ATXN3去泛素化調(diào)節(jié)KLF4促進(jìn)乳腺癌發(fā)生發(fā)展的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-15 22:36
Kruppel Like Factor 4(KLF4)是鋅指轉(zhuǎn)錄因子家族KLF中的一員,在多種生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。KLF4在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中由于所在組織類型不同而具有抑癌基因和癌基因的雙重功能。KLF4在細(xì)胞內(nèi)半衰期很短,其蛋白水平可受多種因素刺激而發(fā)生迅速變化,進(jìn)而造成細(xì)胞內(nèi)生理和病理反應(yīng)。這些調(diào)控大多通過(guò)蛋白翻譯后修飾介導(dǎo)。近年來(lái),去泛素化也作為調(diào)節(jié)蛋白水平和功能的一項(xiàng)重要的翻譯后修飾機(jī)制而被廣泛研究,于是我們想要進(jìn)一步探究去泛素化酶在KLF4蛋白調(diào)節(jié)中的作用。本實(shí)驗(yàn)中,我們?cè)谝粋(gè)含有65個(gè)去泛素化酶(Deubiquitinating enzyme,DUB)的文庫(kù)中篩選出KLF4的首個(gè)去泛素化酶。首先我們將候選DUB分別在工具細(xì)胞U20S和乳腺癌細(xì)胞MCF7中過(guò)表達(dá),通過(guò)檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)KLF4的含量,篩選出在這兩種細(xì)胞中均影響KLF4蛋白水平的DUB。而后利用免疫共沉淀技術(shù),分析出通過(guò)與KLF4直接相互作用而對(duì)其進(jìn)行調(diào)節(jié)的DUB。采用以上的篩選策略,我們篩選出ATXN3可能是KLF4的一個(gè)去泛素化酶。而后,我們通過(guò)半衰期實(shí)驗(yàn)和泛素化實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了 ATXN3可通過(guò)減弱KLF4的泛素化...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:108 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-?1去泛素化酶篩選流程圖??用文庫(kù)中的去泛素化酶(DUB)表達(dá)載體分別穩(wěn)定、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染U20S細(xì)胞和MCF7??細(xì)胞
去泛素化酶取交集,獲得可能在各類細(xì)胞中廣泛存在的KLF4的去泛素化酶。D.通??過(guò)IP篩選出能與KLF4結(jié)合的去泛素化酶。??篩選的流程圖見(jiàn)圖2-1,其主要策略是關(guān)注KLF4蛋白水平在各種去泛素化酶??過(guò)表達(dá)后的變化。我們首先分析了過(guò)表達(dá)65種去泛素化酶的U20S細(xì)胞和MCF7??細(xì)胞中KLF4的表達(dá)水平,篩選出上調(diào)U20S細(xì)胞中KLF4的去泛素化酶。與陰性??對(duì)照細(xì)胞系相比,我們?cè)冢保硞(gè)去泛素化酶過(guò)表達(dá)的U20S細(xì)胞系中觀察到KLF4蛋??白水平上調(diào)(圖2-2?A),這13個(gè)去泛素化酶分別是:USP14、USP8、USP48、??USP22、EIF3S5、UCHL1、USP46、USP50、J0SD2、USP20、0TUD4、ATXN3、??UCHL5。另外,在MCF7細(xì)胞中,我們?cè)冢保硞(gè)不同的去泛素化酶過(guò)表達(dá)時(shí)觀察到??KLF4蛋白水平增加(圖2-2?B),這13個(gè)去泛素化酶分別是:ATXN3、BAP1、??BRCC3、C0PS6、CYLD、USP21、USP28、USP30、0TUD5、USP36、USP48、??USP5、USP10。為了得到在不同種細(xì)胞中廣泛發(fā)揮作用的KLF4的去泛素化酶,我??們對(duì)這兩種細(xì)胞系的篩選結(jié)果取交集,Venn圖顯示ATXN3和USP48可同時(shí)在這??兩種細(xì)胞中發(fā)揮作用(圖2-2?C)。??由于酶與底物的結(jié)合依賴于它們的直接相互作用
?結(jié)果??了?ATXN3與KLF4之間的相互作用(圖2-3A.B)。說(shuō)明ATXN3可以直接作用于??KLF4,從而對(duì)其進(jìn)行調(diào)節(jié)。??WCL?IP:?Flag??GFP-Ctrl?+?+??GFP-KLF4?+?+??F/H-ATXN3?+?+?+?+??GFP?5??Flag?^■?一?一??圖2-?3?ATXN3與KLF4相互作用??生長(zhǎng)狀態(tài)良好的HEK293細(xì)胞以3?x?1〇5/孔接種于6孔板。培養(yǎng)過(guò)夜使細(xì)胞貼壁后,??用Lipofectamine?2000轉(zhuǎn)入帶GFP標(biāo)簽的KLF4和帶Flag/HA標(biāo)簽的ATXN3表達(dá)??載體,24小時(shí)后收取細(xì)胞,用NP-40裂解液提取蛋白,而后用帶抗Hag抗體的瓊??脂糖珠IP富集蛋白,Western?Blotting檢測(cè)富集蛋白中GFP的含量。??綜上所述,我們證實(shí)了去泛素化酶ATXN3是通過(guò)與KLF4相互作用,改變??U20S和MCF7細(xì)胞內(nèi)KLF4含量。由此我們初步篩選出ATXN3可能為KLF4的去??泛素化酶。??2.尋找ATXN3與KLF4相互作用的區(qū)域??2.1.?ATXN3分子上與KLF4結(jié)合的區(qū)域??ATXN3是去泛素化酶家族MJD中的一員。MJD家族的全稱為Machado??JosephinDomainProtein,其成員的共有的結(jié)構(gòu)特性是氨基端存在一個(gè)由大約180個(gè)??氨基酸殘基構(gòu)成的Josephin結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域呈a螺旋結(jié)構(gòu),是一類半胱氨酸蛋白??酶結(jié)構(gòu)域
