本文關(guān)鍵詞： 血漿cfDNA 食管鱗癌 突變頻率 突變負(fù)荷 單核苷酸變異　出處：《鄭州大學(xué)》2017年博士論文　論文類(lèi)型：學(xué)位論文

【摘要】：研究背景:世界范圍內(nèi)食管癌的發(fā)病率依然在升高,在我國(guó)等發(fā)展中國(guó)家中,近十年來(lái)食管癌的發(fā)病率依然居高不下,并且在亞洲地區(qū)食管癌組織類(lèi)型以鱗狀細(xì)胞癌為主要類(lèi)型。手術(shù)切除、化療和放療依然是目前食管癌的主要治療手段,盡管近幾十年食管癌治療手段取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步,但是治療效果依然欠佳,這主要?dú)w因于早期食管癌缺乏特異性的臨床癥狀和體征,同時(shí)缺乏準(zhǔn)確的生物學(xué)標(biāo)志物,這導(dǎo)致食管癌發(fā)現(xiàn)伊始便是中晚期。對(duì)于中晚期的食管癌患者,單純的手術(shù)治療無(wú)法達(dá)到生物學(xué)意義上的根治,多學(xué)科綜合治療成為中晚期腫瘤患者主要治療方式。新輔助化療及靶向治療作為近年來(lái)一種廣受關(guān)注的治療手段,尤其在進(jìn)展期食管癌中,其臨床價(jià)值已經(jīng)逐漸獲得廣泛認(rèn)可,但是對(duì)其療效評(píng)估和患者群體選擇依然存在很多爭(zhēng)議。當(dāng)前在食管癌診斷和監(jiān)測(cè)中仍然缺乏有效的生物學(xué)標(biāo)志物。在第二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展下,使用日益完善的各類(lèi)新型技術(shù)手段,探尋新的化療療效評(píng)估標(biāo)志物,無(wú)創(chuàng)、精確、高效的對(duì)食管癌患者進(jìn)行預(yù)測(cè)與分類(lèi),是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)指導(dǎo)下食管癌多學(xué)科綜合治療的熱點(diǎn)方向,具有重要的臨床意義。目前,多項(xiàng)研究結(jié)果提示游離DNA(cell free DNA,cf DNA)在肺癌、結(jié)直腸癌、肝癌、乳腺癌等多種惡性腫瘤患者的外周血中存在,并且與腫瘤負(fù)荷及預(yù)后相關(guān),但在食管癌中應(yīng)用價(jià)值的研究較少。近年已有研究報(bào)道食管癌患者的外周血中可以檢測(cè)到腫瘤相關(guān)的cf DNA,并且血漿cf DNA檢測(cè)可以作為評(píng)價(jià)食管癌手術(shù)效果的非侵襲性的生物標(biāo)志物,而基于第二代測(cè)序技術(shù)的cf DNA檢測(cè)用于預(yù)測(cè)食管癌患者的化療療效和預(yù)后的研究還未見(jiàn)報(bào)道。本研究擬通過(guò)監(jiān)測(cè)食管癌患者初治時(shí)外周血中cf DNA的含量及食管癌相關(guān)突變基因的檢測(cè),研究cf DNA與食管鱗癌患者臨床特征及病理學(xué)特征之間的關(guān)系,同時(shí)根據(jù)食管鱗癌外周血cf DNA中腫瘤相關(guān)基因變化情況作為食管癌患者化療療效和預(yù)后評(píng)估的伴隨診斷指標(biāo)的潛在可能。第一部分食管鱗癌患者血漿游離DNA含量與患者臨床及病理學(xué)特征相關(guān)性的研究目的:初步探討食管鱗癌患者血漿cf DNA含量與患者臨床病理特征的相關(guān)性。方法:收集2015年1月-2015年3月河南省腫瘤醫(yī)院胸外科一區(qū)收治的食管鱗癌患者初治時(shí)血漿樣本共30例。采用磁珠兩步法提取患者血漿cf DNA,分析血漿cfDNA含量和患者臨床及病理學(xué)特征的相關(guān)性。結(jié)果:納入本研究的30例食管癌患者中,所有患者cf DNA以Nanodrop法定量分析,檢測(cè)成功率為100%,測(cè)得30例食管癌患者血漿cf DNA濃度為0.182±0.107ng/ul(0.09-0.51ng/ul),其中≥60歲、60歲兩組食管癌患者血漿游離DNA濃度分別為0.188±0.104ng/ul、0.174±0.116ng/ul(p=0.764);男性患者、女性患者血漿cf DNA濃度分別為0.178±0.094ng/ul、0.210±0.188ng/ml(p=0.058);有和沒(méi)有吸煙史的食管鱗癌患者血漿cf DNA濃度分別為0.184±0.1040ng/ul和0.180±0.115ng/ul(p=0.823);有和沒(méi)有飲酒史的食管鱗癌患者血漿cf DNA濃度分別為0.184±0.108ng/ul和0.181±0.109ng/ul(p=0.830);有和沒(méi)有惡性腫瘤家族病史的食管癌患者血漿cf DNA濃度分別為0.208±0.155ng/ul和0.176±0.095ng/ul(p=0.097);食管胸上、中、下段癌患者血漿cf DNA濃度分別為:0.231±0.045ng/ul、0.161±0.067ng/ul和0.130±0.018ng/ul(p=0.559);IIa、IIb、IIIa、IIIb期食管鱗癌患者血漿cf DNA濃度分別為0.184±0.108ng/ul、0.178±0.094ng/ul、0.181±0.109ng/ul、0.161±0.067ng/ul(p=0.102);高、中、低分化的三組患者血漿cf DNA濃度分別為0.157±0.078ng/ul、0.185±0.110ng/ul、0.199±0.131ng/ul(p=0.449);按T1-2和T2-4分組,兩組患者的血漿游離DNA濃度分別為0.175±0.122ng/ul和0.186±0.186ng/ul(p=0.964)有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的患者血漿cf DNA濃度為0.168±0.063ng/ul、0.193±0.132ng/ul(p=0.058);以腫瘤體積中位數(shù)將患者分為大腫瘤組和小腫瘤組,兩組患者的血漿cf DNA濃度分別為0.220±0.132ng/ul和0.145±0.056ng/ul(p=0.006)。