基于組學(xué)數(shù)據(jù)的阿爾茲海默癥染色體區(qū)段研究和細(xì)胞重編程研究
發(fā)布時(shí)間:2020-07-22 03:25
【摘要】:阿爾茲海默癥(Alzheimer's Disease, AD)轉(zhuǎn)錄組上的調(diào)控變化表明,AD疾病狀態(tài)下基因的調(diào)控發(fā)生了整體性的變化。而結(jié)合遺傳學(xué)上的結(jié)論,可以得到特殊的染色體區(qū)段在阿爾茲海默癥的疾病發(fā)生中有著特殊的意義,比如人類染色體的19p13.2區(qū)域。但這些區(qū)域在阿爾茲海默癥疾病機(jī)理上的生物學(xué)功能還需要進(jìn)行進(jìn)一步的深入研究。將這些基因組區(qū)域上的位點(diǎn)和阿爾茲海默癥在轉(zhuǎn)錄組上的表現(xiàn)進(jìn)行整體性的考察,可以同時(shí)考察轉(zhuǎn)錄組和基因組水平上疾病進(jìn)程中的共同變化,對(duì)于阿爾茲海默癥疾病機(jī)理的研究有著重要的意義。在整體的研究了AD轉(zhuǎn)錄組上基因的調(diào)控變化后我們考察了轉(zhuǎn)錄組上擾動(dòng)基因的區(qū)域性變化,得到染色體19p區(qū)域在AD大腦轉(zhuǎn)錄組上有著特殊表現(xiàn),并且展示了19p區(qū)域中的基因在細(xì)胞中可能參與的相關(guān)細(xì)胞通路以及基因間的相互作用。在以上的研究中可以觀察到chrl9p區(qū)域在轉(zhuǎn)錄組中同樣表現(xiàn)出了非常顯著的擾動(dòng),從而驗(yàn)證了chrl9p區(qū)域在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平都與阿爾茲海默癥的疾病機(jī)理有著特殊的關(guān)聯(lián)性。在阿爾茲海默癥轉(zhuǎn)錄組的研究中我們發(fā)現(xiàn)在疾病的轉(zhuǎn)化過程中存在著基因的共同調(diào)控變化的現(xiàn)象,在此基礎(chǔ)上可以認(rèn)為在疾病狀態(tài)下細(xì)胞的狀態(tài)有著一定的改變。因此我們希望通過對(duì)于細(xì)胞命運(yùn)的轉(zhuǎn)化來對(duì)阿爾茲海默癥的可能的治療方式提供一定的思考。自2006年Yamanaka發(fā)現(xiàn)導(dǎo)入四種不同的轉(zhuǎn)錄因子可以使體細(xì)胞發(fā)生重編程回歸多能性的狀態(tài)后,誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞(iPSC,Induced pluripotent stem cell)在再生醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用為幾類難以治療的疾病如阿爾茲海默癥等帶來了希望,同時(shí)誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞為細(xì)胞命運(yùn)的變化提供了一個(gè)非常可靠的模型。因此在這部分的研究中我們采用了比較成熟的干細(xì)胞模型來考察細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)化過程中的基因的整體性的調(diào)控,一方面通過干細(xì)胞的誘導(dǎo)因子的研究來考察其基因的變化和完善其體系,從而有助于其在阿爾茲海默癥上的應(yīng)用,而另一方面通過對(duì)于細(xì)胞命運(yùn)的轉(zhuǎn)化中基因的調(diào)控來觀察其在神經(jīng)細(xì)胞中的可能的應(yīng)用。
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)院北京基因組研究所
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R749.16
【圖文】:
圖4阿爾茲海默癥疾病進(jìn)程中19號(hào)染色體上的擾動(dòng)基因的通路展示。每個(gè)基因在四個(gè)階段中的變化用小逡逑方格在右下角進(jìn)行了注釋(其中紅色表示上調(diào),緣色表示下調(diào),黃色表示具有擾動(dòng),灰色則表示沒有發(fā)生逡逑變化)。同上ND_H階段的實(shí)驗(yàn)沮巧對(duì)照組分別力中度AD患者(無巧呆)與非患者。而ADJH和AD_D逡逑階段則是AD患者和正常人之間的比較。在ND_H和AD_H階段,無神經(jīng)纖維纏結(jié)表現(xiàn)的神經(jīng)元被用于芯逡逑
圖5交集的幾個(gè)重要差異基因在2姐時(shí)間序列中的表現(xiàn),其中42478為小鼠的數(shù)據(jù),50206巧人類的數(shù)集。橫坐標(biāo)表示時(shí)間上的變化,縱坐標(biāo)表示表達(dá)值。逡逑對(duì)于human中的153個(gè)相關(guān)基因,我們?cè)跁r(shí)間序列中進(jìn)行了具體的階段的分逡逑
本文編號(hào):2765256
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)院北京基因組研究所
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R749.16
【圖文】:
圖4阿爾茲海默癥疾病進(jìn)程中19號(hào)染色體上的擾動(dòng)基因的通路展示。每個(gè)基因在四個(gè)階段中的變化用小逡逑方格在右下角進(jìn)行了注釋(其中紅色表示上調(diào),緣色表示下調(diào),黃色表示具有擾動(dòng),灰色則表示沒有發(fā)生逡逑變化)。同上ND_H階段的實(shí)驗(yàn)沮巧對(duì)照組分別力中度AD患者(無巧呆)與非患者。而ADJH和AD_D逡逑階段則是AD患者和正常人之間的比較。在ND_H和AD_H階段,無神經(jīng)纖維纏結(jié)表現(xiàn)的神經(jīng)元被用于芯逡逑
圖5交集的幾個(gè)重要差異基因在2姐時(shí)間序列中的表現(xiàn),其中42478為小鼠的數(shù)據(jù),50206巧人類的數(shù)集。橫坐標(biāo)表示時(shí)間上的變化,縱坐標(biāo)表示表達(dá)值。逡逑對(duì)于human中的153個(gè)相關(guān)基因,我們?cè)跁r(shí)間序列中進(jìn)行了具體的階段的分逡逑
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 Lisa Mohamet;Natalie J Miazga;Christopher M Ward;;Familial Alzheimer's disease modelling using induced pluripotent stem cell technology[J];World Journal of Stem Cells;2014年02期
本文編號(hào):2765256
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