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]楔橫軋輥剪制坯力的研究[J]. 柳傳,束學(xué)道,胡斌. 熱加工工藝. 2015(11)
[2]Deubiquitinating enzyme regulation of the p53 pathway: A lesson from Otub1[J]. Xiao-Xin Sun,Mu-Shui Dai. World Journal of Biological Chemistry. 2014(02)
本文編號(hào):3591442
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:108 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-?1去泛素化酶篩選流程圖??用文庫(kù)中的去泛素化酶(DUB)表達(dá)載體分別穩(wěn)定、瞬時(shí)轉(zhuǎn)染U20S細(xì)胞和MCF7??細(xì)胞
去泛素化酶取交集,獲得可能在各類細(xì)胞中廣泛存在的KLF4的去泛素化酶。D.通??過(guò)IP篩選出能與KLF4結(jié)合的去泛素化酶。??篩選的流程圖見(jiàn)圖2-1,其主要策略是關(guān)注KLF4蛋白水平在各種去泛素化酶??過(guò)表達(dá)后的變化。我們首先分析了過(guò)表達(dá)65種去泛素化酶的U20S細(xì)胞和MCF7??細(xì)胞中KLF4的表達(dá)水平,篩選出上調(diào)U20S細(xì)胞中KLF4的去泛素化酶。與陰性??對(duì)照細(xì)胞系相比,我們?cè)冢保硞(gè)去泛素化酶過(guò)表達(dá)的U20S細(xì)胞系中觀察到KLF4蛋??白水平上調(diào)(圖2-2?A),這13個(gè)去泛素化酶分別是:USP14、USP8、USP48、??USP22、EIF3S5、UCHL1、USP46、USP50、J0SD2、USP20、0TUD4、ATXN3、??UCHL5。另外,在MCF7細(xì)胞中,我們?cè)冢保硞(gè)不同的去泛素化酶過(guò)表達(dá)時(shí)觀察到??KLF4蛋白水平增加(圖2-2?B),這13個(gè)去泛素化酶分別是:ATXN3、BAP1、??BRCC3、C0PS6、CYLD、USP21、USP28、USP30、0TUD5、USP36、USP48、??USP5、USP10。為了得到在不同種細(xì)胞中廣泛發(fā)揮作用的KLF4的去泛素化酶,我??們對(duì)這兩種細(xì)胞系的篩選結(jié)果取交集,Venn圖顯示ATXN3和USP48可同時(shí)在這??兩種細(xì)胞中發(fā)揮作用(圖2-2?C)。??由于酶與底物的結(jié)合依賴于它們的直接相互作用
?結(jié)果??了?ATXN3與KLF4之間的相互作用(圖2-3A.B)。說(shuō)明ATXN3可以直接作用于??KLF4,從而對(duì)其進(jìn)行調(diào)節(jié)。??WCL?IP:?Flag??GFP-Ctrl?+?+??GFP-KLF4?+?+??F/H-ATXN3?+?+?+?+??GFP?5??Flag?^■?一?一??圖2-?3?ATXN3與KLF4相互作用??生長(zhǎng)狀態(tài)良好的HEK293細(xì)胞以3?x?1〇5/孔接種于6孔板。培養(yǎng)過(guò)夜使細(xì)胞貼壁后,??用Lipofectamine?2000轉(zhuǎn)入帶GFP標(biāo)簽的KLF4和帶Flag/HA標(biāo)簽的ATXN3表達(dá)??載體,24小時(shí)后收取細(xì)胞,用NP-40裂解液提取蛋白,而后用帶抗Hag抗體的瓊??脂糖珠IP富集蛋白,Western?Blotting檢測(cè)富集蛋白中GFP的含量。??綜上所述,我們證實(shí)了去泛素化酶ATXN3是通過(guò)與KLF4相互作用,改變??U20S和MCF7細(xì)胞內(nèi)KLF4含量。由此我們初步篩選出ATXN3可能為KLF4的去??泛素化酶。??2.尋找ATXN3與KLF4相互作用的區(qū)域??2.1.?ATXN3分子上與KLF4結(jié)合的區(qū)域??ATXN3是去泛素化酶家族MJD中的一員。MJD家族的全稱為Machado??JosephinDomainProtein,其成員的共有的結(jié)構(gòu)特性是氨基端存在一個(gè)由大約180個(gè)??氨基酸殘基構(gòu)成的Josephin結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域呈a螺旋結(jié)構(gòu),是一類半胱氨酸蛋白??酶結(jié)構(gòu)域
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]楔橫軋輥剪制坯力的研究[J]. 柳傳,束學(xué)道,胡斌. 熱加工工藝. 2015(11)
[2]Deubiquitinating enzyme regulation of the p53 pathway: A lesson from Otub1[J]. Xiao-Xin Sun,Mu-Shui Dai. World Journal of Biological Chemistry. 2014(02)
本文編號(hào):3591442
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