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攀枝花礦區(qū)4種常見植物內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-07-06 15:27

  本文關(guān)鍵詞:攀枝花礦區(qū)4種常見植物內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性研究


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【摘要】:為了了解攀枝花礦區(qū)常見植物內(nèi)生微生物的群落結(jié)構(gòu)和多樣性,采集攀枝花礦區(qū)四種常見植物牛筋草(Eleusine indica)、紫莖澤蘭(CroftonWeed)、劍麻(Agave sisalana)和花蔓草(Aptenia cordifolia),測定其生境土壤基本理化性質(zhì)、生境土壤和植物各器官重金屬濃度,并對4種植物各器官內(nèi)生細(xì)菌、真菌和放線菌進(jìn)行PCR-DGGE分析,旨在探索攀枝花礦區(qū)常見植物內(nèi)生微生物種類和分布特點(diǎn),為了解礦區(qū)植物內(nèi)生菌微生物資源,了解重金屬對內(nèi)生微生物的影響,以期為重金屬微生物修復(fù)、環(huán)境質(zhì)量評價(jià)提供一定的參考。本研究取得結(jié)果如下:(1)牛筋草內(nèi)生細(xì)菌的多樣性表現(xiàn)為葉莖根;紫莖澤蘭內(nèi)生細(xì)菌的多樣性表現(xiàn)為葉莖根;劍麻內(nèi)生細(xì)菌的多樣性表現(xiàn)為葉根莖;花蔓草內(nèi)生細(xì)菌的多樣性表現(xiàn)為根莖葉。各植物相互比較,牛筋草的各器官中的內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)豐富,花蔓草的內(nèi)生細(xì)菌較少。系統(tǒng)發(fā)育研究表明,攀枝花礦區(qū)植物內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)豐富,包括蒼白桿菌屬(Ochrobactrum)、藤黃色桿菌屬(Luteibacter)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、芽單胞菌屬(Gemmatimonadetes)、腸桿菌屬(Pantoea)、棲熱菌屬(Thermus)、丙酸菌屬(Propionibacterium)、紅球菌屬(Rhodococcus)等。(2)牛筋草內(nèi)生真菌的多樣性表現(xiàn)為根莖葉;紫莖澤蘭的莖內(nèi)生真菌的多樣性和根相近,葉最小;劍麻內(nèi)生真菌的多樣性表現(xiàn)為根莖葉;花蔓草內(nèi)生真菌的多樣性表現(xiàn)為根莖葉。綜合分析,牛筋草、劍麻和花蔓草這3種植物的內(nèi)生真菌根的多樣性最豐富,種群數(shù)量大,種類多。攀枝花礦區(qū)植物內(nèi)生真菌群落結(jié)構(gòu)豐富,包括莖點(diǎn)霉屬(Phoma)、和派倫屬(Peyronellaea)、鏈格孢屬(Alternaria)、Chaunopycnis屬、鐮刀菌屬(Fusarium)、枝孢屬(Cladosporium)、短柄霉屬(Aureobasidium)、曲霉屬(Aspergillus)、柄銹菌屬(Puccinia)等。(3)牛筋草內(nèi)生放線菌的多樣性表現(xiàn)為莖葉根;紫莖澤蘭內(nèi)生放線菌的多樣性表現(xiàn)為根葉莖;劍麻內(nèi)生放線菌的多樣性表現(xiàn)為根葉莖;花蔓草內(nèi)生放線菌的多樣性表現(xiàn)為莖葉根。攀枝花礦區(qū)植物內(nèi)生放線菌包含鏈霉菌屬(Streptomyces)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)以及不可培養(yǎng)放線菌(Uncultured actinobacterium),鏈霉菌屬的種類各異,不可培養(yǎng)放線菌類群之間有一定差異,攀枝花礦區(qū)植物具有可待挖掘的內(nèi)生放線菌資源。(4)典型相關(guān)分析表明,攀枝花礦區(qū)植物內(nèi)生細(xì)菌多樣性受Cu、Zn、As和Ni負(fù)向影響,其中Ni對它們的影響最大;在0.02 mg/kg≤Cr≤0.26 mg/kg,0.01 mg/kg≤Cd≤0.05 mg/kg范圍內(nèi),植物內(nèi)生細(xì)菌多樣性受Cr和Cd正向影響。在0.09mg/kg≤Cu≤0.26 mg/kg,0.11 mg/kg≤Pb≤0.53 mg/kg,0.02 mg/kg≤Cr≤0.26 mg/kg, 0.28 mg/kg≤Zn≤2.28 mg/kg,0.00 mg/kg≤As≤0.09 mg/kg范圍內(nèi),內(nèi)生真菌多樣性受Cu、Pb、Cr、Zn和As的正向影響,其中Cr的影響最大;植物內(nèi)生真菌多樣性受Ni和Cd的負(fù)向影響。在0.11 mg/kg≤Pb≤0.53 mg/kg范圍內(nèi),內(nèi)生放線菌多樣性受重金屬Pb的正向影響;礦區(qū)植物內(nèi)生放線菌多樣性受Cr、Cu、Cd、As和Ni的負(fù)向影響,其中Ni的影響最大,As次之,Zn的影響最小。
