MELK促進(jìn)子宮內(nèi)膜癌進(jìn)展的機(jī)制研究
發(fā)布時間:2022-02-15 21:04
研究目的:子宮內(nèi)膜癌(Endometrial carcinoma,EC)是女性生殖系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率逐年增加,并且呈現(xiàn)年輕化趨勢。早期EC患者一般預(yù)后較好,而復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的EC患者預(yù)后明顯較差,常規(guī)手術(shù)及放化療影響患者生存質(zhì)量,且年輕患者對保留生育功能具有迫切要求。因此,分子靶向治療或成為解決上述問題的關(guān)鍵。本課題旨在探究母體胚源性亮氨酸拉鏈激酶(Maternal embryonic leucine Zipper Kinase,MELK)在EC進(jìn)展中的作用和功能機(jī)制,深化對EC發(fā)病機(jī)制的認(rèn)識,尋求新的預(yù)后相關(guān)標(biāo)記物及其抑制劑,探索分子靶向治療EC的新思路。內(nèi)容和方法:(1)利用TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫分析MELK在EC中的表達(dá);分析MELK表達(dá)量與數(shù)據(jù)庫中臨床病理參數(shù)的關(guān)系。(2)采用免疫組化技術(shù)在組織芯片上進(jìn)行蛋白水平檢測,分析MELK表達(dá)情況與臨床病理參數(shù)的關(guān)系。(3)RNAi技術(shù)干擾MELK的表達(dá);CCK-8實(shí)驗及克隆形成實(shí)驗檢測MELK正常及干擾后對EC細(xì)胞系HEC1A和AN3CA的增殖作用影響,通過劃痕實(shí)驗檢測MELK對兩株細(xì)胞系遷移的影響,流式細(xì)胞術(shù)檢測HEC1...
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
TCGA中UCEC的基本信息Figure1.1BasicinformationofTCGA
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文6Oncolnc:http://www.oncolnc.org/Gepia:http://gepia.cancer-pku.cn/index.htmLUalcan:http://ualcan.path.uab.edu/(4)信號通路分析網(wǎng)站KEGG:https://www.genome.jp/kegg/DAVID:https://david-d.ncifcrf.gov3.結(jié)果3.1LncRNASignature用來預(yù)測內(nèi)膜樣癌我們嘗試數(shù)據(jù)庫分析查找,尋找能夠預(yù)測內(nèi)膜樣癌(EEC)預(yù)后的lncRNASignature,研究最終確立了9個lncRNA組成的Signature,能夠有效預(yù)測內(nèi)膜樣癌的預(yù)后情況[20]。這9種lncRNA分別為:LINC00473、UBXN10-AS1、AP001021.2、AL353194.1、FAM222A-AS1、FUT8‐AS1、AP002761.3、LINC02387和AL731566.2根據(jù)風(fēng)險評分,可將各組患者分為高風(fēng)險組及低風(fēng)險組,對Training組進(jìn)行總生存分析,發(fā)現(xiàn)高風(fēng)險組預(yù)后較差(p<0.01)在Testing組和全體患者組中進(jìn)行驗證發(fā)現(xiàn)高風(fēng)險組預(yù)后較差,與Tesing組一致(圖1.2)。圖1.2基于9-lncRNAsignature的總生存預(yù)后分析(A)Training組(B)Testing組(C)全體患者組Figure1.2Theoverallsurvivalanalysisof9-lncRNAbasedsignaturetheTrainingset(A),Testingset(B)andentireset(C)進(jìn)一步通過ROC曲線(圖1.3)分析,結(jié)果顯示,9個lncRNA組成的Signature(AUC=0.8488)在預(yù)測總生存率上要比腫瘤分級(AUC=0.7014)、腫瘤分期(AUC=0.5031)、患者年齡(AUC=0.702)及BMI(AUC=0.4758)的AUC(曲
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文7線下面積)更大,提示此lncRNASignature敏感性和特異性均高于其他臨床參數(shù)特征,為臨床上個體化治療內(nèi)膜樣癌提供了思路。圖1.39-lncRNAsignature與其他臨床參數(shù)預(yù)測總生存率的敏感性比較Figure1.3Comparisonofsensitivityandspecificityforoverallsurvivalpredictionby9lncRNAsignatureandotherclinicalfactors.3.2ARKs在內(nèi)膜癌中的表達(dá)分析通過主成分分析發(fā)現(xiàn)ARKs在內(nèi)膜癌組織中表達(dá)與正常及癌旁組織存在差異(圖1.4)。通過采用GEPIA網(wǎng)站[21],對于12種ARKs在TCGA中各腫瘤中及正常組織的表達(dá)進(jìn)行分析,內(nèi)膜癌組織中的ARKs表達(dá)如圖1.4B。