基于高通量測(cè)序分析不同瀏陽(yáng)豆豉中真菌的多樣性
發(fā)布時(shí)間:2023-05-19 17:37
為比較不同品牌的瀏陽(yáng)豆豉中真菌分布情況,采用ITS高通量測(cè)序?qū)?種品牌的瀏陽(yáng)豆豉(LJ,TPQ,TMS,YPX)中真菌組成進(jìn)行檢測(cè),并通過(guò)韋恩圖、熱圖和主坐標(biāo)分析(PCo A)對(duì)其結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明,4種豆豉存在共有的146個(gè)操作分類單元(OTUs),TPQ豆豉樣品的真菌相對(duì)豐度最大,LJ豆豉樣品最低。4種瀏陽(yáng)豆豉均以子囊菌門(Ascomycota)、毛霉亞門(Mucoromycota)為主要菌群門類,LJ和YPX豆豉樣品中均以曲霉屬(Aspergillus)為主要菌屬,其中LJ豆豉中曲霉屬相對(duì)豐度最高(91.4%),TPQ豆豉樣品中小囊菌屬(Microascus)相對(duì)豐度最高(49.1%)。熱圖聚類結(jié)果反映出各品牌瀏陽(yáng)豆豉中具有其特有的菌屬,橫梗霉屬(Lichtheimia)主要存在于TMS與LJ豆豉樣品中,嗜熱菌屬(Thermomyces)在TPQ豆豉樣品中含量最高,曲霉屬(Aspergillus)、單端孢屬(Trichothecium)和根霉屬(Rizopus)均在LJ中含量較高,木霉屬(Trichoderma)、單端孢屬(Trichothecium)、青霉屬(Penicil...
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 儀器與設(shè)備
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 基因組DNA提取
1.3.2 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增
1.3.3 Illumina Miseq測(cè)序和數(shù)據(jù)處理
1.3.4 數(shù)據(jù)處理
1.3.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 樣品中真菌群落共享和獨(dú)有的操作分類單元和韋恩圖分析
2.2 豆豉中真菌多樣性分析
2.2.1 Alpha多樣性分析
2.2.2 豆豉中真菌的群落情況
2.2.3 豆豉中真菌數(shù)量的聚類情況
2.2.4 主坐標(biāo)分析
3 結(jié)論
本文編號(hào):3819789
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 儀器與設(shè)備
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 基因組DNA提取
1.3.2 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增
1.3.3 Illumina Miseq測(cè)序和數(shù)據(jù)處理
1.3.4 數(shù)據(jù)處理
1.3.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 樣品中真菌群落共享和獨(dú)有的操作分類單元和韋恩圖分析
2.2 豆豉中真菌多樣性分析
2.2.1 Alpha多樣性分析
2.2.2 豆豉中真菌的群落情況
2.2.3 豆豉中真菌數(shù)量的聚類情況
2.2.4 主坐標(biāo)分析
3 結(jié)論
本文編號(hào):3819789
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