m RNA-seq)技術,分析4個點細胞中mi RNA和m RNA的表達水平,并將mi RNA與m RNA的表達趨勢進行關聯(lián)分析,聚焦具有研究價值的mi RNA與m RNA相互調(diào)控關系,同時,采用Target Scan、Pic Tar和mi Randa等數(shù)據(jù)庫進行靶基因的預測。結果發(fā)現(xiàn)mi R-140-5p在成脂分化中表達量呈逐漸下降的趨勢,而白血病抑制因子受體(LIFR)表達量呈逐漸升高趨勢,二者呈現(xiàn)負調(diào)控的對應關系。同時經(jīng)3個靶基因數(shù)據(jù)庫預測,LIFR為mi R-140-5p共有的靶基因。結論 mi RNA-140-5p可能與人骨髓間充質(zhì)干細胞的成脂分化密切相關,且通過調(diào)控其靶基因LIFR的表達而參與成脂分化。
[Abstract]:Objective to screen the potential value of mi RNA and its target gene in adipogenic differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells (MSCs). Methods Human osteoblasts and adipocytes were collected for 21 days during the adipogenic differentiation of human osteoblasts and adipocytes, and the cell samples were collected for 21 days. Mi RNA microarray and transcriptome sequencing mRNA-seq) technique were used to study the mechanism of differentiation of human osteoblasts and adipocytes. The expression level of mi RNA and m RNA in four point cells was analyzed, and the expression trend of mi RNA and m RNA was analyzed. The relationship between mi RNA and m RNA was focused on, and the relationship between mi RNA and m RNA was also studied. The results showed that the expression of miR-140-5p decreased gradually in adipogenic differentiation, while the expression of leukemia inhibitory factor receptor (LIFR) increased gradually by using the databases such as Target Scano Pic Tar and mi Randa, and the results showed that the expression level of miR-140-5p decreased gradually in adipogenic differentiation, while the expression of leukemia inhibitory factor receptor (LIFR) increased gradually. At the same time, the LIFR was predicted to be a target gene shared by mi R-140-5p by three target gene databases. Conclusion mi RNA-140-5p may be closely related to the adipogenic differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells. Moreover, it participates in adipogenic differentiation by regulating the expression of its target gene LIFR.
【作者單位】: 江西省系統(tǒng)生物醫(yī)學重點實驗室;江西省九江學院基礎醫(yī)學院病原生物學教研室;江西省九江學院附屬醫(yī)院臨床技能中心;江西省南昌大學附屬九江醫(yī)院內(nèi)分泌科;
【基金】:國家自然科學基金(81460221,81260283,81160113) 江西省自然科學基金(20161BAB205197)~~
【分類號】:R329.2
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,本文編號:1556035
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