12種ARKs的預(yù)后總生存曲線如圖1.5所示。結(jié)合其在EC中的表達(dá),NUAK2,MELK,SIK2是潛在的預(yù)后相關(guān)標(biāo)記物,在子宮內(nèi)膜癌的進(jìn)展中發(fā)揮巨大作用。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]E2F transcription factors and digestive system malignancies: How much do we know?[J]. Athanasios Xanthoulis,Dina G Tiniakos. World Journal of Gastroenterology. 2013(21)
本文編號:3627267
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
TCGA中UCEC的基本信息Figure1.1BasicinformationofTCGA
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文6Oncolnc:http://www.oncolnc.org/Gepia:http://gepia.cancer-pku.cn/index.htmLUalcan:http://ualcan.path.uab.edu/(4)信號通路分析網(wǎng)站KEGG:https://www.genome.jp/kegg/DAVID:https://david-d.ncifcrf.gov3.結(jié)果3.1LncRNASignature用來預(yù)測內(nèi)膜樣癌我們嘗試數(shù)據(jù)庫分析查找,尋找能夠預(yù)測內(nèi)膜樣癌(EEC)預(yù)后的lncRNASignature,研究最終確立了9個lncRNA組成的Signature,能夠有效預(yù)測內(nèi)膜樣癌的預(yù)后情況[20]。這9種lncRNA分別為:LINC00473、UBXN10-AS1、AP001021.2、AL353194.1、FAM222A-AS1、FUT8‐AS1、AP002761.3、LINC02387和AL731566.2根據(jù)風(fēng)險評分,可將各組患者分為高風(fēng)險組及低風(fēng)險組,對Training組進(jìn)行總生存分析,發(fā)現(xiàn)高風(fēng)險組預(yù)后較差(p<0.01)在Testing組和全體患者組中進(jìn)行驗證發(fā)現(xiàn)高風(fēng)險組預(yù)后較差,與Tesing組一致(圖1.2)。圖1.2基于9-lncRNAsignature的總生存預(yù)后分析(A)Training組(B)Testing組(C)全體患者組Figure1.2Theoverallsurvivalanalysisof9-lncRNAbasedsignaturetheTrainingset(A),Testingset(B)andentireset(C)進(jìn)一步通過ROC曲線(圖1.3)分析,結(jié)果顯示,9個lncRNA組成的Signature(AUC=0.8488)在預(yù)測總生存率上要比腫瘤分級(AUC=0.7014)、腫瘤分期(AUC=0.5031)、患者年齡(AUC=0.702)及BMI(AUC=0.4758)的AUC(曲
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文7線下面積)更大,提示此lncRNASignature敏感性和特異性均高于其他臨床參數(shù)特征,為臨床上個體化治療內(nèi)膜樣癌提供了思路。圖1.39-lncRNAsignature與其他臨床參數(shù)預(yù)測總生存率的敏感性比較Figure1.3Comparisonofsensitivityandspecificityforoverallsurvivalpredictionby9lncRNAsignatureandotherclinicalfactors.3.2ARKs在內(nèi)膜癌中的表達(dá)分析通過主成分分析發(fā)現(xiàn)ARKs在內(nèi)膜癌組織中表達(dá)與正常及癌旁組織存在差異(圖1.4)。通過采用GEPIA網(wǎng)站[21],對于12種ARKs在TCGA中各腫瘤中及正常組織的表達(dá)進(jìn)行分析,內(nèi)膜癌組織中的ARKs表達(dá)如圖1.4B。12種ARKs的預(yù)后總生存曲線如圖1.5所示。結(jié)合其在EC中的表達(dá),NUAK2,MELK,SIK2是潛在的預(yù)后相關(guān)標(biāo)記物,在子宮內(nèi)膜癌的進(jìn)展中發(fā)揮巨大作用。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]E2F transcription factors and digestive system malignancies: How much do we know?[J]. Athanasios Xanthoulis,Dina G Tiniakos. World Journal of Gastroenterology. 2013(21)
本文編號:3627267
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/yxlbs/3627267.html
最近更新
教材專著