背景胸腺上皮腫瘤（thymic epithelial tumors,TETs）是一種發(fā)源于胸腺上皮細(xì)胞的腫瘤,其發(fā)病率較低,大概為0.13/10萬。根據(jù)2015年版世界衛(wèi)生組織（World Health Organization,WHO）分型,胸腺上皮腫瘤被分為胸腺瘤（A、AB、B1、B2、B3型）和胸腺癌（C型）。目前胸腺上皮腫瘤的復(fù)發(fā)和生存預(yù)后判斷主要依靠WHO分型和Masaoka分期。WHO分型中A、AB、B1、B2和B3型胸腺上皮腫瘤被認(rèn)為惡性程度較低,較少復(fù)發(fā),生存預(yù)后好,而C型胸腺上皮腫瘤被認(rèn)為惡性程度高,易復(fù)發(fā),生存預(yù)后差。Masaoka分期中,Ⅰ-Ⅱ期被認(rèn)為復(fù)發(fā)風(fēng)險低,生存預(yù)后好,而Ⅲ-Ⅳ期復(fù)發(fā)風(fēng)險高,生存預(yù)后差。然而在實際臨床運(yùn)用中,依靠WHO分型和Masaoka分期來判斷胸腺上皮腫瘤病人的復(fù)發(fā)和生存預(yù)后有一些局限性,例如惡性程度較低的A、AB、B1型胸腺瘤也會出現(xiàn)術(shù)后復(fù)發(fā)、早期轉(zhuǎn)移等情況,影響患者的預(yù)后。因此尋找更加精準(zhǔn)的生物標(biāo)記物用于判定胸腺上皮腫瘤的預(yù)后具有重要的臨床意義。DNA甲基化是基因表觀遺傳調(diào)控的重要方式,主要通過基因啟動子區(qū)域的高甲基化沉默基因表達(dá),從而...

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【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1.1癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫

陸軍軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文域。美國國家癌癥研究所和國家人類基因組研究所于2005年建立癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫（TheCancerGenomeAtlas，TCGA)，它的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)下載地址是：http://cancergenome.nih.go....

圖1.2基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫

陸軍軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文據(jù)庫包含了4868個數(shù)據(jù)集，累計達(dá)到了2045092個樣本，是世界上最大的也是最著名的芯片數(shù)據(jù)存貯和查詢的全世界公益性數(shù)據(jù)庫(圖1.2所示)。GEO數(shù)據(jù)庫建立的目的主要是：通過收錄大量的高通量測序?qū)嶒灁?shù)據(jù)，為后期同行科學(xué)家數(shù)據(jù)挖掘和信息的推廣....

圖1.3UCSC數(shù)據(jù)庫

圖1.3UCSC數(shù)據(jù)庫2.1.2實驗方法2.1.2.1胸腺上皮腫瘤臨床資料、DNA甲基化測序和轉(zhuǎn)錄組測序資料下載本研究訪問TCGA數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站、UCSC數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站和GEO數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站下載胸腺上皮腫瘤病人臨床資料、隨訪信息、全基因組DNA甲基化測序數(shù)據(jù)和全基因....

圖1.4TCGA數(shù)據(jù)庫中DNA甲基化測序資料

化DNA甲基化位點(diǎn)作為初始協(xié)變量，采用逐步邏輯回歸分析法分析胸腺上皮腫瘤總生存期和無復(fù)發(fā)生存期的獨(dú)立預(yù)測因子。根據(jù)以下標(biāo)準(zhǔn)，通過似然比試驗選擇變量：選擇一個變量（p<0.05），而在反向刪除步驟中排除p值大于0.1的變量[60]。采用ROC分析評價DNA甲基化預(yù)....

本文編號：4049554