通過(guò)相關(guān)性分析cf DNA水平與腫瘤TNM綜合分期無(wú)相關(guān)性,與腫瘤體積大小呈正相關(guān)(r=0.381,P=0.038)。結(jié)論:食管鱗癌血漿cf DNA水平與其腫瘤負(fù)荷呈正相關(guān),與患者性別、年齡、吸煙飲酒史、惡性腫瘤家族史、腫瘤部位、腫瘤侵潤(rùn)深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況以及腫瘤分期無(wú)顯著性相關(guān)性。第二部分化療敏感基因SNP聯(lián)合外周血ct DNA檢測(cè)對(duì)食管鱗癌患者新輔助化療優(yōu)勢(shì)人群篩選的價(jià)值目的:篩選食管鱗癌新輔助化療敏感基因SNP,初步探討聯(lián)合多基因SNP和ct DNA對(duì)患者化療敏感性進(jìn)行預(yù)測(cè)的可行性,從而進(jìn)行藥物的合理選擇,為實(shí)現(xiàn)食管癌患者個(gè)體化新輔助化療提供重要的理論依據(jù)。方法:回顧性分析2016年3月至2016年5月期間在河南省腫瘤醫(yī)院胸外科一區(qū)進(jìn)行新輔助化療的患者的臨床資料,納入新輔助化療療效評(píng)價(jià)為CR/PR和PD/SD的患者各7例,收集兩組患者的相關(guān)臨床資料和病理學(xué)資料,從河南省腫瘤醫(yī)院胸外科生物標(biāo)本庫(kù)內(nèi)調(diào)取納入本研究的14例患者的血標(biāo)本。提取血漿中游離DNA,分析化療敏感組和耐藥組患者的血漿cf DNA基因變異譜的差異�；熋舾谢颊吆突煵幻舾谢颊哐獫{cf DNA中基因變異存在顯著性差異,且兩組患者的腫瘤基因突變負(fù)荷結(jié)果有顯著性差異(p=0.0062),化療不敏感組具有較高的基因突變負(fù)荷。信號(hào)通路分析提示p53信號(hào)通路是化療敏感組及耐藥組腫瘤負(fù)荷差異基因富集最多的信號(hào)通路�；熋舾薪M和不敏感組患者外周血cf DNA基因拷貝數(shù)變化、差異性分析結(jié)果顯示63個(gè)基因的基因拷貝數(shù)變化在兩組之間存在顯著性差異,化療不敏感組這些基因的突變個(gè)數(shù)和突變頻率比化療敏感組顯著性增多。結(jié)果:結(jié)論:化療敏感組與化療不敏感組存在單核苷酸變異和基因拷貝數(shù)變異的不同,發(fā)現(xiàn)食管鱗癌新輔助化療患者化療敏感組與化療不敏感組存在單核苷酸變異和基因拷貝數(shù)變異的差異,可建立早期預(yù)測(cè)化療敏感性的模型,對(duì)新輔助化療優(yōu)勢(shì)人群的篩選有重要意義。
[Abstract]:BACKGROUND : The incidence of esophageal cancer remains high in the world . The incidence of esophageal cancer remains high in developing countries such as lung cancer , colorectal cancer , liver cancer and breast cancer . The plasma cf DNA concentrations in patients with esophageal squamous cell carcinoma were 0.184 鹵 0.108 ng / ul and 0.178 鹵 0.109 ng / ul ( p = 0.783 ) respectively . The plasma cf DNA concentrations in patients with esophageal squamous cell carcinoma were 0.184 鹵 0.108 ng / ul and 0.178 鹵 0.188 ng / ul ( p = 0.102 ) , respectively . The plasma cf DNA concentration in patients with esophageal squamous cell carcinoma without history of smoking was 0.175 鹵 0.108 ng / ul and 0.186 鹵 0.18ng / ul , respectively . Conclusion : The clinical data of patients with esophageal squamous cell carcinoma ( SCC ) and chemotherapy - insensitive group ( CR / PR and PD / SD ) were analyzed retrospectively . The results showed that there were significant differences in the gene copy number between the chemosensitivity group and the chemosensitivity group .

【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類(lèi)號(hào)】：R735.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1541795