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實驗紅鯽標(biāo)準(zhǔn)化關(guān)鍵技術(shù)研究和轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時間:2024-04-18 06:18
  目的:1.根據(jù)實驗紅鯽標(biāo)準(zhǔn)化的要求,進(jìn)一步篩選和建立實驗紅鯽C1HD系微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記,并以此微衛(wèi)星標(biāo)記做種群遺傳純合度分析。2.根據(jù)實驗紅鯽標(biāo)準(zhǔn)化的要求,建立實驗紅鯽水族箱標(biāo)準(zhǔn)化飼養(yǎng)和繁殖的方法,并優(yōu)化用于實驗紅鯽近交系保種的雌核發(fā)育繁殖方法。3.為推廣實驗紅鯽應(yīng)用,探索實驗紅鯽用于核輻射生物效應(yīng)研究,篩選實驗紅鯽對核輻射敏感的miRNA生物標(biāo)志物。方法:1.利用紅鯽全基因組序列信息,采用生物信息學(xué)分析技術(shù)提取實驗紅鯽1-6個堿基重復(fù)序列的微衛(wèi)星DNA序列,使用primer 5設(shè)計引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳區(qū)分PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的目的片段,對其中特異性條帶進(jìn)行測序及驗證,并與其近緣物種(金魚、青鯽、雜交紅鯽及鯉魚等)進(jìn)行比較,篩選出實驗紅鯽C1HD系特異性的微衛(wèi)星分子標(biāo)記,并以此微衛(wèi)星標(biāo)記對實驗紅鯽C1HD系進(jìn)行雌核發(fā)育試驗種群的遺傳純合度分析。2.通過室內(nèi)水族箱與室外小魚池及水族箱不同水質(zhì)環(huán)境條件的比較研究,分析光照、仿生態(tài)造景、水流等綜合環(huán)境因素對實驗紅鯽生長發(fā)育和繁殖的影響,綜合比較實驗紅鯽不同實驗組合的養(yǎng)殖效果。設(shè)置5個室內(nèi)實驗組合及1個室外實驗組,分...

【文章頁數(shù)】:85 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.14號微衛(wèi)星位點Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4

圖2.14號微衛(wèi)星位點Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4

12圖2.14號微衛(wèi)星位點Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4注:圖a的泳道1-10號為實驗紅鯽,11號為marker,12-18號為琉金,19-23號為雜交紅鯽;圖b的泳道1-8號為實驗紅鯽,9號為marker,10-15號為洞庭湖鯽,16-21號為錦....


圖2.286號微衛(wèi)星位點Figure2.2ElectrophoresisofSSR-86

圖2.286號微衛(wèi)星位點Figure2.2ElectrophoresisofSSR-86

12圖2.14號微衛(wèi)星位點Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4注:圖a的泳道1-10號為實驗紅鯽,11號為marker,12-18號為琉金,19-23號為雜交紅鯽;圖b的泳道1-8號為實驗紅鯽,9號為marker,10-15號為洞庭湖鯽,16-21號為錦....


圖2.3434號微衛(wèi)星位點Figure2.3ElectrophoresisofSSR-434

圖2.3434號微衛(wèi)星位點Figure2.3ElectrophoresisofSSR-434

13鯉。Note:Inpicturea,Thelanes1-10arelaboratoryredcruciancarp,the11thisDNAmarker,the12-18aregoldfish,andthe19-24arehybridredcruciancarp;Inpict....


圖2.4基于UPGMA的Nei’s無偏差遺傳距離聚類樹

圖2.4基于UPGMA的Nei’s無偏差遺傳距離聚類樹

16表2.8Nei’s無偏差遺傳相似度與遺傳距離Table2.8Nei"sunbiasedgeneticsimilarityandgeneticdistance實驗魚實驗紅鯽琉金雜交紅鯽洞庭湖鯽錦鯉實驗紅鯽0.50820.61620.47980.1181琉金0.67690.775....



本文編號:3957542

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