云南省瑞麗市2016年登革病毒包膜蛋白基因進(jìn)化特征分析
本文關(guān)鍵詞:云南省瑞麗市2016年登革病毒包膜蛋白基因進(jìn)化特征分析 出處:《病毒學(xué)報(bào)》2017年06期 論文類型:期刊論文
更多相關(guān)文章: 登革病毒(DENV) 包膜蛋白 基因 系統(tǒng)進(jìn)化分析
【摘要】:為闡明云南省德宏州瑞麗市2016年登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株包膜蛋白(Envelope protein,E)基因進(jìn)化特征及其血清型、基因型和流行病學(xué)特點(diǎn)。采集登革熱患者急性期血清標(biāo)本,用RT-PCR法檢測DENV核酸,用C6/36細(xì)胞培養(yǎng)法分離病毒,并進(jìn)行DENV C/PrM和E基因核苷酸序列測定,用MEGA6.0軟件鄰接法(Neighbor-Joining)進(jìn)行E基因系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果從瑞麗市2016年登革熱患者血清中分離到25株DENV(本地感染病例15株和緬甸輸入性病例10株),并獲得這25株病毒的E基因核苷酸序列,系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,14株為DENV血清型1型(DENV-1)的基因I型,2株為DENV-2亞洲基因I型,5株為DENV-3基因I型,4株為DENV-4基因I型。這些新分離株與2013~2015年瑞麗市(11DENV-1、4DENV-2和2DENV-4)和臨滄市(2DENV-1)相同血清型DENV代表株的基因型和進(jìn)化群相一致,而與西雙版納州2013年DENV-3基因II型和2015年DENV-2全球基因型不同。所有瑞麗市DENV流行株均與緬甸等東南亞國家流行株具有較近的親緣關(guān)系。這4種血清型DENV廣泛分布于中緬兩側(cè)邊境地區(qū)。本研究證實(shí),2016年我國瑞麗市存在著4種血清型DENV的流行,其中DENV-1、DENV-2和DENV-4與2013~2015年瑞麗市同血清型流行株的基因型及其進(jìn)化群相同,DENV-3為2016年首次出現(xiàn)本地流行。所有血清型病毒的傳播來源均為緬甸北部邊境地區(qū),應(yīng)加強(qiáng)中緬兩側(cè)邊境地區(qū)登革熱聯(lián)防聯(lián)控工作。
[Abstract]:To elucidate the envelope protein Envelope protein of dengue virus (Dengue virus) in 2016 in Ruili City, Dehong Prefecture, Yunnan Province. The evolutionary characteristics, serotype, genotype and epidemiological characteristics of the gene were collected, and DENV nucleic acid was detected by RT-PCR method in the serum samples of patients with dengue fever in acute stage. The virus was isolated by C6 / 36 cell culture, and the nucleotide sequences of DENV C / PrM and E genes were determined. Using MEGA6.0 Software adjacency method (Neighbor-Jointing). The E gene phylogenetic analysis was carried out. Results 25 strains of DENVwere isolated from the sera of dengue fever patients in 2016 in Ruili City (15 cases of local infection and 10 strains of imported cases from Myanmar). The nucleotide sequences of E gene of the 25 strains were obtained. Phylogenetic analysis showed that 14 of the 25 strains were DENV serotype 1 (DENV-1) gene type I. 2 strains were DENV-2 Asian gene type I and 5 strains belonged to DENV-3 gene type I. The four strains were DENV-4 gene type I. these new isolates were compared with 11DENV-1 in Ruili city from 2013 to 2015. 4DENV-2 and 2DENV-4) the same serotypes of DENV were identical in genotype and phylogenetic group. But different from DENV-3 gene type II in 2013 and DENV-2 global genotype in 2015 in Xishuangbanna. All the DENV epidemic strains in Ruili city were similar to those in Burma and other Southeast Asian countries. These four serotypes of DENV are widely distributed in the border areas between China and Myanmar. In 2016, there were four serotypes of DENV in Ruili city, including DENV-1. The genotypes and phylogenetic groups of DENV-2 and DENV-4 were the same as those of the same serotype epidemic strains in Ruili city from 2003 to 2015. DENV-3 is the first local epidemic in 2016. All seroviruses are transmitted from the northern border areas of Myanmar. The joint control of dengue fever should be strengthened in the border areas between China and Myanmar.
【作者單位】: 成都軍區(qū)疾病預(yù)防控制中心;瑞麗市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:國家十三五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(項(xiàng)目號:2016YFC1200100);題目:重要新發(fā)突發(fā)病原體發(fā)生與播散機(jī)制研究 中國博士后基金項(xiàng)目(項(xiàng)目號:2016T91009);題目:云南邊境重要蟲媒傳染病相關(guān)病毒可視化基因芯片研究~~
【分類號】:R373
【正文快照】: 登革熱(Dengue fever)是由登革病毒(Denguevirus,DENV)1、2、3和4血清型(Serotype,DENV-1、2、3、4)引起的一種急性傳染病,埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白紋伊蚊(Aedes albopictus)是主要傳播媒介[1-3]。登革熱廣泛分布于全球熱帶和亞熱帶地區(qū),東南亞地區(qū)為本病地方性流行區(qū)[1-4
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,本文編號:1369621
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