藻藍(lán)色素蛋白是我國(guó)認(rèn)可的天然食用色素,可用于多種低溫食品的著色;它同時(shí)也是一種優(yōu)良的功能性色素蛋白。許多研究表明,藻藍(lán)蛋白具有顯著的腫瘤抑制作用,能夠抑制非小細(xì)胞肺癌的增殖和遷移。為深入探究藻藍(lán)蛋白抑制非小細(xì)胞肺癌活性的調(diào)控機(jī)制,本研究以A549細(xì)胞為代表,采用高通量小分子RNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)藻藍(lán)蛋白處理前后的細(xì)胞進(jìn)行miRNA的篩選分析。結(jié)果表明,已知和新預(yù)測(cè)的miRNA被成功測(cè)序;通過統(tǒng)計(jì)學(xué)分析篩選得到了136個(gè)藻藍(lán)蛋白處理后具有表達(dá)差異的miRNA,其中74個(gè)顯著上調(diào),62個(gè)顯著下調(diào)。根據(jù)這些差異miRNA在不同樣本中的表達(dá)情況,可以聚類為4類不同的表達(dá)模式;實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)對(duì)上述miRNA進(jìn)行表達(dá)量的驗(yàn)證,與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果相吻合;此外,miRNA靶基因的Gene Ontology注釋和功能富集分析結(jié)果顯示,與細(xì)胞增殖信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控過程相關(guān)的靶蛋白例如PAK4、MAPK13、RASSF10等均被預(yù)測(cè)為差異miRNA的全新靶點(diǎn),可能在藻藍(lán)蛋白抑制非小細(xì)胞肺癌增殖過程中起到重要的調(diào)控作用。不同于傳統(tǒng)的mRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,本研究采用小分子miRNA測(cè)序深入探究了藻藍(lán)蛋白抑制肺... 

【文章來源】：食品科學(xué). 2020,41(21)北大核心EICSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

藻藍(lán)蛋白對(duì)A549細(xì)胞體外增殖活性的影響

部分差異mi RNA的q PCR驗(yàn)證

2.7 mi RNA的靶基因功能分析結(jié)果使用mi Randa軟件對(duì)篩選出的mi RNA進(jìn)行靶基因的預(yù)測(cè)分析，共預(yù)測(cè)得到了5 186個(gè)潛在的靶基因。首先對(duì)這些靶基因進(jìn)行了GO注釋分析，結(jié)果如圖7所示。GO注釋可將基因分為三大類：生物過程、細(xì)胞組分和分子功能。在生物過程中，靶基因功能主要集中在代謝調(diào)控、應(yīng)激反應(yīng)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等；在細(xì)胞組分和分子功能中，主要集中在分子相互作用以及酶催化活性等。GO功能注釋提供了靶基因的功能分類，但缺乏具體的功能信息，因此，為全面分析受到藻藍(lán)蛋白調(diào)控mi RNA靶基因的功能，又對(duì)這些基因進(jìn)行了GO富集分析（圖8）。結(jié)果顯示，細(xì)胞活動(dòng)相關(guān)的許多生物學(xué)過程都在GO富集分析中出現(xiàn)顯著性差異，主要包括細(xì)胞離子轉(zhuǎn)運(yùn)過程、細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的調(diào)控過程、細(xì)胞增殖信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控過程、細(xì)胞骨架系統(tǒng)形態(tài)發(fā)生過程等。藻藍(lán)蛋白對(duì)A549細(xì)胞具有明顯的增殖抑制作用，而GO富集分析中細(xì)胞增殖信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程與本研究相一致，進(jìn)一步表明了測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]肺癌分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 代水平,汪周峰,李為民.  腫瘤防治研究. 2018(10)
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本文編號(hào)：3605926