長鏈非編碼RNA GCMA對(duì)胃癌轉(zhuǎn)移的調(diào)控作用及相關(guān)機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-31 04:07
研究背景:胃癌是世界上常見的惡性腫瘤之一,其預(yù)后較差,死亡率高。盡管近年來胃鏡技術(shù)的發(fā)展大大提高了早期胃癌的診斷率并進(jìn)一步改善了早期胃癌患者的生存率,但進(jìn)展期胃癌患者仍缺乏有效的治療手段,生存率仍較差。胃癌的浸潤和轉(zhuǎn)移是造成晚期胃癌患者復(fù)發(fā)及預(yù)后不良的主要原因。胃癌的浸潤和轉(zhuǎn)移是多階段,多因素調(diào)控的復(fù)雜過程,其分子機(jī)制仍不是很清楚。深入探索胃癌浸潤和轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制有助于提供有效的治療靶點(diǎn),并改善胃癌患者的預(yù)后。長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類長度大于200個(gè)核苷酸,缺乏可識(shí)別的開放閱讀框(open reading frame,ORF),且不具有蛋白質(zhì)編碼能力的RNA分子。已有研究表明lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用,其調(diào)控方式包括介導(dǎo)染色質(zhì)重塑及組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控等。雖然關(guān)于lncRNA的研究進(jìn)展迅猛,但絕大部分lncRNA的功能仍然是不清楚的,與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的lncRNA的報(bào)道更是少數(shù)。本研究通過胃癌組織lncRNA表達(dá)譜芯片篩選出與胃癌轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)的lncRNA GCMA,隨后在獨(dú)立胃癌組織樣本中檢測GCMA...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:154 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1:?LncRNAGCMA是一種與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的IncRNA
?^.GCMA?high??卜?i:?ji??^?40?AUC=0.7071?1?^?L〇g,a? ̄?h?.?I?Los.anZ?\?_??P=〇〇〇77?20.?p^〇33〇?1??■?S:〇〇^p5????Hazard?RatK3=3?954??Haard?RatK>=3?461??0?20?40?60?80?1?00?0?12?24?36?48?60?〇?12?24?36?48?60??1-Specificity%?month?month??圖2:?GCMA與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及預(yù)后的相關(guān)性??A.?ROC曲線顯示結(jié)果顯示GCMA可較好地區(qū)分出發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的胃癌組織和未發(fā)生淋??巴結(jié)轉(zhuǎn)移的胃癌組織(曲線下面積為0.7071,?95°/〇C丨為0.5807-0.8334,尸=0.0077)。.?B.??Kaplan-Meier生存曲線分析顯示GCMA高表達(dá)的患者OS較差(HR=3.954,Z^O.0330)。??C.?Kaplan-Meier生存曲線分析顯示GCMA高表達(dá)的患者DFS較差(HR=3.46l,P=0.0475)。??1.3?GCMA的基因?qū)W特征??我們?cè)冢牛睿螅澹恚猓旌停危茫拢被驍?shù)據(jù)庫網(wǎng)站上檢索了?GCMA的基因?qū)W特征。??結(jié)果顯示,GCMA?(ENST0000045丨618或AP001476)位于人的21號(hào)染色體長??臂末端,由2個(gè)外顯子構(gòu)成,轉(zhuǎn)錄本長度為2198個(gè)核苷酸,屬于基因間IncRNA??(圖?3A-C)。C.PAT?(Coding?Potential?Assessment?Tool)生物信息學(xué)軟件分析表明??GCMA不具有編碼蛋白質(zhì)的能力(圖3D)。??A?
GCMA?(ENST00000451618或ATOO丨476)位??于人的2丨號(hào)染色體長臂末端,全長為2198個(gè)核苷酸,屬于基因間IncRNA。D.?CPAT軟件??分析表明GCMA不具有編碼蛋白質(zhì)的能力。??1.4?GCMA的細(xì)胞內(nèi)定位和穩(wěn)定性分析??隨后,我們通過熒光原位雜交實(shí)驗(yàn)(FISH實(shí)驗(yàn))檢測了?GCMA在胃癌細(xì)胞中??的定位。結(jié)果顯示,陽性對(duì)照U6在胃癌細(xì)胞系BGC823和MKN45中定位于細(xì)胞核??中,18S定位于細(xì)胞質(zhì)中,而IncRNAGCMA定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中(圖4A-B)。??為檢測GCMA在胃癌細(xì)胞中的穩(wěn)定性,我們進(jìn)行了放線菌素D加藥實(shí)驗(yàn)并于處理??后的Oh、0.5h、lh、2h和4h收集細(xì)胞進(jìn)行RT-qPCR檢測GCMA和C-MYC?(陽性??對(duì)照)的表達(dá)量。結(jié)果顯示,與C-MYC相比,GCMA在胃癌細(xì)胞中可長久穩(wěn)定??存在(圖4C-D)。??A?Cy3?DAPI?Merged?°?Cy3?DAPI?Merged??mmm?ebb??C?D??^?011?一?C-MYC?c?1n???2?i???一?GCMA?〇?—?C-MYC????*?IS?—?GCMA??卜”?!?01-??i?i?°?01-??>?0.001?-?;??1?i???1?〇.〇〇>■??Si?4?s:??0?0001?i?o's?!?J?i?〇〇〇°l1?h?o',?\?\??AtcD?(h)?AtcD?(h)??圖4:?GCMA的細(xì)胞內(nèi)定位和穩(wěn)定性??A-B.?FISH實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示GCMA在胃癌細(xì)胞系BGC823?(A)和MKN45?(B)中定位于細(xì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[2]Characteristics of gastric cancer in Asia[J]. Rubayat Rahman,Akwi W Asombang,Jamal A Ibdah. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[3]Treatment options in patients with metastatic gastric cancer:Current status and future perspectives[J]. Ahmet Bilici. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
