癌癥是世界上威脅人類健康最主要的疾病之一,大量不同的癌癥形態(tài)限制了人們對(duì)癌癥的研究。泛癌分析旨在研究不同癌癥類型之間的相似性和差異性,通過聯(lián)合多種癌癥數(shù)據(jù),我們可以深入的了解癌癥細(xì)胞的起源以及致癌的過程,找到更加普適性的治療方法。代謝重編程是腫瘤轉(zhuǎn)化和發(fā)展的直接原因,從代謝角度對(duì)癌癥進(jìn)行分析對(duì)癌癥診斷和治療有著非常重要的意義。代謝網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)能夠有效地表征腫瘤細(xì)胞的內(nèi)部代謝狀態(tài),有助于系統(tǒng)的了解癌癥內(nèi)部工作機(jī)理,為生物實(shí)驗(yàn)以及藥物發(fā)現(xiàn)提供指導(dǎo)。本文采用代謝網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)的方法,從多角度多數(shù)據(jù)源分析起源于不同組織的腫瘤代謝特征,主要工作包括:（1）給出一種基于癌癥工作網(wǎng)絡(luò)的泛癌分析方法。癌癥工作網(wǎng)絡(luò)以癌癥高表達(dá)的核心反應(yīng)集為基礎(chǔ)構(gòu)建而成,反應(yīng)了腫瘤細(xì)胞的代謝狀態(tài)。實(shí)驗(yàn)得到了 27個(gè)癌癥共性傳輸反應(yīng)以及7個(gè)潛在的藥物靶標(biāo),其結(jié)果有助于了解癌癥的代謝共性。（2）給出一種基于差異代謝網(wǎng)絡(luò)的泛癌分析方法。癌癥差異代謝網(wǎng)絡(luò)以腫瘤細(xì)胞相對(duì)于癌旁組織細(xì)胞的差異表達(dá)基因?yàn)榛A(chǔ)構(gòu)建而成,削弱了組織代謝特征的影響,有利于提取癌癥相對(duì)正常組織細(xì)胞發(fā)生的代謝變化。實(shí)驗(yàn)得到17種癌癥的差異表達(dá)基因,反應(yīng)以及代謝通路。其結(jié)果... 

【文章來源】：中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 研究現(xiàn)狀
    1.3 本文主要工作
    1.4 內(nèi)容安排
第2章 基于工作網(wǎng)絡(luò)的泛癌分析方法
    2.1 背景及意義
    2.2 癌癥工作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
        2.2.1 基因表達(dá)數(shù)據(jù)預(yù)處理
        2.2.2 代謝網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)
    2.3 泛癌代謝分析
    2.4 本章小結(jié)
第3章 基于差異網(wǎng)絡(luò)的泛癌分析方法
    3.1 背景及意義
    3.2 差異代謝基因的提取及分析
        3.2.1 差異基因的提取
        3.2.2 差異基因的分析
    3.3 差異網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析
    3.4 本章小結(jié)
第4章 基于微陣列數(shù)據(jù)的泛癌分析方法
    4.1 背景及意義
    4.2 面向GEO的數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)
    4.3 基于微陣列數(shù)據(jù)的泛癌分析
        4.3.1 差異基因的提取及分析
        4.3.2 基于工作網(wǎng)絡(luò)的泛癌分析
    4.4 基于CNN的泛癌分析方法
        4.4.1 數(shù)據(jù)預(yù)處理
        4.4.2 模型結(jié)構(gòu)及訓(xùn)練
        4.4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    4.5 本章小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
    5.1 工作總結(jié)
    5.2 工作展望
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與取得的研究成果


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]ECA39 is a novel distant metastasis-related biomarker in colorectal cancer[J]. Reigetsu Yoshikawa,Hidenori Yanagi,Yoshinori Fujiwara,Masafumi Noda,Toshihiko Yagyu,Makoto Gega,Tsutomu Oshima,Takehira Yamamura,Haruki Okamura,Yoshiro Nakano,Tomonori Morinaga,Tomoko Hashimoto-Tamaoki.  World Journal of Gastroenterology. 2006(36)



本文編號(hào)：3149540