中國鼠傳巴爾通體遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析
本文選題:巴爾通體 + 嚙齒動(dòng)物; 參考:《山東大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:目的:調(diào)查了解巴爾通體在中國不同地區(qū)嚙齒類動(dòng)物中的種群分布及流行特征,并研究鼠傳巴爾通體在中國的遺傳多樣性及其系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化關(guān)系,為預(yù)防和控制巴爾通體的人間感染提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。方法:1.本研究依據(jù)中國動(dòng)物地理區(qū)劃選取采樣點(diǎn),采用夾夜法捕捉嚙齒類動(dòng)物后無菌取其脾臟組織,在-80℃冰箱冷凍保存。2.將所采集的各脾臟組織樣品在嚴(yán)格無菌條件下剪取綠豆粒大小于單管中制成勻漿,接種后的培養(yǎng)基置于培養(yǎng)箱中培養(yǎng),調(diào)節(jié)培養(yǎng)箱內(nèi)二氧化碳濃度為5%,溫度為35℃。胰蛋白大豆瓊脂培養(yǎng)基中混有5%脫纖維羊血。巴爾通體屬的特異性基因枸櫞酸合成酶基因(gltA)長度大小約為379bp;挑取巴爾通體的疑似菌落,PCR擴(kuò)增該目的基因片段。依據(jù)瓊脂糖凝膠電泳條帶大小判斷陽性菌株并進(jìn)一步擴(kuò)增其16SrRNA、細(xì)胞分裂蛋白基因(ftsZ)、RNA聚合酶亞單位基因(rpoB),將它們的擴(kuò)增產(chǎn)物提交公司并進(jìn)行基因測序。3.對所測gltA、16S rRNA、ftsZ、rpoB基因序列利用NCBI中的BLAST軟件進(jìn)行同源性比對,并利用MEGA7.0.21軟件,采用多位點(diǎn)序列分析(Multilocus Sequence Analysis)對gltA、ftsZ、rpoB基因序列進(jìn)行多重比對并進(jìn)行人工校正,然后通過鄰近法(Neighbor-joining Method)與最大似然法(Maximum LikelihoodMethod)構(gòu)建分子系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化關(guān)系。4.核苷酸及單倍型多樣性分析采用DnaSP 5.10.01軟件進(jìn)行。結(jié)果:1.本研究共采集2826份嚙齒類動(dòng)物脾臟組織樣品,涉及全國15個(gè)省市地區(qū),檢測結(jié)果顯示,757份樣品中存在巴爾通體感染,總感染率為26.79%(757/2826)。所測陽性樣品隸屬于3目,共9個(gè)科25個(gè)屬62個(gè)種,不同種類的嚙齒類動(dòng)物的感染率不同。此外,不同調(diào)查地區(qū)有巴爾通體感染的嚙齒類動(dòng)物種類也不盡相同。2.各調(diào)查地區(qū)嚙齒類動(dòng)物的巴爾通體感染率存在差異,且不同調(diào)查地區(qū)分離到的巴爾通體基因型存在差異。其中格拉漢姆巴爾通體基因型分布于每個(gè)調(diào)查地區(qū);除山西省與海南省外,其他調(diào)查地區(qū)都分離出2種及以上的巴爾通體基因型。3.序列的同源性以及遺傳進(jìn)化分析表明,所測嚙齒類動(dòng)物中主要存在12種巴爾通體基因型,即泰勒巴爾通體(B.taylorii)、格拉漢姆巴爾通體(B.grahamii).伊麗莎白巴爾通體(B.elizabethae)、日本巴爾通體(B.japonica)、特利波契巴爾通體(B.tribocrum)、森林巴爾通體(B.silvatica)、昆州巴爾通體(B.queenslandensis)、非洲跳鼠巴爾通體(B.jauli)、菲西巴爾通體(B.phoceensis)、黑瞎子巴爾通體(B.heixiaziensiB.馬賽巴爾通體(B.rattimassiliensis)B.washoensis。結(jié)論:本研究調(diào)查發(fā)現(xiàn)巴爾通體在中國不同地區(qū)的多種嚙齒類動(dòng)物中存在感染,分布在廣泛的地理環(huán)境中及具有宿主多樣性特征;同時(shí),遺傳進(jìn)化分析顯示中國鼠傳巴爾通體具有豐富的遺傳多樣性且可能有新種存在。由于嚙齒類動(dòng)物數(shù)量多、分布廣且人居關(guān)系密切,其巴爾通體感染狀況對人類巴爾通體病的發(fā)生有直接影響,因此進(jìn)一步加強(qiáng)次類動(dòng)物中巴爾通體感染狀況的監(jiān)測和研究意義重大。
[Abstract]:Objective : To investigate the population distribution and epidemic characteristics of Bartonella in rodents in different regions of China , and to study the genetic diversity and phylogenetic relationship of Bartonella in China . Conclusion : In this study , it has been found that there are many kinds of rodents in different parts of China . The results show that there are abundant genetic diversity and there may be new species in B. jauli , B . phoceensis , B . jauli , B . phoceensis , B .
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S852.61
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號:2014393
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