眼斑蟋螽屬Ocellarnaca Gorochov,2004隸屬于直翅目Orthoptera沙螽總科Stenopelmatoidea蟋螽科Gryllacrididae蟋螽亞科Gryllacridinae。目前世界記錄14種,中國(guó)記錄10種。本研究基于形態(tài)分類(lèi)和分子界定的方法,進(jìn)一步確定該屬的物種界限,并基于COI、H3和ITS基因序列片段對(duì)該屬89個(gè)樣本進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系重建、分歧時(shí)間估計(jì)、Maxent模型預(yù)測(cè)和祖先分布區(qū)重建,得出如下結(jié)果:1.基于ABGD和jMOTU兩種分子界定方法的結(jié)果,中國(guó)眼斑蟋螽屬物種界定為8種（亞種）:角眼斑蟋螽、布氏眼斑蟋螽、短尾眼斑蟋螽、錐尾眼斑蟋螽、銹褐眼斑蟋螽和叉眼斑蟋螽的分類(lèi)地位均得到支持;峨眉眼斑蟋螽劃分為2個(gè)OTUs,建議將其作為峨眉眼斑蟋螽2亞種,即裂葉眼斑蟋螽Ocellarnaca emeiensis fissa ssp.nov.和峨眉眼斑蟋螽O.emeiensis emeiensis Li,Fang,Liu&Li,2014。2.基因組成和變異分析結(jié)果:COI基因和聯(lián)合基因序列片段具有AT偏向性,變異位點(diǎn)分別占序列總長(zhǎng)度的28.57%... 

【文章來(lái)源】： 李艷清 河北大學(xué)

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

中國(guó)眼斑蟋螽屬物種分布圖

河北大學(xué)碩士學(xué)位論文14表2-4PCR反應(yīng)體系Table2-4PCRreactionsystem反應(yīng)成分Reactioncomponents體積Volume（μL）DNA模板2引物F5引物R5primix25去離子水13COⅠ、H3和ITS基因片段擴(kuò)增程序如圖2-2所示。圖2-2COⅠ（A）、H3（B）和ITS（C）的擴(kuò)增程序Figure2-2AmplificationprogramofCOI(A),H3(B)andITS(C)2.2.1.4PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)及測(cè)序制備1.0%的檢測(cè)膠，每孔點(diǎn)樣3μL，于電流150mA，電壓120V的條件下電泳12min，置于凝膠成像系統(tǒng)中觀察并拍照。合格樣品送至北京金唯智生物科技有限公司回收并進(jìn)行Sanger測(cè)序。2.2.1.5序列數(shù)據(jù)編輯首先將公司雙向測(cè)序結(jié)果解壓，導(dǎo)入SeqMan軟件進(jìn)行拼接，同時(shí)借助序列的峰圖進(jìn)行人工手動(dòng)校正，結(jié)果輸出為.fas格式。隨后分別將COI基因序列和ITS基因序列導(dǎo)入Editseq軟件中翻譯，最終將翻譯通的序列保存為.txt文件。最后打開(kāi)BioEdit軟件進(jìn)行序列比對(duì)，刪除多余位點(diǎn)，將全部序列保存為.fas格式文件。2.2.2物種界定分析本研究應(yīng)用4種方法進(jìn)行物種界定分析：基于遺傳距離的分析方法：Automatic

第三章結(jié)果與討論23圖3-1基于COI基因jMOTU方法物種劃分結(jié)果Figure3-1ThepartitionresultsbyjMOTUmethodbasedonCOIgenefragmentjMOTU方法劃分結(jié)果與ABGD結(jié)果一致，詳見(jiàn)表3-3。銹褐眼斑蟋螽、布氏眼斑蟋螽、錐尾眼斑蟋螽、短尾眼斑蟋螽、叉眼斑蟋螽和角眼斑蟋螽均獨(dú)立形成MOTU，在形態(tài)分類(lèi)上鑒定為峨眉眼斑蟋螽的物種被分為2個(gè)MOTUs：采自云南紅河州和文山州的7個(gè)樣本聚為1個(gè)MOTU；采自其它地方的樣本聚為另1個(gè)MOTU。表3-3jMOTU基于COI基因片段對(duì)眼斑蟋螽屬物種劃分結(jié)果Table3-3ThepartitionresultsofOcellarnacabyjMOTUbasedontheCOIgenefragmentMOTUsNspeciesMOTU000121LYQ_001fus_GZLYQ_002fus_GZLYQ_003fus_HNLYQ_004fus_GDLYQ_005fus_GDLYQ_006fus_JXLYQ_007fus_JXLYQ_008fus_GXLYQ_056fus_JXLYQ_057fus_JXLYQ_068fus_CQLYQ_069fus_CQLYQ_070fus_YNLYQ_071fus_GXLYQ_072fus_GXLYQ_088fus_HNLYQ_089fus_HNLYQ_090fus_HNLYQ_091fus_HNLYQ_092fus_HNLYQ_093fus_HNMOTU000220LYQ_019eme_SCLYQ_034eme_GZLYQ_035eme_GDLYQ_036eme_GDLYQ_037eme_GXLYQ_038eme_GXLYQ_039eme_GXLYQ_040eme_GXLYQ_041eme_GXLYQ_042eme_GXLYQ_043eme_GXLYQ_047eme_SCLYQ_058eme_GXLYQ_059eme_GXLYQ_074eme_GXLYQ_075eme_GXLYQ_076eme_GXLYQ_077eme_GXLYQ_078eme_GXLYQ_079eme_GXMOTU000311LYQ_009con_HNLYQ_010con_HNLYQ_011con_HNLYQ_012con_HNLYQ_013con_HNLYQ_014con_HNLYQ_015con_HNLYQ_016con_HNLYQ_051con_HNLYQ_052con_HNLYQ_073con_HN

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]基于DNA條形碼的物種界定算法比較研究——以北京周邊地區(qū)舟蛾科為例[J]. 金倩,武春生,陳芬,羅桂杰,蔡衛(wèi)佳,劉旭,楊采青,郝夢(mèng)迪,張愛(ài)兵.  應(yīng)用昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2017 (01)
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碩士論文
[1]中國(guó)蟋螽亞科分類(lèi)研究(直翅目,蟋螽科)[D]. 李苗苗.華東師范大學(xué) 2015



本文編號(hào)：2921528