本文關(guān)鍵詞： 罕見(jiàn)變異 關(guān)聯(lián)性分析 logistic混合模型 似然比檢驗(yàn)　出處：《鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2017年02期 　論文類(lèi)型：期刊論文

【摘要】：目的:發(fā)展適用于病例-對(duì)照設(shè)計(jì)的似然比罕見(jiàn)變異關(guān)聯(lián)性分析方法。方法:在logistic混合模型的框架下基于PQL算法建立偽數(shù)據(jù),將二分類(lèi)表型轉(zhuǎn)化為連續(xù)型表型的關(guān)聯(lián)性分析,然后借助線性混合模型的方差成分檢驗(yàn)執(zhí)行關(guān)聯(lián)性分析。采用Monte Carlo模擬評(píng)價(jià)該方法的有效性,并與現(xiàn)有方法進(jìn)行對(duì)比。結(jié)果:模擬顯示,在不同情況下包括似然比檢驗(yàn)在內(nèi)的所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)都能有效控制Ⅰ型錯(cuò)誤;在效應(yīng)方向相同情況下,Burden檢驗(yàn)、SKAT-O和Mi ST的統(tǒng)計(jì)效能高;在效應(yīng)方向不同的情況下似然比檢驗(yàn)優(yōu)于其他方法。結(jié)論:基于logistic混合模型和PQL算法的似然比檢驗(yàn)可有效用于病例-對(duì)照設(shè)計(jì)的罕見(jiàn)變異關(guān)聯(lián)性分析。
[Abstract]:Objective: to develop a method of likelihood ratio rare variant correlation analysis for case-control design. Methods: pseudo data based on PQL algorithm was established under the framework of logistic mixed model to transform the two phenotypes into continuous phenotypic correlation analysis. Then the variance component test of the linear mixed model is used to perform the correlation analysis. The effectiveness of the method is evaluated by Monte Carlo simulation and compared with the existing methods. All statistical tests, including likelihood ratio test, can effectively control type I errors under different conditions, and have high statistical efficacy of SKAT-O and Mi St under the same effect direction. Conclusion: the likelihood ratio test based on logistic mixed model and PQL algorithm can be effectively used in the rare mutation correlation analysis of case-control design.
【作者單位】： 徐州醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目81402765 國(guó)家統(tǒng)計(jì)局全國(guó)統(tǒng)計(jì)科學(xué)研究項(xiàng)目2014LY112
【分類(lèi)號(hào)】：R394

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本文編號(hào)：1504203