[4]Clinical significance of lymph node metastasis in gastric cancer[J]. Jing-Yu Deng,Han Liang. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
本文編號(hào):3374158
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:154 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1:?LncRNAGCMA是一種與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的IncRNA
?^.GCMA?high??卜?i:?ji??^?40?AUC=0.7071?1?^?L〇g,a? ̄?h?.?I?Los.anZ?\?_??P=〇〇〇77?20.?p^〇33〇?1??■?S:〇〇^p5????Hazard?RatK3=3?954??Haard?RatK>=3?461??0?20?40?60?80?1?00?0?12?24?36?48?60?〇?12?24?36?48?60??1-Specificity%?month?month??圖2:?GCMA與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及預(yù)后的相關(guān)性??A.?ROC曲線顯示結(jié)果顯示GCMA可較好地區(qū)分出發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的胃癌組織和未發(fā)生淋??巴結(jié)轉(zhuǎn)移的胃癌組織(曲線下面積為0.7071,?95°/〇C丨為0.5807-0.8334,尸=0.0077)。.?B.??Kaplan-Meier生存曲線分析顯示GCMA高表達(dá)的患者OS較差(HR=3.954,Z^O.0330)。??C.?Kaplan-Meier生存曲線分析顯示GCMA高表達(dá)的患者DFS較差(HR=3.46l,P=0.0475)。??1.3?GCMA的基因?qū)W特征??我們?cè)冢牛睿螅澹恚猓旌停危茫拢被驍?shù)據(jù)庫網(wǎng)站上檢索了?GCMA的基因?qū)W特征。??結(jié)果顯示,GCMA?(ENST0000045丨618或AP001476)位于人的21號(hào)染色體長??臂末端,由2個(gè)外顯子構(gòu)成,轉(zhuǎn)錄本長度為2198個(gè)核苷酸,屬于基因間IncRNA??(圖?3A-C)。C.PAT?(Coding?Potential?Assessment?Tool)生物信息學(xué)軟件分析表明??GCMA不具有編碼蛋白質(zhì)的能力(圖3D)。??A?
GCMA?(ENST00000451618或ATOO丨476)位??于人的2丨號(hào)染色體長臂末端,全長為2198個(gè)核苷酸,屬于基因間IncRNA。D.?CPAT軟件??分析表明GCMA不具有編碼蛋白質(zhì)的能力。??1.4?GCMA的細(xì)胞內(nèi)定位和穩(wěn)定性分析??隨后,我們通過熒光原位雜交實(shí)驗(yàn)(FISH實(shí)驗(yàn))檢測了?GCMA在胃癌細(xì)胞中??的定位。結(jié)果顯示,陽性對(duì)照U6在胃癌細(xì)胞系BGC823和MKN45中定位于細(xì)胞核??中,18S定位于細(xì)胞質(zhì)中,而IncRNAGCMA定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中(圖4A-B)。??為檢測GCMA在胃癌細(xì)胞中的穩(wěn)定性,我們進(jìn)行了放線菌素D加藥實(shí)驗(yàn)并于處理??后的Oh、0.5h、lh、2h和4h收集細(xì)胞進(jìn)行RT-qPCR檢測GCMA和C-MYC?(陽性??對(duì)照)的表達(dá)量。結(jié)果顯示,與C-MYC相比,GCMA在胃癌細(xì)胞中可長久穩(wěn)定??存在(圖4C-D)。??A?Cy3?DAPI?Merged?°?Cy3?DAPI?Merged??mmm?ebb??C?D??^?011?一?C-MYC?c?1n???2?i???一?GCMA?〇?—?C-MYC????*?IS?—?GCMA??卜”?!?01-??i?i?°?01-??>?0.001?-?;??1?i???1?〇.〇〇>■??Si?4?s:??0?0001?i?o's?!?J?i?〇〇〇°l1?h?o',?\?\??AtcD?(h)?AtcD?(h)??圖4:?GCMA的細(xì)胞內(nèi)定位和穩(wěn)定性??A-B.?FISH實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示GCMA在胃癌細(xì)胞系BGC823?(A)和MKN45?(B)中定位于細(xì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[2]Characteristics of gastric cancer in Asia[J]. Rubayat Rahman,Akwi W Asombang,Jamal A Ibdah. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[3]Treatment options in patients with metastatic gastric cancer:Current status and future perspectives[J]. Ahmet Bilici. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
[4]Clinical significance of lymph node metastasis in gastric cancer[J]. Jing-Yu Deng,Han Liang. World Journal of Gastroenterology. 2014(14)
本文編號(hào):3374158
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