LINC00536/miR-204-5p/TGFβ-2信號(hào)軸調(diào)控乳腺癌進(jìn)程的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2023-12-29 19:13
目的:乳腺癌是婦科常見的惡性腫瘤,是女性癌癥死亡的主要原因之一。為了發(fā)現(xiàn)LINC00536在乳腺癌細(xì)胞系增殖和遷移中的作用,以及LINC00536在乳腺癌細(xì)胞系中的作用及其分子機(jī)制,本研究分為四個(gè)部分。1)基于生物信息學(xué)方法探索乳腺癌進(jìn)程關(guān)鍵基因的篩選。2)長鏈非編碼RNA LINC00536/miR-204-5p/TGFβ-2在乳腺癌組織中的表達(dá)及臨床病理特征分析。3)LINC00536在乳腺癌中的異常表達(dá)及其對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響。4)LINC00536的下游分子miR-204-5p和TGFBR2在乳腺癌細(xì)胞中三者之間的靶向作用驗(yàn)證。方法:1)在TCGA數(shù)據(jù)庫共下載1222份乳腺癌患者的RNA-seq數(shù)據(jù);2)基于miRcode和miRTarBase數(shù)據(jù)庫構(gòu)建了乳腺癌ceRNA網(wǎng)絡(luò)。前10位lncRNA采用Cox回歸分析;3)生存分析采用KM(Kaplan-Meier)曲線分析;4)從TCGA數(shù)據(jù)庫下載LINC00536/miR-204-5p/TGFβ-2單基因數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù),采用單基因分析方法,分析乳腺癌組織及相應(yīng)鄰近正常組織標(biāo)本中的表達(dá)情況及臨床特征;5)采用qRT-...
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 基于生物信息學(xué)方法探索乳腺癌進(jìn)程關(guān)鍵基因的篩選
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究人群
1.2 篩選差異表達(dá)基因
1.3 構(gòu)建乳腺癌相關(guān)ceRNA網(wǎng)絡(luò)
1.4 篩選乳腺癌中異常表達(dá)的前10個(gè)lncRNA
1.5 用GEPIA數(shù)據(jù)庫分析lncRNA
1.6 cBioPortal分析
1.7 生存分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第二部分 長鏈非編碼RNALINC00536 在乳腺癌組織中的表達(dá)及臨床病理特征分析
1 研究內(nèi)容和方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 LINC00536 在乳腺癌中的異常表達(dá)及其對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第四部分 LINC00536 的下游分子miR-204-5p和 TGFBR2 在乳腺癌細(xì)胞中三者之間的靶向作用驗(yàn)證
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間獲得學(xué)術(shù)成果
個(gè)人簡歷
導(dǎo)師評(píng)閱表
本文編號(hào):3876271
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 基于生物信息學(xué)方法探索乳腺癌進(jìn)程關(guān)鍵基因的篩選
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究人群
1.2 篩選差異表達(dá)基因
1.3 構(gòu)建乳腺癌相關(guān)ceRNA網(wǎng)絡(luò)
1.4 篩選乳腺癌中異常表達(dá)的前10個(gè)lncRNA
1.5 用GEPIA數(shù)據(jù)庫分析lncRNA
1.6 cBioPortal分析
1.7 生存分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第二部分 長鏈非編碼RNALINC00536 在乳腺癌組織中的表達(dá)及臨床病理特征分析
1 研究內(nèi)容和方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 LINC00536 在乳腺癌中的異常表達(dá)及其對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第四部分 LINC00536 的下游分子miR-204-5p和 TGFBR2 在乳腺癌細(xì)胞中三者之間的靶向作用驗(yàn)證
1 研究內(nèi)容與方法
1.1 研究內(nèi)容
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間獲得學(xué)術(shù)成果
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本文編號(hào):3876271
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