基因表達(dá)分析揭示TGFB1I1誘導(dǎo)的EMT途徑促進(jìn)星形細(xì)胞瘤惡性進(jìn)展
本文關(guān)鍵詞:基因表達(dá)分析揭示TGFB1I1誘導(dǎo)的EMT途徑促進(jìn)星形細(xì)胞瘤惡性進(jìn)展,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:星形細(xì)胞瘤惡性轉(zhuǎn)化包括腫瘤級別的進(jìn)展和亞型的轉(zhuǎn)化。目前已明確的星形細(xì)胞瘤分子標(biāo)記物與星形細(xì)胞瘤的惡性進(jìn)展并沒有明顯的相關(guān)性(如IDH1、TP53突變等)。為了尋找新的星形細(xì)胞瘤分子標(biāo)記物,我們收集了252例樣本:包括34例正常腦組織(NBT),136例II級星形細(xì)胞瘤(AII)和82例III級星形細(xì)胞瘤(AIII),每例樣本都檢測了mRNA的表達(dá)譜。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,17個隨著腫瘤級別進(jìn)展而表達(dá)升高的基因主要富集于EMT相關(guān)的信號通路。我們進(jìn)一步用128例膠質(zhì)瘤樣本的RNA測序數(shù)據(jù)進(jìn)行了驗(yàn)證。通過生存分析顯示,這些基因的高表達(dá)患者具有較差的預(yù)后。我們進(jìn)一步研究了TGFB1I1(轉(zhuǎn)化生長因子β1誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子1),這一基因的表達(dá)與WHO膠質(zhì)瘤分級密切相關(guān),進(jìn)一步通過實(shí)時熒光定量PCR對六個不同級別的膠質(zhì)瘤細(xì)胞系及49個獨(dú)立樣本進(jìn)行了驗(yàn)證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)高表達(dá)TGFB1I1與膠質(zhì)瘤亞型及EMT過程的激活密切相關(guān)。通過免疫組化進(jìn)一步證實(shí)了這一結(jié)論。體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)使用TGF-β1和TGFB1I1 shRNA進(jìn)一步證實(shí),TGFB1I1是TGF-β激活EMT過程所必須的分子,這一過程可以促進(jìn)星形細(xì)胞瘤的惡性進(jìn)展。
【關(guān)鍵詞】:膠質(zhì)瘤 星形細(xì)胞瘤 TGFB1I1 惡性進(jìn)展
【學(xué)位授予單位】:大連醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R739.4
【目錄】:
- 中文摘要7
- 英文摘要7-8
- (一)前言8-9
- (二)材料和方法9-18
- 1. 材料9-11
- 1.1 臨床樣本9-10
- 1.2 細(xì)胞系和試劑10
- 1.3 主要儀器10-11
- 2. 方法11-18
- 2.1 細(xì)胞培養(yǎng)11
- 2.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染11-12
- 2.3 總RNA提取及實(shí)時熒光定量PCR檢測基因表達(dá)水平變化12-14
- 2.4 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)14
- 2.5 Transwell細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)14-15
- 2.6 蛋白質(zhì)提取與檢測15-17
- 2.7 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)17-18
- 2.8 統(tǒng)計學(xué)處理18
- (三)結(jié)果18-26
- 1. 現(xiàn)有分子標(biāo)記物與級別進(jìn)展無相關(guān)性18-19
- 2. 在星形膠質(zhì)細(xì)胞瘤級別進(jìn)展過程中有統(tǒng)計學(xué)意義改變的基因19-21
- 3. 惡性進(jìn)展過程中的驅(qū)動基因與患者預(yù)后具有相關(guān)性21
- 4. RNA測序及qPCR驗(yàn)證差異基因21-22
- 5. 蛋白水平及轉(zhuǎn)錄水平驗(yàn)證TGFB1I1與級別進(jìn)展有相關(guān)性22-24
- 6. TFGB1I1參與TGF-β相關(guān)EMT發(fā)生過程24-26
- (四)討論26-28
- (五)結(jié)論28
- (六)參考文獻(xiàn)28-33
- 綜述33-40
- 參考文獻(xiàn)36-40
- 致謝40-41
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,本文編號:399063
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