【關(guān)鍵詞】:攀枝花礦區(qū) 植物 內(nèi)生細(xì)菌 內(nèi)生真菌 內(nèi)生放線菌 PCR-DGGE
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:Q938
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 1 前言10-20
  • 1.1 植物內(nèi)生菌10
  • 1.2 植物內(nèi)生菌的研究概況10-12
  • 1.2.1 植物內(nèi)生細(xì)菌的研究概況10-11
  • 1.2.2 植物內(nèi)生放線菌的研究概況11
  • 1.2.3 植物內(nèi)生真菌的研究概況11-12
  • 1.3 內(nèi)生菌對宿主植物的作用12-13
  • 1.3.1 植物內(nèi)生菌對宿主植物的促生作用12
  • 1.3.2 植物內(nèi)生菌增強(qiáng)植物抗病害的能力12-13
  • 1.3.3 植物內(nèi)生菌增強(qiáng)宿主植物的抗逆能力13
  • 1.4 植物內(nèi)生菌的應(yīng)用13-15
  • 1.4.1 植物內(nèi)生細(xì)菌的應(yīng)用13-14
  • 1.4.2 植物內(nèi)生放線菌的應(yīng)用14-15
  • 1.4.3 植物內(nèi)生真菌的應(yīng)用15
  • 1.5 研究植物內(nèi)生菌的方法15-18
  • 1.5.1 傳統(tǒng)的可培養(yǎng)方法16
  • 1.5.2 可培養(yǎng)分子生物學(xué)方法16-17
  • 1.5.3 免培養(yǎng)分子生物學(xué)方法17-18
  • 1.6 典型相關(guān)分析18-19
  • 1.7 立題依據(jù)和研究的目的與意義19-20
  • 2 材料與方法20-26
  • 2.1 研究區(qū)域概況20
  • 2.2 樣品采集20-21
  • 2.3 供試引物21
  • 2.4 植物重金屬濃度及其生境土理化性質(zhì)和重金屬濃度的測定21
  • 2.5 表面消毒21-22
  • 2.6 提取總DNA22
  • 2.7 PCR擴(kuò)增22-23
  • 2.8 植物內(nèi)生菌變性梯度凝膠電泳(DGGE)23-24
  • 2.9 PCR-DGGE圖譜分析24
  • 2.10 數(shù)據(jù)處理24-25
  • 2.11 DGGE條帶測序與系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建25-26
  • 3 結(jié)果與分析26-49
  • 3.1 土壤理化分析26
  • 3.2 生境土及植物各器官重金屬濃度分析26-29
  • 3.3 內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析29-36
  • 3.3.1 內(nèi)生細(xì)菌DGGE圖譜分析29-30
  • 3.3.2 內(nèi)生細(xì)菌多樣性指數(shù)分析30-32
  • 3.3.3 重金屬含量與細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的典型相關(guān)分析32-33
  • 3.3.4 克隆條帶分析33-36
  • 3.4 內(nèi)生真菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析36-42
  • 3.4.1 內(nèi)生真菌DGGE圖譜分析36-37
  • 3.4.2 DGGE條帶多樣性指數(shù)、豐度和均勻度分析37-39
  • 3.4.3 重金屬含量與真菌群落結(jié)構(gòu)的典型相關(guān)分析39-40
  • 3.4.4 克隆條帶分析40-42
  • 3.5 內(nèi)生放線菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析42-49
  • 3.5.1 內(nèi)生放線菌DGGE圖譜分析42-44
  • 3.5.2 內(nèi)生放線菌多樣性指數(shù)分析44-45
  • 3.5.3 內(nèi)生放線菌群落結(jié)構(gòu)與重金屬濃度的典型相關(guān)分析45-46
  • 3.5.4 克隆條帶分析46-49
  • 4 討論與結(jié)論49-53
  • 4.1 討論49-52
  • 4.2 結(jié)論52-53
  • 5 研究展望53-54
  • 參考文獻(xiàn)54-62
  • 致謝62-63
  • 碩士期間發(fā)表的論文63

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