【摘要】：本論文以分離自南海和北極海域表層海水樣品的四株細(xì)菌作為研究對象,利用多相分類方法,詳細(xì)研究了這四株細(xì)菌的表型,細(xì)胞化學(xué)組成及分子遺傳學(xué)等方面的分類特征,最終基于分類特征分析分別確定了它們的分類地位。1.菌株SM1501~T的多相分類研究菌株SM1501~T分離自南海表層海水樣品。菌株SM1501~T的革蘭氏染色反應(yīng)為陰性,其細(xì)胞為短桿狀,無鞭毛,好氧。該菌株生長的溫度范圍為7-42℃,生長的NaCl濃度范圍是0-11%(w/v)。菌株SM1501~T的主要脂肪酸是C17:1ω6c,C15:0 2-OH,C17:1ω8c和C18:1ω7c。該菌的極性脂包括磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG),鞘糖脂(sphingoglycolipid,SGL),雙磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)及磷脂酰膽堿(phosphatidylcholine,PC)。該菌的主要細(xì)胞呼吸醌是泛醌10(ubiquinone-10,Q-10)。菌株 SM1501~T 的細(xì)胞基因組 DNA G+C 含量為 66.8 mol%。菌株SM1501~T與Erythrobacter屬成員的16S rRNA基因序列相似性最高(94.2-97.4%),基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示菌株SM1501~T與Erythrobacter luteus,Erythrobacter atlanticus,Erythrobacter gangjinensis 及Erythrobacter marinus成簇,但形成一個(gè)獨(dú)立的進(jìn)化分支�；谝陨隙嘞喾诸悓W(xué)數(shù)據(jù),菌株SM1501~T代表Erythrobacter屬的一個(gè)新種,命名為Erythrobacternanhaiensis sp.nov.,菌株 SM1501~T(= KCTC 42669T=CCTCCAB2015396T)為該新種的模式菌株。2.菌株SM1502~T的多相分類研究菌株SM1502~T來源于北極海域表層海水樣品。菌株SM1502~T革蘭氏陰性菌,細(xì)胞為桿狀,無鞭毛。菌株SM1502~T生長的溫度范圍為10-40℃,生長的NaCl濃度范圍為0-8.0%(w/v)。菌株 SM1502~T 的主要脂肪酸為 iso-C15:0,iso-C17:1ω9c,iso-C17:0 3-OH,iso-C15:1 G,C15:0及unknown ECL 13.565;其主要極性脂為磷脂酰乙醇胺(PE),一種未鑒定結(jié)構(gòu)的氨基磷脂及一種未鑒定結(jié)構(gòu)的極性脂類。菌株SM1502~T的主要呼吸醌類為甲基萘醌6(menaquinone 6,MK-6)。菌株SM1502~T基因組DNA的G+C含量為37.0 mol%。菌株 SM1502~T 與Flavobacterium suzhouense的16S rRNA 基因序列相似性最高(96.0%);在基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹中,菌株SM1502~T和Flavobacterium屬內(nèi)包括Flavobacterium suzhouense在內(nèi)的六個(gè)已知種成簇,同時(shí)形成單獨(dú)的簇內(nèi)分支。以上多相分類數(shù)據(jù)表明,菌株SM1502~T代表Flavobacterium屬內(nèi)的一個(gè)新種,命名為 Flavobacterium arcticum sp.nov.,菌株 SM1502~T(=KCTC 42668T=CCTCC AB 2015346T)為該種的模式菌株。3.菌株SM1503~T的多相分類研究菌株SM1503~T分離自南海表層海水樣品,為革蘭氏陰性菌,其觸酶及氧化酶為陽性。菌株SM1503~T生長溫度范圍在8-45℃之間,生長的NaCl濃度范圍是0-7.5%(w/v)。菌株SM1503~T可以還原硝酸鹽為亞硝酸鹽,可水解Tween 20、40及60。菌株 SM1503~T 的主要脂肪酸包含 C17:1ω6c,C17:0,C15:0,C18:1ω7c,C17:1ω8c以及C16:o;主要極性脂為磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG),雙磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG),鞘糖脂(sphingoglycolipid,SGL)和磷脂酰膽堿(phosphatidylcholine,PC)。該菌主要呼吸醌為泛醌10(ubiquinone-10,Q-10),其基因組DNA的G+C 含量為 61.6 mol%。16S rRNA基因序列比對分析表明菌株SM1503~T與Sphingomonadaceae科內(nèi)Blastomonas及Parablastomonas屬已知種有最高的序列相似性(95.2-95.8%),根據(jù)16S rRNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示菌株SM1503~T在Blastomona及Parablastomonas進(jìn)化分支的根部形成一個(gè)獨(dú)立的進(jìn)化分枝。上述多相分類數(shù)據(jù)表明,菌株SM1503~T應(yīng)屬于Sphingomonadaceae科內(nèi)的一個(gè)新屬,命名為Pseudoblastomonasgen.nov.,而菌株SM1503~T表該屬內(nèi)的一個(gè)新種,命名為Pseudoblastomonas maris gen.nov.,sp.nov.,菌株 SM1503~T(=KCTC 42715T = CCTCC AB 2015347T)是該新種的模式菌株。4.菌株SM1504~T的多相分類研究菌株SM1504~T來源于北極海域表層海水樣品。菌株SM1504~T革蘭氏陰性菌,嚴(yán)格好氧,無運(yùn)動(dòng)性。菌株SM1504~T生長的溫度范圍為4-30℃,生長的NaCl濃度范圍為0-4.0%(w/v)。菌株SM1504~T可水解七葉苷和明膠,但不能還原硝酸鹽為亞硝酸鹽。菌株 SM1504~T 的主要脂肪酸為 summed feature 3(包含 C16:1ω7c 和/或 iso-C15:02-OH)和iso-C15:0;菌株SM1504~T的極性脂為磷脂酰乙醇胺(PE)和一種未鑒定的極性脂類。菌株SM1504~T的主要呼吸醌類為甲基萘醌7(menaquinone 7,MK-7)。菌株SM1504~T基因組DNAG+C含量為40.8mol%。基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示菌株S]M1504T在Cytophagaceae科內(nèi)與 Lacihabitans,Emticicia,Fluviimonas 及 Leadbetterella 屬成員緊密成簇,但形成獨(dú)立的簇內(nèi)分枝,而該菌株與這些屬成員的16SrRNA基因序列相似性非常低(88.9-91.6%)。基于上述多相分類數(shù)據(jù)分析,菌株SM1504~T應(yīng)隸屬于Cytophagaceae科內(nèi)的一個(gè)新屬,命名為Arcticibacteriumgen.nov.,而菌株SM1504~T代表該新屬內(nèi)的一個(gè)新種,命名為Arcticibacterium lutifluviistationis gen.nov.,sp.nov.,菌株SM1504r(=KCTC42716~T=CCTCCAB2015348~T)為該種的模式菌株。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：山東大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：Q93

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本文編號：2267019