乳糜瀉治療研究文獻的計量學分析及基因表達譜的生物信息學分析
發(fā)布時間:2023-01-08 17:37
研究目的:乳糜瀉是由麩質引起的慢性自身免疫性腸病,臨床表現(xiàn)可累及全身多個器官及組織,目前有效的治療方案僅有去除麩質飲食。本研究首先通過對近10年與乳糜瀉治療相關文獻進行計量學分析,探索該領域國內外研究現(xiàn)狀,了解目前治療研究熱點及前沿,希望為臨床醫(yī)師及研究人員提供參考;其次采用多種生物信息學分析工具進行數(shù)據(jù)挖掘,篩選與乳糜瀉發(fā)生發(fā)展相關的信號通路、樞紐基因及免疫細胞,為尋找更多的乳糜瀉治療靶點提供理論依據(jù)。研究方法:檢索Web of Science核心合集,對2010-2019年乳糜瀉治療相關文獻的年代分布及趨勢和期刊分布進行統(tǒng)計分析,運用Vosviewer軟件進行國家/地區(qū)合著分析、機構合著分析、作者合著及共被引分析、文獻共被引分析以及關鍵詞共現(xiàn)分析,并繪制相應合作網(wǎng)絡圖譜,使用Citespace軟件對關鍵詞進行突現(xiàn)分析。選取GEO和Array Expression數(shù)據(jù)庫中的GSE72625和GSE112102數(shù)據(jù)集,篩選出差異表達基因,運用DAVID、Metascape及Kobas進行GO富集分析及KEGG通路分析,通過STRING數(shù)據(jù)庫構建基因相關的PPI網(wǎng)絡,使用Cytoscap...
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 乳糜瀉治療研究文獻的計量學分析
1 前言
1.1 乳糜瀉流行病學現(xiàn)況
1.2 乳糜瀉發(fā)病機制
2 材料與方法
2.1 數(shù)據(jù)來源
2.2 數(shù)據(jù)處理
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結果
3.1 文獻類型及分布特點
3.2 文獻的國家/地區(qū)分布及合作網(wǎng)絡
3.3 文獻的來源機構分布及合作網(wǎng)絡
3.4 文獻的作者分布及合作網(wǎng)絡
3.5 參考文獻共被引分析
3.6 文獻的關鍵詞分析
4 討論
第二章 乳糜瀉基因表達譜的生物信息學分析
1 前言
2 方法
2.1 數(shù)據(jù)來源
2.2 數(shù)據(jù)處理
2.3 篩選差異基因
2.4 差異表達基因的GO富集分析及KEGG通路分析
2.5 差異表達基因PPI網(wǎng)絡及樞紐基因篩選
2.6 樞紐基因的ceRNA網(wǎng)絡構建
2.7 免疫細胞浸潤分析
2.8 樞紐基因與免疫細胞間的共表達分析
3 結果
3.1 乳糜瀉的差異基因識別
3.2 差異基因的GO富集分析
3.3 差異基因的KEGG信號通路富集分析
3.4 差異基因的PPI網(wǎng)絡及樞紐基因的篩選
3.5 樞紐基因ceRNA網(wǎng)絡的構建及驗證
3.6 乳糜瀉與正常組織樣本中免疫細胞浸潤分析
3.7 乳糜瀉免疫細胞間共表達分析
3.8 乳糜瀉關鍵基因與免疫細胞間的共表達分析
4 討論
參考文獻
攻讀學位期間成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]載脂蛋白B在動脈粥樣硬化性心血管疾病防治中的最新進展[J]. 李欣穎,張大慶. 實用藥物與臨床. 2020(09)
[2]金屬硫蛋白的研究進展[J]. 李停停,宗婧婧,高學慧,陳雪昌,孟春英,張小軍,李樂. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2018(25)
[3]載脂蛋白C3研究進展[J]. 侯鵬高. 齊齊哈爾醫(yī)學院學報. 2015(08)
[4]高膽固醇血癥患者篩查出家族性載脂蛋白B-100缺陷癥[J]. 馮建生,周羽竝,俞銳敏,林春蘭. 中華心血管病雜志. 2000(06)
本文編號:3728901
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 乳糜瀉治療研究文獻的計量學分析
1 前言
1.1 乳糜瀉流行病學現(xiàn)況
1.2 乳糜瀉發(fā)病機制
2 材料與方法
2.1 數(shù)據(jù)來源
2.2 數(shù)據(jù)處理
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結果
3.1 文獻類型及分布特點
3.2 文獻的國家/地區(qū)分布及合作網(wǎng)絡
3.3 文獻的來源機構分布及合作網(wǎng)絡
3.4 文獻的作者分布及合作網(wǎng)絡
3.5 參考文獻共被引分析
3.6 文獻的關鍵詞分析
4 討論
第二章 乳糜瀉基因表達譜的生物信息學分析
1 前言
2 方法
2.1 數(shù)據(jù)來源
2.2 數(shù)據(jù)處理
2.3 篩選差異基因
2.4 差異表達基因的GO富集分析及KEGG通路分析
2.5 差異表達基因PPI網(wǎng)絡及樞紐基因篩選
2.6 樞紐基因的ceRNA網(wǎng)絡構建
2.7 免疫細胞浸潤分析
2.8 樞紐基因與免疫細胞間的共表達分析
3 結果
3.1 乳糜瀉的差異基因識別
3.2 差異基因的GO富集分析
3.3 差異基因的KEGG信號通路富集分析
3.4 差異基因的PPI網(wǎng)絡及樞紐基因的篩選
3.5 樞紐基因ceRNA網(wǎng)絡的構建及驗證
3.6 乳糜瀉與正常組織樣本中免疫細胞浸潤分析
3.7 乳糜瀉免疫細胞間共表達分析
3.8 乳糜瀉關鍵基因與免疫細胞間的共表達分析
4 討論
參考文獻
攻讀學位期間成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]載脂蛋白B在動脈粥樣硬化性心血管疾病防治中的最新進展[J]. 李欣穎,張大慶. 實用藥物與臨床. 2020(09)
[2]金屬硫蛋白的研究進展[J]. 李停停,宗婧婧,高學慧,陳雪昌,孟春英,張小軍,李樂. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2018(25)
[3]載脂蛋白C3研究進展[J]. 侯鵬高. 齊齊哈爾醫(yī)學院學報. 2015(08)
[4]高膽固醇血癥患者篩查出家族性載脂蛋白B-100缺陷癥[J]. 馮建生,周羽竝,俞銳敏,林春蘭. 中華心血管病雜志. 2000(06)
本文編號:3728901
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